More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5380 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  100 
 
 
322 aa  639    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  48.85 
 
 
298 aa  283  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  47.87 
 
 
308 aa  273  3e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.13 
 
 
301 aa  268  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  45.34 
 
 
344 aa  262  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  46.13 
 
 
311 aa  256  5e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  44.12 
 
 
325 aa  253  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  43.71 
 
 
369 aa  252  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  42.63 
 
 
315 aa  250  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  45.03 
 
 
336 aa  250  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  43.18 
 
 
315 aa  250  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  44.77 
 
 
303 aa  248  8e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  43.79 
 
 
310 aa  247  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  43.97 
 
 
305 aa  246  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  43.46 
 
 
299 aa  245  6.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  45.1 
 
 
317 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  42.62 
 
 
341 aa  241  9e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  45.07 
 
 
319 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  42.81 
 
 
360 aa  238  6.999999999999999e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  42.77 
 
 
317 aa  238  8e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  41.45 
 
 
305 aa  235  7e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  51.79 
 
 
236 aa  235  7e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  42.24 
 
 
314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  42.17 
 
 
310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  41.04 
 
 
331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  42.35 
 
 
311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  42.95 
 
 
331 aa  233  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  43.32 
 
 
316 aa  232  7.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  43.04 
 
 
320 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  43.04 
 
 
320 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  41.85 
 
 
323 aa  229  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  39.42 
 
 
316 aa  229  7e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  38.02 
 
 
308 aa  226  3e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  38.22 
 
 
317 aa  226  5.0000000000000005e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  40.87 
 
 
328 aa  225  8e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  40.46 
 
 
308 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  40.98 
 
 
307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  40.58 
 
 
308 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  36.39 
 
 
314 aa  219  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  41.42 
 
 
307 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  51.14 
 
 
339 aa  217  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  49.55 
 
 
240 aa  217  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.78 
 
 
307 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  39.54 
 
 
312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  39.74 
 
 
306 aa  212  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  47.87 
 
 
306 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  47.03 
 
 
235 aa  210  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  36.81 
 
 
309 aa  209  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  38.69 
 
 
329 aa  207  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  40.38 
 
 
317 aa  206  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  36.36 
 
 
308 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  49.1 
 
 
261 aa  205  9e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 
309 aa  203  4e-51  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1357  ABC transporter related  34.09 
 
 
309 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  36.98 
 
 
325 aa  192  9e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2909  ABC transporter related  45.83 
 
 
245 aa  192  9e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  46.89 
 
 
247 aa  191  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  42.66 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  39 
 
 
318 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  40.3 
 
 
356 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.74 
 
 
333 aa  177  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  35.05 
 
 
310 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  38.67 
 
 
306 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  37.64 
 
 
316 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  38.37 
 
 
337 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  40.94 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  37.66 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.19 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  43.09 
 
 
291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  42.86 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  42.66 
 
 
319 aa  173  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  41.28 
 
 
328 aa  173  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  42.11 
 
 
322 aa  172  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  40.64 
 
 
315 aa  172  5.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  40.6 
 
 
300 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.95 
 
 
312 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  45 
 
 
301 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  40.96 
 
 
914 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  37.37 
 
 
309 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  39.83 
 
 
313 aa  171  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  45.05 
 
 
259 aa  171  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  39.83 
 
 
313 aa  171  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  41.07 
 
 
309 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  44.29 
 
 
253 aa  170  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  38.96 
 
 
245 aa  170  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  43.38 
 
 
318 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  38.82 
 
 
337 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  39.41 
 
 
313 aa  169  4e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3013  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
360 aa  170  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978748  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  36.96 
 
 
332 aa  169  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  32.9 
 
 
308 aa  170  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.44 
 
 
305 aa  169  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2666  ABC transporter related  41.74 
 
 
342 aa  169  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  39.64 
 
 
335 aa  169  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  33.55 
 
 
310 aa  169  7e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2734  ABC transporter related  41.03 
 
 
341 aa  169  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  40.83 
 
 
328 aa  168  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  39.64 
 
 
303 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  40.17 
 
 
309 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  40.89 
 
 
341 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>