More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7297 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  100 
 
 		 321 aa  664    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  52.41 
 
 		 305 aa  332  7.000000000000001e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 309 aa  322  7e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  49.03 
 
 		 309 aa  318  9e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  51.61 
 
 		 304 aa  316  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  47.71 
 
 		 309 aa  305  6e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  48.34 
 
 		 319 aa  298  1e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  43.33 
 
 		 299 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  42.33 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  43.19 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  44.82 
 
 		 305 aa  256  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  43.14 
 
 		 308 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  41.08 
 
 		 299 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  41.53 
 
 		 299 aa  239  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  38.74 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  38.74 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  38.18 
 
 		 298 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  38.64 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  40.54 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  39.14 
 
 		 315 aa  230  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  38.64 
 
 		 294 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  38.64 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  40.2 
 
 		 296 aa  229  5e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  36.93 
 
 		 300 aa  228  7e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  38.72 
 
 		 294 aa  228  8e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  38.31 
 
 		 294 aa  228  9e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  38.31 
 
 		 303 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  38.31 
 
 		 294 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  38.51 
 
 		 298 aa  227  3e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  37.97 
 
 		 294 aa  225  7e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  38.31 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  37.84 
 
 		 298 aa  224  2e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  38.51 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  34.46 
 
 		 406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  37.63 
 
 		 294 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  36.95 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 294 aa  215  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  35.92 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  40.54 
 
 		 326 aa  212  7e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  34.11 
 
 		 307 aa  212  7e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  34.11 
 
 		 326 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  43.44 
 
 		 309 aa  207  1e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  34.78 
 
 		 317 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  45.21 
 
 		 266 aa  202  9e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.15 
 
 		 297 aa  199  6e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  41.94 
 
 		 303 aa  199  6e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  33.12 
 
 		 318 aa  199  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  32.58 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  42.2 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  33.01 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  35.55 
 
 		 296 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.12 
 
 		 298 aa  196  5.000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  34.85 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  34.74 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  37.82 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  33.56 
 
 		 293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  34.32 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.79 
 
 		 291 aa  189  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.12 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  30.87 
 
 		 295 aa  187  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  32.66 
 
 		 290 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  40.18 
 
 		 329 aa  185  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  31.91 
 
 		 305 aa  185  8e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  32.32 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  32.43 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  30.16 
 
 		 303 aa  182  8.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  33.22 
 
 		 293 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  36.99 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  29.83 
 
 		 297 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  29.25 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  34.96 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  30.03 
 
 		 308 aa  169  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.95 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  30.74 
 
 		 335 aa  168  9e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  35.34 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36 
 
 		 305 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  37.33 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  35.4 
 
 		 319 aa  166  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  32.91 
 
 		 332 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  37.33 
 
 		 243 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  33.33 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  37.33 
 
 		 243 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  38.57 
 
 		 236 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2951  ABC transporter related  38.35 
 
 		 260 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  30.72 
 
 		 315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  37.55 
 
 		 241 aa  162  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  31.41 
 
 		 312 aa  162  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  36.56 
 
 		 308 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  31.29 
 
 		 312 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  30.97 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  36.04 
 
 		 341 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1746  ABC transporter-related protein  39.44 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  35.24 
 
 		 241 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  30.03 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  29.25 
 
 		 346 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  29.25 
 
 		 346 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  30.03 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  29.25 
 
 		 346 aa  160  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  34.8 
 
 		 244 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  30.03 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>