More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01670 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_01670  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 329 aa  641    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.194324 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1292  ABC transporter related protein  69.07 
 
 		 351 aa  402  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4839  ABC transporter related protein  61.49 
 
 		 322 aa  340  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3425  ABC transporter related protein  60.82 
 
 		 340 aa  333  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458573  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  59.12 
 
 		 318 aa  332  6e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0607  ABC transporter related  55.07 
 
 		 347 aa  316  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000713126 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0386  ABC transporter related  57.98 
 
 		 322 aa  310  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6298  ABC transporter related protein  57.98 
 
 		 328 aa  301  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3301  ABC transporter related protein  55.19 
 
 		 306 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.377119  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0751  ABC transporter related  51.26 
 
 		 342 aa  266  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1175  ABC transporter related  45.27 
 
 		 389 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1206  ABC transporter related  46.62 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.406945  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.18 
 
 		 299 aa  225  8e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  39.54 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  44.84 
 
 		 300 aa  223  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  44.59 
 
 		 301 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2895  ABC transporter related  45.05 
 
 		 326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  0.0275551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  45.02 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.34 
 
 		 299 aa  218  2e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1156  ABC transporter related protein  46.79 
 
 		 323 aa  216  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  hitchhiker  0.000104476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  45.9 
 
 		 301 aa  216  5.9999999999999996e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  45.65 
 
 		 326 aa  214  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02610  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.87 
 
 		 341 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  42.76 
 
 		 304 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  42.16 
 
 		 320 aa  213  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  42.48 
 
 		 302 aa  212  7e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  45.45 
 
 		 300 aa  209  7e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.95 
 
 		 944 aa  208  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  44 
 
 		 968 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6513  ABC transporter related  49.43 
 
 		 409 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0552468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  45.18 
 
 		 897 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0778  ABC transporter related protein  42.3 
 
 		 976 aa  202  8e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  43.97 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5295  ABC transporter related  41.94 
 
 		 406 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.569145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1161  ABC transporter related  37.3 
 
 		 307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4270  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.83 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.071906  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  39.94 
 
 		 346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0296  ABC transporter related  44.11 
 
 		 949 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.11249 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  42.81 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  48.86 
 
 		 876 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0592  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.83 
 
 		 307 aa  197  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4648  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.5 
 
 		 307 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.62 
 
 		 309 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1823  ABC transporter related  40.31 
 
 		 309 aa  195  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.554896  normal  0.879198 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4431  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  35.5 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4774  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  35.5 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0256  ABC transporter related  42.76 
 
 		 948 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0574193 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  35.65 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  36.39 
 
 		 307 aa  194  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  49.07 
 
 		 866 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4661  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.18 
 
 		 307 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4645  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.18 
 
 		 307 aa  192  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4281  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.18 
 
 		 307 aa  192  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2234  ABC transporter related  42.36 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.686469  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2202  ABC transporter related protein  37.17 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817339 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5742  ABC transporter related protein  42.81 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  36.98 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.6 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  36.39 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1721  ABC transporter, ATP-binding protein  34.97 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.847764  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  39.34 
 
 		 303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  36.77 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3933  ABC transporter, ATP-binding protein  37.91 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1438  ABC transporter, ATPase subunit  37.9 
 
 		 310 aa  189  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4660  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  34.85 
 
 		 307 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1410  ABC transporter, ATP-binding protein  38.44 
 
 		 300 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4363  ABC transporter related  34.85 
 
 		 307 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  35.81 
 
 		 309 aa  188  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  35.81 
 
 		 309 aa  188  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.81 
 
 		 309 aa  188  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4010  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 299 aa  188  9e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2125  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.65 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3231  ABC transporter-related protein  34.87 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.87 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  35.87 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  35.87 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1356  ABC transporter related protein  46.26 
 
 		 814 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  38.99 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  35.87 
 
 		 303 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  35.06 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0156  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  42.99 
 
 		 254 aa  186  4e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  36.48 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0642  ABC transporter related  35.1 
 
 		 297 aa  186  5e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0145806  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1281  ABC transporter related  39.16 
 
 		 300 aa  186  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278405  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5490  ABC transporter related  34.64 
 
 		 301 aa  186  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.691656  normal  0.086802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 868 aa  186  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 		 309 aa  185  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02380  ABC transporter related  36.1 
 
 		 316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  40.53 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  33.98 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1475  ABC transporter, ATP-binding protein  36.72 
 
 		 300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1642  ABC transporter related protein  38.87 
 
 		 323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  35.56 
 
 		 303 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1080  ABC transporter-related protein  36.39 
 
 		 300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1248  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  37.38 
 
 		 300 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  35.24 
 
 		 303 aa  182  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0683  ABC transporter related  37.85 
 
 		 316 aa  182  9.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  35.02 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1274  ABC transporter ATP-binding protein  36.39 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  36.39 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>