More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1320 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  100 
 
 
300 aa  593  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  66.45 
 
 
314 aa  386  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  66.22 
 
 
308 aa  378  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  62.75 
 
 
298 aa  359  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  61.2 
 
 
297 aa  338  5e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  58.11 
 
 
309 aa  320  9.999999999999999e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  60.54 
 
 
299 aa  316  4e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  60.88 
 
 
299 aa  311  9e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  55 
 
 
303 aa  306  3e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  67.58 
 
 
242 aa  296  2e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.45 
 
 
350 aa  278  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  51.19 
 
 
311 aa  268  5.9999999999999995e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  49.32 
 
 
306 aa  263  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  51.54 
 
 
308 aa  263  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  47.8 
 
 
301 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  50.85 
 
 
311 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  55.95 
 
 
237 aa  256  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  49.49 
 
 
314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  50 
 
 
304 aa  252  5.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  52.68 
 
 
317 aa  252  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  48.99 
 
 
318 aa  252  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.76 
 
 
317 aa  246  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  46.31 
 
 
316 aa  247  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  47.49 
 
 
330 aa  245  6.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.76 
 
 
324 aa  245  6.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  46.78 
 
 
319 aa  245  8e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  47.96 
 
 
355 aa  245  8e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  46.78 
 
 
315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  47.32 
 
 
373 aa  241  9e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  45.58 
 
 
457 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  46.92 
 
 
298 aa  239  5e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.22 
 
 
368 aa  238  6.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  47.51 
 
 
312 aa  238  8e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  47.81 
 
 
310 aa  237  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  47.3 
 
 
305 aa  236  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.95 
 
 
318 aa  236  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  46.71 
 
 
346 aa  236  4e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  45.64 
 
 
368 aa  236  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  46.78 
 
 
322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  44.41 
 
 
314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  44.75 
 
 
309 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  46.18 
 
 
314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  45.33 
 
 
314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  44.7 
 
 
310 aa  233  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  46.58 
 
 
300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  46.1 
 
 
320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  45.42 
 
 
335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  52.86 
 
 
244 aa  230  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  56.28 
 
 
237 aa  230  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  46.26 
 
 
302 aa  229  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.45 
 
 
319 aa  229  4e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  46.78 
 
 
303 aa  229  5e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  44.95 
 
 
348 aa  227  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  45.08 
 
 
319 aa  227  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  46.2 
 
 
313 aa  227  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  47.96 
 
 
301 aa  226  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  51.61 
 
 
398 aa  226  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  45.27 
 
 
303 aa  226  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  44.03 
 
 
305 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  46.76 
 
 
302 aa  224  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.7 
 
 
252 aa  223  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  47.12 
 
 
314 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  45.79 
 
 
313 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  43.24 
 
 
313 aa  223  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  45.13 
 
 
327 aa  223  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  44.59 
 
 
306 aa  223  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  41.61 
 
 
361 aa  221  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  54.75 
 
 
241 aa  219  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  46.58 
 
 
297 aa  219  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  47.32 
 
 
304 aa  219  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  51.2 
 
 
238 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  45.64 
 
 
309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  44.3 
 
 
324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  44.52 
 
 
328 aa  219  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  44.56 
 
 
300 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  44.56 
 
 
300 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  44.56 
 
 
300 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  45 
 
 
318 aa  214  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  52.31 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  42.18 
 
 
330 aa  212  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  42.57 
 
 
316 aa  212  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  39.35 
 
 
330 aa  212  7e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  50.92 
 
 
337 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  41.69 
 
 
310 aa  209  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  46.96 
 
 
234 aa  207  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.23 
 
 
247 aa  207  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  42.07 
 
 
305 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  41.47 
 
 
305 aa  206  4e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  44.82 
 
 
306 aa  205  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  51.14 
 
 
302 aa  205  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  50.69 
 
 
496 aa  201  9e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  47.58 
 
 
245 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  40.2 
 
 
346 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  42.52 
 
 
301 aa  192  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0156  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  47.89 
 
 
254 aa  192  4e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  41.33 
 
 
320 aa  192  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  42.95 
 
 
326 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2958  ABC transporter related protein  43.87 
 
 
310 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  40.33 
 
 
300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.52 
 
 
264 aa  189  4e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.330888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>