More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1175 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1175  ABC transporter related  100 
 
 		 389 aa  763    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5295  ABC transporter related  71.35 
 
 		 406 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.569145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  48.6 
 
 		 310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6513  ABC transporter related  47.32 
 
 		 409 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0552468 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01670  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.27 
 
 		 329 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.194324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  47.81 
 
 		 300 aa  242  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  47.81 
 
 		 301 aa  239  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  45.62 
 
 		 301 aa  239  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  44.34 
 
 		 318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  44.17 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0607  ABC transporter related  43.98 
 
 		 347 aa  224  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000713126 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1292  ABC transporter related protein  46.43 
 
 		 351 aa  224  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  44.16 
 
 		 326 aa  223  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  41.51 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0751  ABC transporter related  40.6 
 
 		 342 aa  220  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0386  ABC transporter related  51.85 
 
 		 322 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3425  ABC transporter related protein  45.17 
 
 		 340 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458573  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02610  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.5 
 
 		 341 aa  211  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6298  ABC transporter related protein  46.18 
 
 		 328 aa  209  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  43.31 
 
 		 314 aa  209  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2895  ABC transporter related  52.4 
 
 		 326 aa  208  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  0.0275551 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.61 
 
 		 299 aa  208  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2234  ABC transporter related  49.59 
 
 		 323 aa  208  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.686469  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  41.38 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  50 
 
 		 320 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3301  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 306 aa  206  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.377119  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  39.88 
 
 		 346 aa  206  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  42.77 
 
 		 311 aa  205  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1206  ABC transporter related  48.23 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.406945  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  38.51 
 
 		 306 aa  204  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  43.67 
 
 		 319 aa  203  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4839  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 322 aa  203  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  51.57 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  34.47 
 
 		 299 aa  201  3e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  35.11 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  42.41 
 
 		 311 aa  199  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  46.78 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  36.71 
 
 		 307 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  40.23 
 
 		 346 aa  196  7e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4120  ABC transporter related protein  40.5 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  38.02 
 
 		 337 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  45.76 
 
 		 309 aa  195  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  47.19 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  35.19 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  45.28 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  41.77 
 
 		 320 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  40.23 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  38.68 
 
 		 315 aa  193  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  35.31 
 
 		 303 aa  193  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  40.98 
 
 		 328 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  45.52 
 
 		 318 aa  193  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1156  ABC transporter related protein  50.84 
 
 		 323 aa  193  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  hitchhiker  0.000104476 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  36.39 
 
 		 307 aa  193  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  42.09 
 
 		 330 aa  192  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4010  ABC transporter related protein  41.82 
 
 		 299 aa  192  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2125  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5742  ABC transporter related protein  42.14 
 
 		 319 aa  192  8e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  40.9 
 
 		 313 aa  192  9e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  36.59 
 
 		 318 aa  192  9e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  45.33 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  40 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  45.33 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  43.17 
 
 		 301 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  45.33 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  41.95 
 
 		 311 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  44.89 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  36.39 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  36.22 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  45.33 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  37.26 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  39.88 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  44.89 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  34.8 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  42.68 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  38.92 
 
 		 312 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 305 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  43.85 
 
 		 897 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1823  ABC transporter related  39.25 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.554896  normal  0.879198 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02380  ABC transporter related  36.06 
 
 		 316 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  40.38 
 
 		 306 aa  191  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  41.82 
 
 		 300 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  35.31 
 
 		 303 aa  190  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  41.82 
 
 		 300 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  41.82 
 
 		 300 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  41.14 
 
 		 322 aa  190  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.74 
 
 		 368 aa  190  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.31 
 
 		 331 aa  189  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  35.31 
 
 		 331 aa  189  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  35.31 
 
 		 303 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  35.58 
 
 		 303 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.95 
 
 		 319 aa  188  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  36.65 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 		 331 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  45.21 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  44.89 
 
 		 305 aa  188  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  40.38 
 
 		 335 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  35.13 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.22 
 
 		 299 aa  188  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  51.21 
 
 		 309 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  45.58 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>