More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0634 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  100 
 
 
299 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  76.59 
 
 
299 aa  477  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  57.53 
 
 
299 aa  368  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  57.09 
 
 
299 aa  357  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  57.09 
 
 
299 aa  357  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  48.66 
 
 
298 aa  300  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  47.8 
 
 
294 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  47.46 
 
 
294 aa  281  9e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  47.46 
 
 
294 aa  280  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 
294 aa  279  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  47.12 
 
 
294 aa  279  4e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  46.78 
 
 
303 aa  278  9e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  46.78 
 
 
303 aa  277  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  46.78 
 
 
303 aa  277  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  46.49 
 
 
294 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  47.12 
 
 
294 aa  276  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  47.46 
 
 
303 aa  276  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  46.46 
 
 
309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  40.14 
 
 
309 aa  260  3e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  43.43 
 
 
294 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  44.03 
 
 
305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  43.19 
 
 
309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  39.86 
 
 
305 aa  251  8.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  38.91 
 
 
297 aa  251  1e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  41.22 
 
 
296 aa  249  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  41.22 
 
 
296 aa  249  5e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.84 
 
 
326 aa  248  6e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  40.55 
 
 
295 aa  248  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  41.08 
 
 
321 aa  247  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  39.53 
 
 
319 aa  245  6e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  40.19 
 
 
312 aa  245  6.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39.66 
 
 
309 aa  245  8e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  40.2 
 
 
309 aa  243  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  38.33 
 
 
304 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  41.78 
 
 
406 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  37.42 
 
 
309 aa  235  8e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  42.09 
 
 
326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  37.92 
 
 
303 aa  232  7.000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  38.26 
 
 
308 aa  231  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  37.33 
 
 
298 aa  230  2e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  39.93 
 
 
307 aa  230  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  36.64 
 
 
298 aa  229  5e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  38.26 
 
 
298 aa  229  5e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  39.93 
 
 
290 aa  226  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  39.25 
 
 
293 aa  226  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  38.44 
 
 
300 aa  225  7e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  36.3 
 
 
298 aa  224  1e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  39.45 
 
 
341 aa  223  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  38.57 
 
 
301 aa  222  6e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  38.75 
 
 
317 aa  222  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  38.49 
 
 
298 aa  222  8e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  38.14 
 
 
291 aa  219  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  38.36 
 
 
292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  38.01 
 
 
303 aa  219  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  38.23 
 
 
305 aa  215  7e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  36.73 
 
 
296 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  36.43 
 
 
318 aa  212  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  38.95 
 
 
315 aa  210  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  37.2 
 
 
292 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  36.64 
 
 
293 aa  205  9e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  35.86 
 
 
294 aa  202  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  36.55 
 
 
297 aa  202  8e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  37.33 
 
 
305 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  37.42 
 
 
315 aa  199  3e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  42.25 
 
 
266 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  35.4 
 
 
316 aa  198  7.999999999999999e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  34.92 
 
 
318 aa  193  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  36.46 
 
 
294 aa  189  5.999999999999999e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3577  ABC transporter related  34.48 
 
 
305 aa  182  7e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  39.83 
 
 
251 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  40.83 
 
 
279 aa  179  7e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.55 
 
 
305 aa  175  6e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  33.77 
 
 
317 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  40 
 
 
241 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  32.89 
 
 
309 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  38.65 
 
 
329 aa  170  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  41.98 
 
 
253 aa  169  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  41.2 
 
 
250 aa  169  6e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  34.77 
 
 
308 aa  168  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  30 
 
 
312 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  32.68 
 
 
316 aa  167  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  42.99 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.33 
 
 
312 aa  166  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  33.11 
 
 
305 aa  166  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  33.44 
 
 
305 aa  166  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  36.51 
 
 
308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3287  ABC transporter related protein  42.27 
 
 
261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  36.61 
 
 
293 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2113  ABC transporter related  37.27 
 
 
303 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  35.1 
 
 
304 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  33.78 
 
 
303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  31.49 
 
 
314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  32.78 
 
 
298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07170  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.23 
 
 
256 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143642  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  36.43 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  37.73 
 
 
259 aa  163  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  31.23 
 
 
308 aa  163  3e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  38.67 
 
 
912 aa  162  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  35.29 
 
 
308 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  35.53 
 
 
243 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>