More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1561 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
312 aa  632  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  57.57 
 
 
306 aa  357  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  57.24 
 
 
307 aa  353  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  55.56 
 
 
307 aa  341  7e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.61 
 
 
307 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  54.75 
 
 
323 aa  334  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  52.6 
 
 
308 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  49.67 
 
 
306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  51.15 
 
 
308 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  60.81 
 
 
240 aa  274  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  44.66 
 
 
308 aa  248  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  41.56 
 
 
325 aa  242  7e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  37.62 
 
 
308 aa  236  3e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  46.22 
 
 
303 aa  236  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  40.44 
 
 
315 aa  235  7e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  54.05 
 
 
261 aa  235  7e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  48.64 
 
 
235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  39.62 
 
 
331 aa  229  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  39.87 
 
 
311 aa  228  7e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2909  ABC transporter related  55.45 
 
 
245 aa  228  7e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  39.94 
 
 
369 aa  228  8e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  39.75 
 
 
317 aa  227  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  41.23 
 
 
305 aa  226  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  49.54 
 
 
236 aa  227  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  43.75 
 
 
310 aa  226  4e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  38.91 
 
 
360 aa  224  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  37.78 
 
 
316 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  39.1 
 
 
344 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  38.89 
 
 
329 aa  222  8e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  45.53 
 
 
320 aa  221  9e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  45.53 
 
 
320 aa  221  9e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  39.68 
 
 
328 aa  221  9e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  39.6 
 
 
316 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  38.14 
 
 
319 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  49.54 
 
 
315 aa  220  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  40.66 
 
 
314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  40.45 
 
 
339 aa  218  7e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  46.4 
 
 
299 aa  217  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  41.58 
 
 
310 aa  216  4e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  37.12 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.4 
 
 
301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  39.93 
 
 
322 aa  212  5.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  38.91 
 
 
331 aa  211  9e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  40.07 
 
 
317 aa  210  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  37.26 
 
 
311 aa  210  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  40.86 
 
 
317 aa  209  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  37.18 
 
 
336 aa  200  3e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  42.52 
 
 
309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  37.5 
 
 
324 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  43.24 
 
 
298 aa  198  7.999999999999999e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  38.83 
 
 
341 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  41.44 
 
 
580 aa  192  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  41.44 
 
 
580 aa  192  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  36.36 
 
 
309 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  37.65 
 
 
308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  40 
 
 
301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  43.61 
 
 
308 aa  189  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  35.83 
 
 
320 aa  189  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  36.1 
 
 
314 aa  188  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  36.81 
 
 
303 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 
309 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  43.11 
 
 
578 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  44.17 
 
 
247 aa  186  4e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  39.91 
 
 
582 aa  186  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  40.45 
 
 
576 aa  185  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  41.89 
 
 
581 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  36.54 
 
 
317 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  39.57 
 
 
585 aa  182  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1357  ABC transporter related  34.3 
 
 
309 aa  182  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  40 
 
 
583 aa  182  8.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  41.89 
 
 
585 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  43.93 
 
 
594 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  43.38 
 
 
590 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  39.23 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  33.87 
 
 
309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  42.47 
 
 
575 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  34.63 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  39.91 
 
 
580 aa  179  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  41.89 
 
 
582 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  39.46 
 
 
579 aa  179  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  43.38 
 
 
590 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 
308 aa  179  4.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  39.46 
 
 
578 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  39.46 
 
 
578 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  39.46 
 
 
578 aa  178  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  39.46 
 
 
578 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  39.46 
 
 
578 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  39.46 
 
 
578 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  39.46 
 
 
578 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  35.96 
 
 
298 aa  178  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0988  ABC transporter related  31.7 
 
 
327 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.037196 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  41.63 
 
 
576 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  39.46 
 
 
578 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  39.46 
 
 
578 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  35.37 
 
 
310 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1956  ABC transporter related protein  40.83 
 
 
240 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00584741  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  38.84 
 
 
253 aa  177  2e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  40.85 
 
 
296 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  34.74 
 
 
309 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  42.01 
 
 
316 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>