More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3159 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  100 
 
 
259 aa  514  1.0000000000000001e-145  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3287  ABC transporter related protein  63.01 
 
 
261 aa  291  6e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3364  ABC transporter related protein  62.7 
 
 
266 aa  286  2e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  59.58 
 
 
279 aa  286  2e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2556  ABC transporter related protein  60.08 
 
 
272 aa  278  8e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  56.56 
 
 
253 aa  262  4e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0121  ABC transporter related  59.17 
 
 
270 aa  258  5.0000000000000005e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1627  ABC transporter related  55.28 
 
 
252 aa  257  1e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.868529  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  53.14 
 
 
250 aa  246  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  42.92 
 
 
250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  42.92 
 
 
250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  42.91 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  43.91 
 
 
316 aa  196  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  44.35 
 
 
309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  38.68 
 
 
247 aa  193  3e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  38.24 
 
 
246 aa  192  4e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  40.34 
 
 
249 aa  191  8e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  40.42 
 
 
257 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  41.98 
 
 
259 aa  188  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  43.91 
 
 
309 aa  188  9e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  37.19 
 
 
253 aa  187  1e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  40.47 
 
 
337 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  42.54 
 
 
316 aa  186  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  40.83 
 
 
259 aa  186  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  43.85 
 
 
255 aa  184  9e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  42.73 
 
 
328 aa  183  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  39.33 
 
 
241 aa  183  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 
244 aa  181  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  41.03 
 
 
246 aa  181  7e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  42.62 
 
 
255 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 
241 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 
241 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  38.91 
 
 
241 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 
241 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 
241 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  38.91 
 
 
241 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 
241 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0419  ABC transporter related  45.5 
 
 
314 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00150824  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  38.49 
 
 
241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  43.43 
 
 
314 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  38.02 
 
 
250 aa  178  8e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  42.79 
 
 
337 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  41.3 
 
 
309 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  37.85 
 
 
251 aa  176  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  37.24 
 
 
241 aa  176  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  40.97 
 
 
313 aa  176  5e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  42.47 
 
 
308 aa  175  8e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  40.25 
 
 
259 aa  175  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  40.59 
 
 
241 aa  174  9e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2482  ABC transporter-related protein  41.91 
 
 
238 aa  174  9e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.988214  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  39.47 
 
 
316 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  42.86 
 
 
337 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  40 
 
 
328 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3629  ABC transporter related  41.25 
 
 
311 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00141619  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  38.5 
 
 
304 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  40.53 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  39.83 
 
 
243 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  42.46 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  40.53 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  39.09 
 
 
512 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  39.29 
 
 
338 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2049  ABC transporter related  41.15 
 
 
253 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.368716 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  37.87 
 
 
239 aa  171  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  40.81 
 
 
314 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  38.64 
 
 
315 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  45.05 
 
 
322 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4151  ABC transporter-like  40.08 
 
 
275 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000107642  normal  0.126355 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  38.91 
 
 
230 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  40.99 
 
 
318 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  39.33 
 
 
249 aa  171  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  42.15 
 
 
309 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  38.59 
 
 
243 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  38.01 
 
 
290 aa  169  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 
242 aa  169  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  42.41 
 
 
337 aa  169  4e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  42.18 
 
 
325 aa  169  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  36.28 
 
 
308 aa  169  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  37.08 
 
 
245 aa  169  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  40.44 
 
 
310 aa  169  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  38.91 
 
 
256 aa  169  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  42.34 
 
 
339 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  42.34 
 
 
339 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  41.26 
 
 
340 aa  167  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  35.66 
 
 
241 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  41.28 
 
 
298 aa  166  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  44.34 
 
 
302 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  42.55 
 
 
318 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  43.72 
 
 
373 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  38.39 
 
 
338 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0156  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  39.51 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  37.33 
 
 
321 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.82 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  35.16 
 
 
326 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  39.91 
 
 
327 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  35.25 
 
 
241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  41.36 
 
 
301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  39.73 
 
 
322 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  36.95 
 
 
510 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  39.82 
 
 
341 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  41.59 
 
 
315 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>