More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02610 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_02610  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 
341 aa  667    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737934  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2895  ABC transporter related  71.38 
 
 
326 aa  408  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  0.0275551 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1156  ABC transporter related protein  59.81 
 
 
323 aa  316  4e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  hitchhiker  0.000104476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  52.65 
 
 
346 aa  288  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0249  ABC transporter related  55.89 
 
 
336 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  47.02 
 
 
301 aa  237  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  43.89 
 
 
302 aa  231  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  38.11 
 
 
310 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  44.98 
 
 
300 aa  216  5e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  40.95 
 
 
320 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01670  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.87 
 
 
329 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.194324 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  43.88 
 
 
301 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6513  ABC transporter related  48.13 
 
 
409 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0552468 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  39.07 
 
 
305 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0607  ABC transporter related  42.12 
 
 
347 aa  210  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000713126 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1175  ABC transporter related  42.59 
 
 
389 aa  209  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181845  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4839  ABC transporter related protein  45.31 
 
 
322 aa  209  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  40.32 
 
 
305 aa  209  7e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  38.16 
 
 
307 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  44.2 
 
 
326 aa  208  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  42.14 
 
 
311 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  46.55 
 
 
310 aa  206  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  38.59 
 
 
304 aa  206  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  37.83 
 
 
307 aa  205  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  38.54 
 
 
305 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  43.34 
 
 
304 aa  205  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0386  ABC transporter related  46.25 
 
 
322 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1292  ABC transporter related protein  44.72 
 
 
351 aa  204  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  39.87 
 
 
304 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  42.66 
 
 
300 aa  205  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  38.08 
 
 
305 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0751  ABC transporter related  41.78 
 
 
342 aa  203  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  38.61 
 
 
305 aa  203  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  37.95 
 
 
305 aa  202  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  42.76 
 
 
314 aa  202  6e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  44.95 
 
 
311 aa  202  8e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  43.48 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  43.48 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  43.48 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  37.75 
 
 
305 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1161  ABC transporter related  37.5 
 
 
307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  43.48 
 
 
309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  37.29 
 
 
305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  43.55 
 
 
308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  38.14 
 
 
302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 
309 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3425  ABC transporter related protein  44.79 
 
 
340 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458573  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  37.42 
 
 
305 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  37.42 
 
 
305 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  38.49 
 
 
305 aa  199  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.26 
 
 
309 aa  199  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  39.86 
 
 
305 aa  199  7e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6298  ABC transporter related protein  45.75 
 
 
328 aa  199  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  42.95 
 
 
318 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  35.39 
 
 
305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7061  ABC transporter related  38.75 
 
 
297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.505096  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  44.25 
 
 
311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.13 
 
 
299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  43.36 
 
 
300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  37.85 
 
 
303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  37.5 
 
 
303 aa  197  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  38.51 
 
 
309 aa  196  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  45.42 
 
 
301 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  42.69 
 
 
309 aa  196  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  41.45 
 
 
330 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5490  ABC transporter related  34.11 
 
 
301 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.691656  normal  0.086802 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.5 
 
 
331 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  37.5 
 
 
331 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2234  ABC transporter related  42.36 
 
 
323 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.686469  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  37.5 
 
 
303 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  38.21 
 
 
299 aa  194  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  36.42 
 
 
303 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  40.84 
 
 
457 aa  193  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  41.25 
 
 
368 aa  193  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  37.5 
 
 
303 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  37.05 
 
 
306 aa  193  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.15 
 
 
331 aa  192  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  42.9 
 
 
318 aa  192  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  41.22 
 
 
301 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.75 
 
 
350 aa  191  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  43.86 
 
 
355 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.71 
 
 
299 aa  191  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0296  ABC transporter related  41.2 
 
 
949 aa  189  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.11249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  42.28 
 
 
322 aa  189  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.69 
 
 
368 aa  189  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  36.09 
 
 
318 aa  189  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  42.91 
 
 
302 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  41.29 
 
 
897 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  41.61 
 
 
315 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  46.8 
 
 
398 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5295  ABC transporter related  41.57 
 
 
406 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.569145  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  44.01 
 
 
300 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.31 
 
 
324 aa  187  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.39 
 
 
317 aa  187  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  44.01 
 
 
300 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  44.01 
 
 
300 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  41.25 
 
 
373 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.46 
 
 
944 aa  186  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1823  ABC transporter related  38.7 
 
 
309 aa  186  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.554896  normal  0.879198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  41.96 
 
 
348 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>