More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3951 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  100 
 
 
300 aa  595  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  89.33 
 
 
301 aa  547  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  65.19 
 
 
300 aa  385  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  50 
 
 
302 aa  290  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  51.34 
 
 
301 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  50.67 
 
 
326 aa  266  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  48.48 
 
 
320 aa  251  8.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  48.83 
 
 
311 aa  251  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02380  ABC transporter related  42.16 
 
 
316 aa  239  5.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1175  ABC transporter related  47.81 
 
 
389 aa  238  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181845  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  46.67 
 
 
310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4010  ABC transporter related protein  44.7 
 
 
299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2125  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  46.41 
 
 
318 aa  231  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  45.05 
 
 
304 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0607  ABC transporter related  53.57 
 
 
347 aa  226  4e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000713126 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  39.74 
 
 
305 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  38.8 
 
 
305 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01670  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.84 
 
 
329 aa  223  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.194324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0751  ABC transporter related  43.37 
 
 
342 aa  223  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  38.46 
 
 
305 aa  223  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 
305 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  51.15 
 
 
304 aa  223  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  38.46 
 
 
305 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  38.46 
 
 
305 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.97 
 
 
299 aa  222  6e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  39.07 
 
 
305 aa  221  8e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3301  ABC transporter related protein  44.74 
 
 
306 aa  222  8e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.377119  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  38.8 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  42.76 
 
 
305 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  40.73 
 
 
304 aa  219  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  38.8 
 
 
305 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  39.46 
 
 
307 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  38.46 
 
 
305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  39.6 
 
 
307 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  38.61 
 
 
305 aa  216  4e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  37.79 
 
 
305 aa  215  8e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0386  ABC transporter related  49.43 
 
 
322 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  39.07 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  35.69 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5742  ABC transporter related protein  45.18 
 
 
319 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  43.23 
 
 
314 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1292  ABC transporter related protein  54.47 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  37.87 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.57 
 
 
299 aa  211  7.999999999999999e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2895  ABC transporter related  42.48 
 
 
326 aa  211  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  0.0275551 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  38.96 
 
 
310 aa  210  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  41.53 
 
 
346 aa  210  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.35 
 
 
312 aa  208  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1161  ABC transporter related  36.88 
 
 
307 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1823  ABC transporter related  41.64 
 
 
309 aa  207  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.554896  normal  0.879198 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  36.54 
 
 
299 aa  207  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  36.15 
 
 
318 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  42.96 
 
 
316 aa  206  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  37.21 
 
 
309 aa  206  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  48.26 
 
 
361 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1206  ABC transporter related  45.18 
 
 
302 aa  206  5e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.406945  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5295  ABC transporter related  41.76 
 
 
406 aa  206  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.569145  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  40.75 
 
 
306 aa  205  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02610  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.66 
 
 
341 aa  205  9e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737934  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2234  ABC transporter related  48.84 
 
 
323 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.686469  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4839  ABC transporter related protein  43.56 
 
 
322 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  41.28 
 
 
314 aa  204  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  42.38 
 
 
328 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  41.47 
 
 
301 aa  204  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2348  ABC transporter related  34.93 
 
 
306 aa  203  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  42.57 
 
 
306 aa  203  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  37.7 
 
 
346 aa  202  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  42.42 
 
 
313 aa  202  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  42.95 
 
 
313 aa  202  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7061  ABC transporter related  36.96 
 
 
297 aa  202  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.505096  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  37.46 
 
 
306 aa  202  6e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  42.16 
 
 
305 aa  201  9e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  41.9 
 
 
318 aa  201  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6513  ABC transporter related  50 
 
 
409 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0552468 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  41.58 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  44.37 
 
 
314 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  44.18 
 
 
305 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  37.04 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.93 
 
 
318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.33 
 
 
331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  41.33 
 
 
308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  46.4 
 
 
315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0249  ABC transporter related  41.94 
 
 
336 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.33 
 
 
331 aa  199  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  35.33 
 
 
331 aa  199  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  36.15 
 
 
309 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  35.33 
 
 
303 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  39.33 
 
 
309 aa  200  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1156  ABC transporter related protein  45.49 
 
 
323 aa  199  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  hitchhiker  0.000104476 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  35.33 
 
 
303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  40.73 
 
 
305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  44.34 
 
 
230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  42.61 
 
 
316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  35.23 
 
 
303 aa  199  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  36.15 
 
 
309 aa  199  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  40.94 
 
 
319 aa  199  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  38.82 
 
 
315 aa  199  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3425  ABC transporter related protein  44.69 
 
 
340 aa  199  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458573  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  40.26 
 
 
298 aa  198  7.999999999999999e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  43.81 
 
 
304 aa  198  9e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>