More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3425 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3425  ABC transporter related protein  100 
 
 
340 aa  659    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458573  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01670  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  63.02 
 
 
329 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.194324 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  61.32 
 
 
318 aa  361  9e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1292  ABC transporter related protein  62.65 
 
 
351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4839  ABC transporter related protein  60.94 
 
 
322 aa  350  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0386  ABC transporter related  63.49 
 
 
322 aa  347  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0607  ABC transporter related  60.3 
 
 
347 aa  347  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000713126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6298  ABC transporter related protein  57.52 
 
 
328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0751  ABC transporter related  52.84 
 
 
342 aa  272  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3301  ABC transporter related protein  52.9 
 
 
306 aa  257  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.377119  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  48.22 
 
 
301 aa  242  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  49.36 
 
 
326 aa  235  7e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  41.86 
 
 
310 aa  235  8e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  46.31 
 
 
302 aa  235  9e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2895  ABC transporter related  47.23 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  0.0275551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02610  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.79 
 
 
341 aa  227  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737934  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  46.01 
 
 
310 aa  225  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1206  ABC transporter related  48.23 
 
 
302 aa  224  2e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.406945  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0296  ABC transporter related  47.23 
 
 
949 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.11249 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.89 
 
 
944 aa  224  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  47.7 
 
 
300 aa  223  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  47.51 
 
 
311 aa  223  4.9999999999999996e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1175  ABC transporter related  44.24 
 
 
389 aa  222  6e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181845  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1156  ABC transporter related protein  49.52 
 
 
323 aa  221  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  hitchhiker  0.000104476 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0256  ABC transporter related  45.39 
 
 
948 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0574193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  46.23 
 
 
301 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  45.69 
 
 
300 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  44.74 
 
 
968 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  47.1 
 
 
897 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.55 
 
 
299 aa  212  9e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  37.62 
 
 
302 aa  212  9e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6513  ABC transporter related  45.57 
 
 
409 aa  212  9e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0552468 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  54.05 
 
 
876 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  42.57 
 
 
346 aa  209  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.58 
 
 
299 aa  209  8e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5295  ABC transporter related  42.49 
 
 
406 aa  209  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.569145  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  42.38 
 
 
304 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  52.17 
 
 
866 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0778  ABC transporter related protein  44.84 
 
 
976 aa  203  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  37.95 
 
 
307 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.04 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  39.03 
 
 
318 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  48.33 
 
 
868 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  40.72 
 
 
320 aa  200  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  37.95 
 
 
307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  39.27 
 
 
303 aa  199  5e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1823  ABC transporter related  41.96 
 
 
309 aa  199  6e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.554896  normal  0.879198 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  38.66 
 
 
306 aa  199  7e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3933  ABC transporter, ATP-binding protein  39.01 
 
 
300 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2234  ABC transporter related  43.92 
 
 
323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.686469  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 
309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  39.23 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  39.23 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  39.23 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  42.76 
 
 
1010 aa  196  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1410  ABC transporter, ATP-binding protein  38.3 
 
 
300 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  44.26 
 
 
304 aa  196  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  40.39 
 
 
304 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 
309 aa  195  9e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1281  ABC transporter related  39.36 
 
 
300 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278405  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02380  ABC transporter related  37.1 
 
 
316 aa  195  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.02 
 
 
309 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  35.97 
 
 
299 aa  194  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  37.88 
 
 
305 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  42.12 
 
 
318 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  35.41 
 
 
305 aa  194  3e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1475  ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 
300 aa  193  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1161  ABC transporter related  36.83 
 
 
307 aa  193  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1274  ABC transporter ATP-binding protein  39.36 
 
 
300 aa  192  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  39.36 
 
 
300 aa  192  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565117  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3231  ABC transporter-related protein  35.76 
 
 
312 aa  192  7e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  42.3 
 
 
457 aa  192  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  38.69 
 
 
305 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1356  ABC transporter related protein  50.21 
 
 
814 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1517  ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 
300 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4648  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  34.54 
 
 
307 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1080  ABC transporter-related protein  37.37 
 
 
300 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  38.49 
 
 
309 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4270  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.08 
 
 
307 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.071906  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  36.62 
 
 
331 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1248  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  39.36 
 
 
300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  37.33 
 
 
303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  40 
 
 
305 aa  189  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1448  ABC transporter, ATP-binding protein  39.01 
 
 
300 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000281318 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  36.28 
 
 
303 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  37.33 
 
 
303 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4431  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  34.54 
 
 
307 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  43.62 
 
 
300 aa  189  7e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4774  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  34.54 
 
 
307 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  37 
 
 
303 aa  189  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.28 
 
 
331 aa  189  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4281  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  34.75 
 
 
307 aa  189  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4661  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.08 
 
 
307 aa  189  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  36.28 
 
 
331 aa  189  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.75 
 
 
324 aa  188  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  36.28 
 
 
303 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  41.91 
 
 
303 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5742  ABC transporter related protein  42.68 
 
 
319 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4363  ABC transporter related  34.21 
 
 
307 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>