More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0376 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  100 
 
 
339 aa  691    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  53.25 
 
 
311 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  49.68 
 
 
317 aa  295  9e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  45.42 
 
 
308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  41.72 
 
 
316 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  42.02 
 
 
320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  42.02 
 
 
320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  49.33 
 
 
306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  44.04 
 
 
314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  42.26 
 
 
307 aa  233  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  43.79 
 
 
329 aa  232  8.000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  49.56 
 
 
240 aa  229  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  41.53 
 
 
328 aa  229  5e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  43.75 
 
 
306 aa  229  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  41.27 
 
 
331 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  41.97 
 
 
319 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  38.94 
 
 
299 aa  227  2e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  42.72 
 
 
317 aa  226  6e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  39.05 
 
 
325 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  37.46 
 
 
308 aa  222  9e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.35 
 
 
307 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  38.94 
 
 
298 aa  221  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  39.02 
 
 
308 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  40.45 
 
 
312 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  50.92 
 
 
344 aa  218  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  41.8 
 
 
315 aa  218  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.01 
 
 
301 aa  218  1e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  38.69 
 
 
308 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  47.27 
 
 
303 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  51.14 
 
 
322 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  38.91 
 
 
311 aa  215  8e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  41.69 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  37.5 
 
 
305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  38.59 
 
 
360 aa  213  3.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  41.25 
 
 
310 aa  212  9e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  40.7 
 
 
369 aa  209  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  43.64 
 
 
336 aa  209  8e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  44.35 
 
 
317 aa  208  9e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  44.14 
 
 
236 aa  208  9e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  42.52 
 
 
323 aa  208  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  42.52 
 
 
309 aa  207  2e-52  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  38.03 
 
 
305 aa  207  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  46.29 
 
 
261 aa  205  7e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  45.25 
 
 
315 aa  205  8e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  43.56 
 
 
310 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  38.34 
 
 
317 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  36.93 
 
 
316 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  37.99 
 
 
331 aa  200  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  44.29 
 
 
235 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  36.04 
 
 
314 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  35.69 
 
 
309 aa  193  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2909  ABC transporter related  44.59 
 
 
245 aa  193  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  36.57 
 
 
316 aa  193  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  37.46 
 
 
309 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  36.88 
 
 
325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  47.49 
 
 
247 aa  188  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  33.54 
 
 
337 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  45.41 
 
 
341 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  37.91 
 
 
309 aa  185  8e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  34.45 
 
 
305 aa  183  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  34.29 
 
 
316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  33.67 
 
 
303 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  41.26 
 
 
306 aa  181  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
341 aa  179  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  34.08 
 
 
318 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  41.07 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  32.57 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1281  ABC transporter related  33.33 
 
 
300 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  32.24 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.57 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  32.57 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  32.57 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  37.27 
 
 
295 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  39.8 
 
 
302 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  32.24 
 
 
303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  32.2 
 
 
321 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  31.58 
 
 
303 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  33.67 
 
 
297 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1274  ABC transporter ATP-binding protein  33 
 
 
300 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  33 
 
 
300 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  33.99 
 
 
318 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  34.09 
 
 
317 aa  172  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  34.31 
 
 
301 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1248  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  33 
 
 
300 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  37.84 
 
 
308 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  35.08 
 
 
305 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1517  ABC transporter, ATP-binding protein  33 
 
 
300 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  40.65 
 
 
307 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  37.78 
 
 
298 aa  171  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1357  ABC transporter related  33.12 
 
 
309 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  38.46 
 
 
319 aa  170  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.6 
 
 
309 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  36.25 
 
 
326 aa  169  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1448  ABC transporter, ATP-binding protein  32.67 
 
 
300 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000281318 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  41.44 
 
 
332 aa  169  7e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1475  ABC transporter, ATP-binding protein  32.67 
 
 
300 aa  169  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  32.25 
 
 
303 aa  169  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.77 
 
 
309 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3933  ABC transporter, ATP-binding protein  33 
 
 
300 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  32.58 
 
 
315 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>