More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0751 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0751  ABC transporter related  100 
 
 
342 aa  663    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  52.6 
 
 
318 aa  281  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4839  ABC transporter related protein  50.31 
 
 
322 aa  276  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01670  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.26 
 
 
329 aa  266  5e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.194324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0386  ABC transporter related  60 
 
 
322 aa  263  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1292  ABC transporter related protein  60.33 
 
 
351 aa  261  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0607  ABC transporter related  49.55 
 
 
347 aa  258  9e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000713126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6298  ABC transporter related protein  49.84 
 
 
328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3425  ABC transporter related protein  52.17 
 
 
340 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458573  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3301  ABC transporter related protein  52.23 
 
 
306 aa  238  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.377119  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  45.67 
 
 
301 aa  225  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  47.06 
 
 
326 aa  223  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  43.37 
 
 
300 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1206  ABC transporter related  47.21 
 
 
302 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.406945  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  46.38 
 
 
311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  39.38 
 
 
320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  41.25 
 
 
302 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1175  ABC transporter related  40.05 
 
 
389 aa  216  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181845  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.81 
 
 
299 aa  209  4e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 
310 aa  209  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5295  ABC transporter related  40.54 
 
 
406 aa  206  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.569145  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02610  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.78 
 
 
341 aa  203  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737934  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1156  ABC transporter related protein  47.02 
 
 
323 aa  203  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  hitchhiker  0.000104476 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  43.49 
 
 
304 aa  202  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.07 
 
 
944 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  37.01 
 
 
318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02380  ABC transporter related  39.14 
 
 
316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  43.89 
 
 
310 aa  200  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  40.79 
 
 
305 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 
305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  41.78 
 
 
301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  40.89 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  36.69 
 
 
305 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2895  ABC transporter related  41.99 
 
 
326 aa  197  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  0.0275551 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  41.58 
 
 
302 aa  197  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  38.8 
 
 
305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  37.66 
 
 
305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4010  ABC transporter related protein  43.24 
 
 
299 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2125  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  37.54 
 
 
305 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
305 aa  195  9e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  42 
 
 
968 aa  195  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  37.14 
 
 
305 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  37.14 
 
 
305 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1281  ABC transporter related  38.41 
 
 
300 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278405  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1161  ABC transporter related  38.26 
 
 
307 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0296  ABC transporter related  43.77 
 
 
949 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.11249 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  36.04 
 
 
309 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  36.04 
 
 
309 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  36.04 
 
 
309 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0256  ABC transporter related  43.43 
 
 
948 aa  193  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0574193 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  37.25 
 
 
305 aa  192  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  50.22 
 
 
868 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 
309 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  36.3 
 
 
309 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  40.32 
 
 
301 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  34.8 
 
 
303 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3933  ABC transporter, ATP-binding protein  38.41 
 
 
300 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  37.29 
 
 
309 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  36.3 
 
 
309 aa  190  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1475  ABC transporter, ATP-binding protein  38.41 
 
 
300 aa  189  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  36.18 
 
 
307 aa  189  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  33.43 
 
 
331 aa  189  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1823  ABC transporter related  41.03 
 
 
309 aa  189  5e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.554896  normal  0.879198 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  36.69 
 
 
305 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  35.35 
 
 
303 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6513  ABC transporter related  40.66 
 
 
409 aa  189  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0552468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  48.03 
 
 
866 aa  189  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1410  ABC transporter, ATP-binding protein  38.08 
 
 
300 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5490  ABC transporter related  32.03 
 
 
301 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.691656  normal  0.086802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.97 
 
 
309 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  44.37 
 
 
897 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1274  ABC transporter ATP-binding protein  38.16 
 
 
300 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  38.16 
 
 
300 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1248  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  37.21 
 
 
300 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1517  ABC transporter, ATP-binding protein  37.21 
 
 
300 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  37.79 
 
 
305 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  40.27 
 
 
304 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  35.14 
 
 
303 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1448  ABC transporter, ATP-binding protein  36.79 
 
 
300 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000281318 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.13 
 
 
331 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  35.35 
 
 
303 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  33.13 
 
 
331 aa  186  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.36 
 
 
324 aa  186  4e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  38.71 
 
 
305 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  35.88 
 
 
307 aa  186  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  34.8 
 
 
305 aa  186  5e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  35.35 
 
 
303 aa  186  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  36.33 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.13 
 
 
299 aa  183  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  41.2 
 
 
304 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  41.69 
 
 
1010 aa  182  9.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  36.72 
 
 
304 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  48.66 
 
 
876 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  49.56 
 
 
258 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  39.74 
 
 
309 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1438  ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 
310 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1080  ABC transporter-related protein  38.57 
 
 
300 aa  179  7e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  39.68 
 
 
322 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  40.13 
 
 
355 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1356  ABC transporter related protein  46.98 
 
 
814 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>