More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2859 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  100 
 
 
301 aa  587  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  60.53 
 
 
306 aa  351  7e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  59.34 
 
 
301 aa  332  6e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  56.67 
 
 
310 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  58.42 
 
 
301 aa  324  9e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  60.91 
 
 
301 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  57.43 
 
 
331 aa  319  3.9999999999999996e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  57.43 
 
 
316 aa  318  7e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  51.33 
 
 
298 aa  273  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  46.2 
 
 
308 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  47.81 
 
 
299 aa  245  6e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  46.71 
 
 
322 aa  241  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  44.48 
 
 
303 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  44.86 
 
 
327 aa  229  4e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  44.3 
 
 
310 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  44.3 
 
 
310 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  40.59 
 
 
303 aa  226  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  45.7 
 
 
338 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  43.58 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  43.14 
 
 
313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2566  ABC transporter related  47.67 
 
 
310 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.2512  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  43.1 
 
 
304 aa  217  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  50.21 
 
 
303 aa  217  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4914  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.63 
 
 
316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000429083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1736  nitrous oxide reductase maturation ATPase NosF  48.81 
 
 
304 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  44.67 
 
 
318 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20180  NosF protein  48.47 
 
 
304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.423742  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  40.26 
 
 
332 aa  206  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  39.6 
 
 
348 aa  205  9e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4062  ABC transporter related  46 
 
 
318 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  39.26 
 
 
348 aa  204  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4174  ABC transporter related  46 
 
 
318 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  39.26 
 
 
348 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  44.58 
 
 
300 aa  203  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  44.33 
 
 
304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  40.21 
 
 
302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  39.23 
 
 
344 aa  199  6e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  40.14 
 
 
325 aa  198  9e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4448  ABC transporter related  38.78 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  46.92 
 
 
304 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  46.92 
 
 
304 aa  195  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  46.92 
 
 
309 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  38.91 
 
 
309 aa  193  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  40 
 
 
309 aa  192  5e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  48.9 
 
 
747 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3994  ABC transporter related  39.87 
 
 
345 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3869  ABC transporter related  39.87 
 
 
345 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0490  ABC transporter-related protein  37.98 
 
 
302 aa  189  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0356  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 
309 aa  189  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1371  copper ATP-binding ABC transporter protein  42.95 
 
 
314 aa  186  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  37.41 
 
 
311 aa  182  8.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  39.12 
 
 
310 aa  182  8.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  43.98 
 
 
335 aa  181  9.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  38.11 
 
 
316 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  34.24 
 
 
300 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  39.67 
 
 
310 aa  179  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  49.32 
 
 
332 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  45.13 
 
 
250 aa  176  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  39.12 
 
 
308 aa  175  8e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  36.57 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0511  ABC transporter related  40.34 
 
 
302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2631  ABC transporter related  37.92 
 
 
301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  39.35 
 
 
302 aa  172  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  36.04 
 
 
309 aa  172  5.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.86 
 
 
339 aa  172  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  45 
 
 
322 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06880  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.95 
 
 
307 aa  171  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0918509  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  36.57 
 
 
339 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3411  ABC transporter related  47.93 
 
 
342 aa  170  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0395155  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  35.58 
 
 
337 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  36.5 
 
 
339 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  36.5 
 
 
339 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3975  ABC transporter related  45.5 
 
 
312 aa  169  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.138186  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  33.55 
 
 
315 aa  168  8e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  42.2 
 
 
316 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  38.71 
 
 
305 aa  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  39.32 
 
 
309 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  38.28 
 
 
300 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  45.16 
 
 
304 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  43.29 
 
 
373 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3015  ABC transporter related  43.18 
 
 
257 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137767 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  38.14 
 
 
298 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  40.93 
 
 
313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  40.93 
 
 
313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  40.93 
 
 
313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  33.22 
 
 
310 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  35.26 
 
 
318 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4384  ABC transporter related  43.18 
 
 
280 aa  166  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2644  ABC transporter related  45.16 
 
 
334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  37.37 
 
 
303 aa  165  8e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7216  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.07 
 
 
316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927821  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  37.82 
 
 
340 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  42.86 
 
 
295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0960  ABC transporter related protein  42.27 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00252533  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  41.67 
 
 
305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  44.02 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1683  ABC transporter related  37.83 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  34.09 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  37.84 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0603  ABC transporter-like protein  39.63 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.858609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>