More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3073 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  100 
 
 		 307 aa  622  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  81.97 
 
 		 306 aa  502  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.16 
 
 		 307 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  74.84 
 
 		 307 aa  477  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  59.87 
 
 		 308 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  59.54 
 
 		 308 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  58.94 
 
 		 306 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  57.24 
 
 		 312 aa  353  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  57.01 
 
 		 323 aa  342  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  48.21 
 
 		 308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  55.86 
 
 		 240 aa  265  8.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  42.01 
 
 		 315 aa  255  8e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  43.69 
 
 		 369 aa  252  7e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  41.21 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  40.73 
 
 		 308 aa  248  1e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  40.89 
 
 		 325 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  43.73 
 
 		 311 aa  245  6e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  41.32 
 
 		 331 aa  245  6e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  41.14 
 
 		 360 aa  245  6e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  40.94 
 
 		 320 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  40.94 
 
 		 320 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  42.3 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  51.82 
 
 		 235 aa  240  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  40.63 
 
 		 328 aa  238  5.999999999999999e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  43.65 
 
 		 311 aa  238  6.999999999999999e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  41.06 
 
 		 305 aa  238  6.999999999999999e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2909  ABC transporter related  57.27 
 
 		 245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  46.03 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  50.43 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  42.26 
 
 		 339 aa  233  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  40.53 
 
 		 299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  40.06 
 
 		 316 aa  232  5e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  45.45 
 
 		 317 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  39.29 
 
 		 310 aa  230  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  51.38 
 
 		 315 aa  229  4e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  41.25 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  41.07 
 
 		 344 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  40.33 
 
 		 329 aa  225  7e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  41.35 
 
 		 316 aa  225  7e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  37.42 
 
 		 298 aa  223  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  49.54 
 
 		 236 aa  223  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  40.98 
 
 		 322 aa  222  6e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.54 
 
 		 301 aa  219  6e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  41.06 
 
 		 310 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  40.54 
 
 		 317 aa  210  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 		 317 aa  207  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  41.87 
 
 		 336 aa  204  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  36.94 
 
 		 331 aa  203  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  42.06 
 
 		 309 aa  202  6e-51  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  38.31 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  37.58 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  39.17 
 
 		 341 aa  200  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  36.18 
 
 		 314 aa  198  9e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  46.95 
 
 		 247 aa  194  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  40.94 
 
 		 327 aa  191  9e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 1171 aa  191  9e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  38.51 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  34.42 
 
 		 308 aa  188  8e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  36.09 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  41.52 
 
 		 253 aa  186  6e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  36.74 
 
 		 317 aa  186  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  37.45 
 
 		 583 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  33.13 
 
 		 328 aa  183  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  40.71 
 
 		 304 aa  182  6e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  41.18 
 
 		 255 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  35.86 
 
 		 324 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  39.01 
 
 		 582 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  34.18 
 
 		 321 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  41.4 
 
 		 590 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  38.02 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  34.98 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  42.01 
 
 		 594 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  35.76 
 
 		 301 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  35.22 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  36.13 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  40.99 
 
 		 582 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  34.44 
 
 		 337 aa  179  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  41.4 
 
 		 590 aa  179  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  38.64 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  40.43 
 
 		 356 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  35.1 
 
 		 320 aa  179  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  33.77 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  40.09 
 
 		 581 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  36.07 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  32.78 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  37.08 
 
 		 578 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  40.54 
 
 		 585 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  39.47 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  33.22 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  41.99 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  32.89 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  35.14 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  38.71 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  39.38 
 
 		 578 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  32.89 
 
 		 312 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  32.89 
 
 		 312 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  37.08 
 
 		 578 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  37.08 
 
 		 578 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  42.2 
 
 		 350 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  37.08 
 
 		 578 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>