More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4965 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  100 
 
 
304 aa  622  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  72.09 
 
 
305 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  56.39 
 
 
309 aa  351  1e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  56.77 
 
 
309 aa  347  1e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  53.92 
 
 
309 aa  333  3e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  54.67 
 
 
319 aa  327  1.0000000000000001e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  51.61 
 
 
321 aa  321  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  44.82 
 
 
301 aa  276  4e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  44.3 
 
 
309 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  43.85 
 
 
305 aa  257  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  40.33 
 
 
299 aa  255  6e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  38.33 
 
 
299 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  42.72 
 
 
308 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  41.55 
 
 
298 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  41.22 
 
 
298 aa  236  3e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  38.91 
 
 
299 aa  235  8e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  40.2 
 
 
298 aa  233  3e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  37.12 
 
 
300 aa  228  9e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  37.17 
 
 
298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  36.52 
 
 
299 aa  209  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  36.52 
 
 
299 aa  209  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.44 
 
 
326 aa  208  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  40.2 
 
 
296 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  38.31 
 
 
294 aa  206  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  37.46 
 
 
294 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  37.46 
 
 
303 aa  206  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  39.53 
 
 
296 aa  206  5e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  37.46 
 
 
303 aa  205  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  37.46 
 
 
294 aa  205  8e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  42.23 
 
 
315 aa  204  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  37.97 
 
 
294 aa  203  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  37.63 
 
 
303 aa  202  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.33 
 
 
297 aa  202  6e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.54 
 
 
309 aa  202  7e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  37.12 
 
 
303 aa  202  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  37.12 
 
 
294 aa  202  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  36.79 
 
 
294 aa  201  9e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  37.63 
 
 
294 aa  201  9e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  36.58 
 
 
294 aa  199  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  35.18 
 
 
318 aa  199  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  34.12 
 
 
406 aa  198  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  35.76 
 
 
296 aa  195  9e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  35.31 
 
 
305 aa  192  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  33.22 
 
 
341 aa  192  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.34 
 
 
309 aa  191  9e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  35.08 
 
 
303 aa  188  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  41.99 
 
 
266 aa  187  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  42.65 
 
 
318 aa  187  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  32.77 
 
 
326 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  29.33 
 
 
303 aa  186  6e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  32.65 
 
 
295 aa  185  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  34.01 
 
 
293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.49 
 
 
298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.01 
 
 
291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  39.65 
 
 
329 aa  182  8.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  32.9 
 
 
290 aa  182  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  31.97 
 
 
298 aa  179  7e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  31.79 
 
 
307 aa  179  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  31.42 
 
 
292 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  34.01 
 
 
292 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  33.97 
 
 
312 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  31.88 
 
 
317 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  35.76 
 
 
316 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  38.5 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  36.28 
 
 
279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  35.71 
 
 
294 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  32.88 
 
 
315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  31.27 
 
 
297 aa  170  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  30.38 
 
 
305 aa  170  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  30.38 
 
 
319 aa  169  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0121  ABC transporter related  37.78 
 
 
270 aa  168  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  30.61 
 
 
294 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3364  ABC transporter related protein  38.05 
 
 
266 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  38.39 
 
 
293 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  40.27 
 
 
243 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  34.21 
 
 
306 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  30.79 
 
 
316 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  38.94 
 
 
243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.78 
 
 
305 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  33.04 
 
 
296 aa  160  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  28.33 
 
 
337 aa  159  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  33.11 
 
 
301 aa  159  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  32.89 
 
 
301 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3287  ABC transporter related protein  37.67 
 
 
261 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 
241 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  35 
 
 
241 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  34.17 
 
 
241 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 
241 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  34.17 
 
 
241 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  33.94 
 
 
250 aa  158  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  32.34 
 
 
259 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  35 
 
 
241 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  35.54 
 
 
293 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1627  ABC transporter related  36.32 
 
 
252 aa  158  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.868529  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  30.54 
 
 
295 aa  158  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  34.18 
 
 
295 aa  158  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  34.58 
 
 
241 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  32.89 
 
 
302 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  32.89 
 
 
302 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  32.16 
 
 
332 aa  157  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>