More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1342 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  100 
 
 
301 aa  604  9.999999999999999e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  54.15 
 
 
303 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  50 
 
 
305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  42.38 
 
 
309 aa  242  6e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  45.61 
 
 
318 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  41.37 
 
 
316 aa  233  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  40.58 
 
 
337 aa  229  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  40.26 
 
 
316 aa  229  6e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  41.39 
 
 
309 aa  224  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  46.98 
 
 
327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  39.09 
 
 
340 aa  219  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  47.86 
 
 
315 aa  219  6e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  39.17 
 
 
319 aa  218  7.999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  42.37 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  42.08 
 
 
328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  40.52 
 
 
313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  37.62 
 
 
319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  41.95 
 
 
301 aa  211  9e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  40.2 
 
 
313 aa  210  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  41.75 
 
 
305 aa  209  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  39.29 
 
 
313 aa  209  4e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 
356 aa  205  8e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  41.47 
 
 
300 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  48.42 
 
 
302 aa  202  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  38.59 
 
 
298 aa  202  8e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  40.47 
 
 
331 aa  200  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  40.26 
 
 
318 aa  199  6e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  39.35 
 
 
303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1671  ABC transporter related  36.31 
 
 
316 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3123  ABC transporter related  39.74 
 
 
313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  34.2 
 
 
308 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  40.79 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  48.13 
 
 
304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  46.93 
 
 
318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  41.42 
 
 
317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0659  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
286 aa  195  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  46.93 
 
 
318 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  39 
 
 
318 aa  195  9e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  46.93 
 
 
318 aa  195  9e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  39.55 
 
 
305 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  37.46 
 
 
314 aa  193  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  37.83 
 
 
310 aa  193  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  37.09 
 
 
305 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  37.09 
 
 
305 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  36.75 
 
 
305 aa  192  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  46.7 
 
 
339 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  45.42 
 
 
255 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2049  ABC transporter related  45.61 
 
 
253 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.368716 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  38.51 
 
 
307 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 
305 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  43.86 
 
 
326 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  37 
 
 
310 aa  190  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  37.25 
 
 
308 aa  190  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  37.5 
 
 
300 aa  190  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  38.1 
 
 
315 aa  189  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  38 
 
 
304 aa  189  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  41.85 
 
 
279 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  37.42 
 
 
305 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  37.38 
 
 
322 aa  188  8e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  39.27 
 
 
303 aa  188  9e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  44.17 
 
 
255 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  38.69 
 
 
325 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  36.84 
 
 
305 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  43.05 
 
 
250 aa  188  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  41.28 
 
 
259 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  37.54 
 
 
305 aa  188  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  38.31 
 
 
313 aa  188  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  37.91 
 
 
326 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  39.02 
 
 
306 aa  188  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  37.25 
 
 
316 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  37.25 
 
 
325 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  43.05 
 
 
250 aa  188  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  43.24 
 
 
292 aa  187  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  37.42 
 
 
305 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  37.95 
 
 
312 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  35.64 
 
 
317 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  44.02 
 
 
315 aa  187  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2058  ABC transporter, ATPase subunit  36.21 
 
 
291 aa  186  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  36.75 
 
 
318 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  36.75 
 
 
318 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  40.3 
 
 
305 aa  186  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  37.66 
 
 
310 aa  186  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  36.75 
 
 
318 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  35.18 
 
 
309 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2246  ABC transporter related  35.39 
 
 
316 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  39.8 
 
 
305 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  36.75 
 
 
305 aa  185  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  35.83 
 
 
319 aa  185  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.15 
 
 
312 aa  186  6e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3301  ABC transporter related protein  40 
 
 
306 aa  185  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.377119  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  31.61 
 
 
320 aa  185  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2298  ABC transporter related  35.39 
 
 
316 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00283386  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  44.44 
 
 
320 aa  185  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.42 
 
 
322 aa  185  8e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 
306 aa  185  9e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  45.95 
 
 
318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  36.93 
 
 
310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  39.2 
 
 
304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>