More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0156 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0156  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  100 
 
 		 254 aa  509  1e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  54.71 
 
 		 307 aa  257  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  55.3 
 
 		 307 aa  256  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  52.21 
 
 		 310 aa  232  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  52.23 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.61 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1823  ABC transporter related  47.96 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.554896  normal  0.879198 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4010  ABC transporter related protein  51.56 
 
 		 299 aa  222  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2125  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1438  ABC transporter, ATPase subunit  50.42 
 
 		 310 aa  221  7e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  52.49 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  52.49 
 
 		 309 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  52.49 
 
 		 309 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  52.49 
 
 		 309 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  52.49 
 
 		 309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  52.04 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  52.04 
 
 		 309 aa  217  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  52.04 
 
 		 309 aa  217  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.36 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  47.92 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  49.38 
 
 		 309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1167  ABC transporter related  50.46 
 
 		 232 aa  213  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  0.478862 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  49.77 
 
 		 326 aa  211  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1161  ABC transporter related  50.22 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  46.48 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  48.87 
 
 		 301 aa  205  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  50.22 
 
 		 305 aa  203  2e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  46.3 
 
 		 312 aa  202  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  48.43 
 
 		 306 aa  202  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0592  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5490  ABC transporter related  46.51 
 
 		 301 aa  201  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.691656  normal  0.086802 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4660  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  46.82 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4661  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  46.82 
 
 		 307 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0642  ABC transporter related  45.53 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0145806  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2202  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817339 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4363  ABC transporter related  47.27 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4645  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3812  putative bacteriocin ABC transporter, ATP-binding protein  46.47 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  48.17 
 
 		 314 aa  199  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4281  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 		 307 aa  198  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  45.66 
 
 		 300 aa  198  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4431  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  46.36 
 
 		 307 aa  198  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4774  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  46.36 
 
 		 307 aa  198  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3616  bacteriocin ABC transporter ATP-binding protein  45.64 
 
 		 234 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3903  bacteriocin ABC transporter ATP-binding protein  45.64 
 
 		 234 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03750  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.19 
 
 		 237 aa  197  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.591537  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4270  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  45.91 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.071906  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  45.66 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3231  ABC transporter-related protein  45.91 
 
 		 312 aa  196  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0243  ABC transporter related  45.68 
 
 		 232 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4648  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  45.91 
 
 		 307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1721  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.847764  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  46.08 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.54 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.874439 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  46.7 
 
 		 320 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  47.89 
 
 		 300 aa  192  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 237 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  46.61 
 
 		 310 aa  192  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  45.29 
 
 		 330 aa  191  9e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.98 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  46.98 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3301  ABC transporter related protein  43.17 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.377119  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 311 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 		 331 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  46.05 
 
 		 311 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  44.8 
 
 		 298 aa  189  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  44.55 
 
 		 331 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  44.55 
 
 		 303 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  44.55 
 
 		 303 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  41.91 
 
 		 258 aa  188  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.55 
 
 		 331 aa  188  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1292  ABC transporter related protein  45 
 
 		 351 aa  188  8e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  42.19 
 
 		 355 aa  188  9e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3948  ABC transporter related  42.06 
 
 		 294 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  44.75 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  41.78 
 
 		 304 aa  187  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  44.5 
 
 		 303 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  43.7 
 
 		 242 aa  187  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01670  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.99 
 
 		 329 aa  186  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.194324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  44.08 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  45.58 
 
 		 303 aa  186  3e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  42.73 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02380  ABC transporter related  46.33 
 
 		 316 aa  186  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.18 
 
 		 317 aa  185  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  43.13 
 
 		 303 aa  185  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  42.15 
 
 		 314 aa  184  8e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  40.98 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  42.73 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  43.18 
 
 		 299 aa  183  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.98 
 
 		 368 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  42.17 
 
 		 318 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  42.27 
 
 		 305 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  44.44 
 
 		 320 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1805  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.66 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00130612  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1410  ABC transporter, ATP-binding protein  40.93 
 
 		 300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  42.27 
 
 		 305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02610  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.01 
 
 		 341 aa  182  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0386  ABC transporter related  42.41 
 
 		 322 aa  181  7e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1281  ABC transporter related  42.15 
 
 		 300 aa  182  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278405  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  42.15 
 
 		 316 aa  182  7e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>