More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1357 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1357  ABC transporter related  100 
 
 		 309 aa  643    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  62.46 
 
 		 314 aa  415  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  59.74 
 
 		 308 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  56.96 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  43.71 
 
 		 317 aa  281  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  43.42 
 
 		 310 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  40.86 
 
 		 314 aa  259  4e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  37.17 
 
 		 331 aa  224  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  35 
 
 		 308 aa  215  7e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  35.76 
 
 		 305 aa  209  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  35.37 
 
 		 369 aa  202  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  35.39 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  43.18 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  35.05 
 
 		 360 aa  196  5.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  33.99 
 
 		 322 aa  195  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  42.27 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.65 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  35.79 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  33.02 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  34.08 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  33.66 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  34.54 
 
 		 316 aa  189  5e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  33.76 
 
 		 344 aa  188  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  36.31 
 
 		 320 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  36.31 
 
 		 320 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  34.3 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  33.45 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  39.35 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  38.58 
 
 		 319 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  33 
 
 		 310 aa  186  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  33.45 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 307 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  32.01 
 
 		 299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  42.2 
 
 		 247 aa  182  7e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  32.69 
 
 		 341 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  40.19 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  34.62 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  34.71 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  33.44 
 
 		 306 aa  179  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  31.68 
 
 		 308 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  41.67 
 
 		 328 aa  178  8e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  42.33 
 
 		 240 aa  178  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  33.67 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  31.89 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  34.75 
 
 		 329 aa  177  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  31.44 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  32.14 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  33.12 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  31.85 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  37.61 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.45 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  37.9 
 
 		 235 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  39.32 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  32.9 
 
 		 323 aa  168  9e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  37.34 
 
 		 317 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  34.46 
 
 		 309 aa  165  6.9999999999999995e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  30.79 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  30.46 
 
 		 309 aa  159  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  30.13 
 
 		 322 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  31.16 
 
 		 326 aa  154  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1746  ABC transporter-related protein  29.28 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  39.23 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1076  ABC transporter related  38.68 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  31.86 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  32.79 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  34.23 
 
 		 289 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  38.22 
 
 		 286 aa  149  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  29.41 
 
 		 316 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2963  ABC transporter-like  29.75 
 
 		 316 aa  149  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.23893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1135  ABC transporter related protein  35.91 
 
 		 301 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0454  ABC transporter related  35.16 
 
 		 251 aa  149  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  35.24 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  34.15 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  29.41 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  28.01 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  29.35 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  31.6 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  31 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  29.87 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2113  ABC transporter related  33.49 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  36.28 
 
 		 286 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  30.06 
 
 		 307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  28.1 
 
 		 337 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  28.25 
 
 		 308 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  29.84 
 
 		 310 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  30 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  32.72 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  28.97 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  36.28 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2058  ABC transporter, ATPase subunit  27.34 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0605  ABC transporter-like protein  34.68 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.547486  normal  0.781825 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  36.2 
 
 		 230 aa  143  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4447  ABC transporter related  31.58 
 
 		 303 aa  142  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0569  ABC transporter related  32.26 
 
 		 256 aa  142  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  29.75 
 
 		 307 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1292  ABC transporter, ATP binding/permease protein  28.98 
 
 		 315 aa  142  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.549706  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  30.87 
 
 		 318 aa  142  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  27.63 
 
 		 312 aa  142  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  32.37 
 
 		 303 aa  142  6e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>