More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3146 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  100 
 
 
319 aa  654    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  59.76 
 
 
328 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  58.54 
 
 
328 aa  396  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1671  ABC transporter related  60.19 
 
 
316 aa  353  2e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  53.14 
 
 
321 aa  349  4e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  47.62 
 
 
308 aa  318  9e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  47.3 
 
 
308 aa  305  5.0000000000000004e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  46.95 
 
 
306 aa  295  6e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  47.35 
 
 
316 aa  290  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  47.1 
 
 
309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  44.59 
 
 
317 aa  279  6e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  40.89 
 
 
310 aa  270  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2298  ABC transporter related  42.68 
 
 
316 aa  261  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00283386  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2246  ABC transporter related  42.81 
 
 
316 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3515  ABC transporter related  42.67 
 
 
313 aa  261  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2963  ABC transporter-like  40.76 
 
 
316 aa  260  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.23893  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0872  ABC transporter related  42.07 
 
 
316 aa  258  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  41.61 
 
 
311 aa  250  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3013  ABC transporter related protein  42.36 
 
 
360 aa  249  4e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978748  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  37.62 
 
 
301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  32.58 
 
 
312 aa  202  8e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  32.26 
 
 
312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  36.01 
 
 
300 aa  199  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  31.94 
 
 
312 aa  199  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  31.94 
 
 
312 aa  198  9e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  31.94 
 
 
312 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  31.94 
 
 
312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  34.29 
 
 
336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  31.61 
 
 
312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  31.61 
 
 
312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  33.76 
 
 
308 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0816  ABC transporter related protein  33.23 
 
 
305 aa  196  6e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.286081  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  37.11 
 
 
314 aa  195  8.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  31.29 
 
 
312 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  31.29 
 
 
312 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  32.48 
 
 
314 aa  193  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1168  ABC transporter related  43.69 
 
 
335 aa  193  3e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  33.96 
 
 
360 aa  192  6e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  31.95 
 
 
311 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  37.46 
 
 
346 aa  192  7e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.85 
 
 
329 aa  192  7e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  37.46 
 
 
346 aa  192  8e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  33.44 
 
 
320 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  35.26 
 
 
303 aa  191  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  37.5 
 
 
346 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.85 
 
 
322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  31.25 
 
 
314 aa  189  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  34.06 
 
 
306 aa  189  4e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0418  ABC transporter related  35.03 
 
 
307 aa  189  4e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.987895 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  37.03 
 
 
315 aa  189  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  36.94 
 
 
327 aa  188  8e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  35.56 
 
 
335 aa  188  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.12 
 
 
330 aa  188  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  40.71 
 
 
319 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  36.44 
 
 
259 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  32.6 
 
 
315 aa  188  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  34.08 
 
 
305 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  33.75 
 
 
306 aa  187  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0419  ABC transporter related  33.44 
 
 
314 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00150824  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0076  ABC transporter related  37.67 
 
 
257 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  32.48 
 
 
305 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  35.11 
 
 
307 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  36.08 
 
 
313 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  41.01 
 
 
279 aa  186  4e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  33.97 
 
 
305 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  33.12 
 
 
344 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  40.77 
 
 
327 aa  186  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.92 
 
 
328 aa  186  4e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  34.62 
 
 
312 aa  186  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  39.35 
 
 
289 aa  186  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.8 
 
 
326 aa  186  6e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  33.86 
 
 
306 aa  185  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  31.75 
 
 
314 aa  185  8e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  33.44 
 
 
331 aa  185  9e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  40.19 
 
 
316 aa  185  9e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  32.15 
 
 
310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  33.87 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  32.14 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  33.02 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  33.12 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  42.25 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3629  ABC transporter related  31.86 
 
 
311 aa  183  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00141619  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  32.9 
 
 
298 aa  184  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  36.59 
 
 
322 aa  183  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.32 
 
 
312 aa  183  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  30.06 
 
 
369 aa  183  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  35.05 
 
 
313 aa  183  3e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  34.9 
 
 
317 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  32.61 
 
 
320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  31.41 
 
 
325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  39.59 
 
 
308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  34.62 
 
 
311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  36.1 
 
 
318 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  36.1 
 
 
318 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  32.15 
 
 
327 aa  182  6e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  36.1 
 
 
318 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  36.77 
 
 
316 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  36.1 
 
 
318 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  33.87 
 
 
313 aa  181  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>