More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA3078 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
314 aa  641    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  60.39 
 
 
317 aa  381  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  55.92 
 
 
310 aa  352  4e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  41.78 
 
 
309 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  45.6 
 
 
325 aa  266  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  44.22 
 
 
331 aa  262  4.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  44.16 
 
 
315 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  40.79 
 
 
314 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  43.18 
 
 
369 aa  254  9e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  45.75 
 
 
308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  39.29 
 
 
308 aa  252  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  42.86 
 
 
325 aa  252  7e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1357  ABC transporter related  40.86 
 
 
309 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  44 
 
 
320 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  44 
 
 
320 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  41.53 
 
 
316 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  43.59 
 
 
360 aa  246  3e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  42.72 
 
 
317 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  43.73 
 
 
319 aa  245  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  41 
 
 
308 aa  245  6.999999999999999e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  42.95 
 
 
344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  42.21 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  39.68 
 
 
315 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  42.31 
 
 
316 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  43.42 
 
 
305 aa  236  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  42.95 
 
 
331 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  41.37 
 
 
336 aa  235  9e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  44.04 
 
 
339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  42.24 
 
 
322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  54.67 
 
 
247 aa  232  7.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  41 
 
 
299 aa  231  9e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  39.87 
 
 
310 aa  231  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  43.18 
 
 
311 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  41.25 
 
 
307 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  41.94 
 
 
329 aa  226  4e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  40.97 
 
 
311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  37.29 
 
 
303 aa  224  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  38.93 
 
 
305 aa  223  4e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  41.72 
 
 
306 aa  222  8e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  40.66 
 
 
312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  50 
 
 
235 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  48.18 
 
 
236 aa  215  8e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  48.68 
 
 
240 aa  215  8e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.93 
 
 
307 aa  212  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  37.58 
 
 
323 aa  212  7e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  37.9 
 
 
317 aa  211  9e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  38.85 
 
 
341 aa  211  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  38.49 
 
 
306 aa  209  5e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  37 
 
 
298 aa  209  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  36.16 
 
 
317 aa  209  6e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  38.94 
 
 
307 aa  205  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  35.71 
 
 
308 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  44.1 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.05 
 
 
301 aa  195  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  36.18 
 
 
308 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  31.96 
 
 
309 aa  192  4e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  35.88 
 
 
316 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  32.91 
 
 
310 aa  189  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  34.38 
 
 
321 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  36.04 
 
 
317 aa  186  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  31.75 
 
 
319 aa  185  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  36.18 
 
 
318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  35.08 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  33.44 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  35.67 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.89 
 
 
305 aa  183  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.31 
 
 
305 aa  183  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  35.22 
 
 
324 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2909  ABC transporter related  44.5 
 
 
245 aa  182  9.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  32.8 
 
 
308 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  34.89 
 
 
320 aa  179  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  34.55 
 
 
316 aa  176  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  34.38 
 
 
316 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2114  ABC transporter, ATP-binding protein  37.28 
 
 
261 aa  176  4e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  38.05 
 
 
245 aa  176  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  35.29 
 
 
309 aa  176  6e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  39.04 
 
 
309 aa  176  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  34.19 
 
 
305 aa  176  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  40.99 
 
 
303 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  33.76 
 
 
356 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.08 
 
 
312 aa  175  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3013  ABC transporter related protein  33.67 
 
 
360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978748  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  38.43 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02380  ABC transporter related  35.5 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  37.14 
 
 
259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  31.8 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  34.28 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  39.46 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  38.26 
 
 
243 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  38.5 
 
 
318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  36.05 
 
 
328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  31.02 
 
 
313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  37.83 
 
 
243 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1746  ABC transporter-related protein  34.75 
 
 
313 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  32.24 
 
 
313 aa  172  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  38.29 
 
 
295 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  41.45 
 
 
291 aa  172  9e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0529  ABC transporter related  34.32 
 
 
307 aa  172  9e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0717858  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  39.42 
 
 
578 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3116  ABC transporter related  33.33 
 
 
326 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.389623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>