More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1755 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  100 
 
 
316 aa  632  1e-180  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  51.43 
 
 
317 aa  317  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  47.3 
 
 
325 aa  317  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  50.47 
 
 
319 aa  315  9e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  49.84 
 
 
315 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  50.32 
 
 
310 aa  311  7.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  50.94 
 
 
320 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  50.94 
 
 
320 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  50 
 
 
331 aa  308  6.999999999999999e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  47.13 
 
 
360 aa  292  4e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  45.66 
 
 
369 aa  290  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  47.3 
 
 
328 aa  289  4e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  45.66 
 
 
311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  46.73 
 
 
308 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  40.75 
 
 
336 aa  272  5.000000000000001e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  44.55 
 
 
317 aa  269  4e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  42.12 
 
 
344 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  40.97 
 
 
315 aa  260  2e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  46.05 
 
 
305 aa  258  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  43.97 
 
 
310 aa  257  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  43.85 
 
 
317 aa  256  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  45.91 
 
 
329 aa  253  4.0000000000000004e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 
314 aa  248  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.37 
 
 
301 aa  247  2e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  44.3 
 
 
303 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  40.33 
 
 
341 aa  243  3.9999999999999997e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  40.86 
 
 
305 aa  240  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  50.92 
 
 
309 aa  239  5.999999999999999e-62  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  37.74 
 
 
308 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  43.33 
 
 
298 aa  238  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  51.83 
 
 
236 aa  236  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  40.95 
 
 
316 aa  235  8e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  37.01 
 
 
308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  49.77 
 
 
323 aa  232  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  43.61 
 
 
322 aa  232  7.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  40.85 
 
 
299 aa  231  1e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  39.68 
 
 
307 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 
307 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  41.35 
 
 
307 aa  225  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  40.51 
 
 
306 aa  225  8e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  49.78 
 
 
240 aa  223  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  38.11 
 
 
306 aa  223  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  41.53 
 
 
331 aa  222  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  49.34 
 
 
261 aa  222  8e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  39.6 
 
 
312 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  37.17 
 
 
314 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  39.27 
 
 
308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  45.78 
 
 
235 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  39.3 
 
 
311 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  36.54 
 
 
325 aa  201  9e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  35.95 
 
 
317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  44.44 
 
 
247 aa  194  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  36.57 
 
 
339 aa  193  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  35.44 
 
 
321 aa  192  6e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  33.88 
 
 
309 aa  192  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  38.78 
 
 
309 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  33.55 
 
 
308 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  35.08 
 
 
313 aa  189  4e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  37.25 
 
 
301 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  36.69 
 
 
309 aa  187  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  36.36 
 
 
316 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  36.86 
 
 
316 aa  186  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  34.43 
 
 
313 aa  186  6e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  34.31 
 
 
338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  34.1 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  35.5 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  33.88 
 
 
309 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2114  ABC transporter, ATP-binding protein  39.53 
 
 
261 aa  182  6e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.95 
 
 
305 aa  181  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 
309 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  37.01 
 
 
335 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  36.81 
 
 
318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.23 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  36.01 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2909  ABC transporter related  41.36 
 
 
245 aa  180  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  37.05 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  34.09 
 
 
315 aa  179  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  34.41 
 
 
324 aa  179  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  41.07 
 
 
284 aa  179  4.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  34.06 
 
 
319 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  43.83 
 
 
307 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1357  ABC transporter related  34.54 
 
 
309 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  36.71 
 
 
314 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  36.68 
 
 
318 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  33.01 
 
 
310 aa  178  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  37.58 
 
 
346 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  37.82 
 
 
302 aa  176  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  43.4 
 
 
307 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  36.19 
 
 
314 aa  176  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0227  ABC transporter related protein  34.53 
 
 
304 aa  176  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  38.89 
 
 
290 aa  175  7e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1284  ABC transporter related  33.33 
 
 
334 aa  175  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  36.39 
 
 
319 aa  175  8e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  39.48 
 
 
303 aa  175  8e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  35.97 
 
 
322 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  34.42 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  34.29 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  38.11 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  32.14 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  35.6 
 
 
309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>