More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1575 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  100 
 
 		 314 aa  644    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  50.5 
 
 		 318 aa  297  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0632  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.1 
 
 		 318 aa  279  4e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.53 
 
 		 318 aa  278  8e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.85 
 
 		 309 aa  271  9e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.93 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.53 
 
 		 312 aa  263  4e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.26 
 
 		 305 aa  253  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.31 
 
 		 305 aa  241  7.999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.44 
 
 		 334 aa  226  4e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.03 
 
 		 328 aa  219  6e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.54 
 
 		 343 aa  218  7.999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.7 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.47 
 
 		 339 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.54 
 
 		 325 aa  216  5e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  36.89 
 
 		 311 aa  215  9e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  39.34 
 
 		 319 aa  214  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.5 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.76 
 
 		 329 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5171  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.59 
 
 		 329 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.91 
 
 		 308 aa  210  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.02 
 
 		 338 aa  209  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  35.97 
 
 		 327 aa  209  5e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  33.11 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.16 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.39 
 
 		 327 aa  207  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  38.64 
 
 		 325 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_125  ABC transporter, type 2, ATP-binding protein  38.36 
 
 		 288 aa  207  3e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2322  ABC transporter related  39.61 
 
 		 328 aa  206  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0253  ABC transporter related  38.03 
 
 		 288 aa  206  5e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  32.79 
 
 		 312 aa  205  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  33.11 
 
 		 312 aa  205  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  33.11 
 
 		 312 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  32.46 
 
 		 312 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  33.11 
 
 		 312 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  33.11 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  33.11 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  33.11 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.45 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0288  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.72 
 
 		 327 aa  203  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467891  normal  0.104765 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0988  ABC transporter related  36.72 
 
 		 327 aa  202  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.037196 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  32.46 
 
 		 312 aa  202  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.52 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  36.57 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  43.18 
 
 		 259 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  37.54 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.77 
 
 		 327 aa  200  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.86 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.54 
 
 		 317 aa  199  7e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  35.31 
 
 		 303 aa  198  9e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  36.24 
 
 		 320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.51 
 
 		 316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0522  ABC transporter related  46.93 
 
 		 287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000861338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  37.03 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  35.79 
 
 		 324 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0177  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.67 
 
 		 329 aa  197  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0504097 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  37.91 
 
 		 332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  35.83 
 
 		 314 aa  196  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  35.95 
 
 		 356 aa  195  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  38.11 
 
 		 310 aa  195  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  36.04 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  38.76 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.03 
 
 		 330 aa  193  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1742  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.41 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0557624  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  37.83 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  37.97 
 
 		 339 aa  193  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  35.53 
 
 		 319 aa  193  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0252  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.62 
 
 		 317 aa  192  4e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.297756 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  37.34 
 
 		 311 aa  192  5e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  36.21 
 
 		 314 aa  192  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  37.14 
 
 		 326 aa  192  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  36.81 
 
 		 312 aa  192  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  36.01 
 
 		 319 aa  192  7e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  33.12 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  36.84 
 
 		 318 aa  190  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  33.76 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  40.08 
 
 		 510 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  34.75 
 
 		 307 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  38.51 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  37.14 
 
 		 328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.17 
 
 		 317 aa  189  4e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0419  ABC transporter related  35.31 
 
 		 314 aa  189  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  31.25 
 
 		 319 aa  189  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  36.63 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0452  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.77 
 
 		 309 aa  189  4e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000639628  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  37.26 
 
 		 322 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  40.6 
 
 		 369 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5133  ABC transporter ATP-binding protein  41.99 
 
 		 280 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.907732  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  35.62 
 
 		 319 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5526  ABC transporter ATP-binding protein  41.99 
 
 		 280 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.74 
 
 		 323 aa  189  7e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  34.75 
 
 		 319 aa  189  8e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.46 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  36.1 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  35.18 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  36.84 
 
 		 305 aa  187  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  38.08 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.45 
 
 		 317 aa  187  1e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5460  ABC transporter, ATP-binding protein  41.56 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00101212  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.57 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>