More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3051 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  100 
 
 
309 aa  640    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  56.68 
 
 
308 aa  398  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  55.99 
 
 
314 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1357  ABC transporter related  56.96 
 
 
309 aa  362  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  42.05 
 
 
317 aa  275  7e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 
314 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  43.75 
 
 
310 aa  268  7e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  40.26 
 
 
369 aa  239  5e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  40 
 
 
344 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  37.91 
 
 
308 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  38.02 
 
 
331 aa  223  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  41.63 
 
 
317 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  39.55 
 
 
360 aa  218  7e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  35.71 
 
 
336 aa  217  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  37.1 
 
 
315 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  34.33 
 
 
308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  36.22 
 
 
315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  36.45 
 
 
328 aa  209  5e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  36.93 
 
 
322 aa  209  6e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  37.34 
 
 
319 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  36.63 
 
 
305 aa  208  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  37.78 
 
 
331 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  38.02 
 
 
320 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  38.02 
 
 
320 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  33.88 
 
 
310 aa  205  7e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  36.39 
 
 
305 aa  202  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  43.44 
 
 
247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  37.58 
 
 
307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  35.86 
 
 
325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  34.2 
 
 
325 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  33.02 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  34.87 
 
 
299 aa  195  7e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  38.16 
 
 
306 aa  195  8.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  35.67 
 
 
311 aa  194  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  35.41 
 
 
329 aa  194  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  35.69 
 
 
339 aa  193  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  33.76 
 
 
311 aa  193  3e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  34.77 
 
 
298 aa  192  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  33.88 
 
 
316 aa  192  6e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.39 
 
 
307 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  43.46 
 
 
240 aa  191  9e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  41.67 
 
 
236 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  34.88 
 
 
323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  34.43 
 
 
303 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.43 
 
 
301 aa  187  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  41.18 
 
 
261 aa  186  6e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  34.42 
 
 
317 aa  185  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  34.74 
 
 
307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  37.55 
 
 
317 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  37.5 
 
 
289 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  38.32 
 
 
306 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  33.87 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  33.76 
 
 
341 aa  178  9e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  38.36 
 
 
235 aa  176  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  32.57 
 
 
308 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0454  ABC transporter related  40.45 
 
 
251 aa  172  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  32.04 
 
 
308 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  39.71 
 
 
284 aa  170  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  35.43 
 
 
286 aa  170  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  32.15 
 
 
309 aa  170  3e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  36.74 
 
 
296 aa  169  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  28.53 
 
 
319 aa  169  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  37.08 
 
 
290 aa  167  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  30.52 
 
 
308 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1168  ABC transporter related protein  33.21 
 
 
288 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.03 
 
 
299 aa  163  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  29.07 
 
 
316 aa  162  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1671  ABC transporter related  29.26 
 
 
316 aa  162  7e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  29.87 
 
 
317 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  33.62 
 
 
328 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1076  ABC transporter related  31.22 
 
 
301 aa  160  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  29.77 
 
 
309 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  35.68 
 
 
293 aa  159  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  35.21 
 
 
295 aa  160  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
286 aa  159  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  33.03 
 
 
321 aa  159  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  36.97 
 
 
316 aa  156  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  38.46 
 
 
326 aa  156  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  31 
 
 
328 aa  156  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  36.45 
 
 
307 aa  155  8e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.6 
 
 
312 aa  155  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  33.05 
 
 
308 aa  155  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  28.66 
 
 
337 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  29.58 
 
 
312 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.56 
 
 
331 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  29.58 
 
 
312 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  34.47 
 
 
303 aa  154  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  31.76 
 
 
316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  34.42 
 
 
295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30 
 
 
305 aa  153  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  29.62 
 
 
312 aa  152  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  29.62 
 
 
312 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  29.26 
 
 
312 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  35.81 
 
 
244 aa  152  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  37.1 
 
 
303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  33.64 
 
 
308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  29.62 
 
 
312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  37.1 
 
 
303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  29.62 
 
 
312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  37.1 
 
 
331 aa  152  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>