More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1634 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  100 
 
 
297 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  54.58 
 
 
305 aa  353  2e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  47.8 
 
 
297 aa  290  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  48.32 
 
 
314 aa  289  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  47.1 
 
 
297 aa  289  4e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  48.12 
 
 
297 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  47.64 
 
 
297 aa  288  7e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  47.64 
 
 
297 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  47.64 
 
 
297 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  47.64 
 
 
297 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  47.64 
 
 
297 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  47.3 
 
 
297 aa  286  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 
297 aa  286  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  47.1 
 
 
293 aa  276  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  46.37 
 
 
291 aa  276  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  44.56 
 
 
295 aa  266  2e-70  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  40.41 
 
 
304 aa  256  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2171  ABC transporter related  44.67 
 
 
299 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  40.34 
 
 
300 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  41.92 
 
 
293 aa  245  6e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  41.58 
 
 
293 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  37.37 
 
 
304 aa  228  7e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  39.13 
 
 
307 aa  228  9e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  39.38 
 
 
293 aa  228  9e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  39.8 
 
 
390 aa  222  4.9999999999999996e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl255  multidrug ABC transporter ATP-binding component  48.8 
 
 
247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000090688  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  37.9 
 
 
339 aa  219  6e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  36.33 
 
 
309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  36.82 
 
 
340 aa  216  5e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  37.54 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  35.62 
 
 
308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  35.64 
 
 
316 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  39.46 
 
 
302 aa  212  7e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  39.66 
 
 
290 aa  210  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  41.78 
 
 
286 aa  209  3e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  34.01 
 
 
306 aa  205  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  35.05 
 
 
306 aa  205  7e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  35.62 
 
 
307 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  34.9 
 
 
300 aa  203  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  34.22 
 
 
304 aa  203  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  35.37 
 
 
308 aa  202  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  35.67 
 
 
298 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  34.25 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  34.71 
 
 
306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  34.01 
 
 
313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  34.01 
 
 
313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  34.01 
 
 
313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  36.64 
 
 
305 aa  200  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  34.01 
 
 
308 aa  199  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  35.4 
 
 
309 aa  199  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  34.78 
 
 
301 aa  199  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  34.25 
 
 
300 aa  199  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.05 
 
 
302 aa  198  9e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  34.02 
 
 
302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  35.27 
 
 
297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  36.73 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  34.71 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  33.23 
 
 
328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  34.02 
 
 
307 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  34.02 
 
 
307 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  35.27 
 
 
302 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  32.88 
 
 
306 aa  195  8.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  34.02 
 
 
307 aa  195  9e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  35.96 
 
 
311 aa  194  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  34.58 
 
 
305 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  32.98 
 
 
303 aa  192  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  33.11 
 
 
302 aa  192  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  34.01 
 
 
312 aa  192  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.03 
 
 
337 aa  192  7e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  32.76 
 
 
298 aa  191  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.67 
 
 
312 aa  191  9e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.19 
 
 
317 aa  190  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.15 
 
 
302 aa  188  8e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  37.46 
 
 
313 aa  188  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  34.48 
 
 
308 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  37.17 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  35.5 
 
 
335 aa  182  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  33.45 
 
 
307 aa  182  6e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  35.06 
 
 
310 aa  181  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  31.48 
 
 
317 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.7 
 
 
301 aa  179  7e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  33.66 
 
 
309 aa  178  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  41.74 
 
 
298 aa  176  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  35.33 
 
 
305 aa  175  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  35.12 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  31.54 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  33.98 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  37.66 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  35.88 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  38.25 
 
 
247 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  33.67 
 
 
339 aa  172  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  34.13 
 
 
291 aa  172  7.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  33.66 
 
 
310 aa  172  9e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  33.98 
 
 
332 aa  171  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.17 
 
 
324 aa  171  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  33.22 
 
 
318 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  35.12 
 
 
308 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  41.18 
 
 
328 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  38.29 
 
 
236 aa  170  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  39.13 
 
 
369 aa  169  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>