More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6513 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6513  ABC transporter related  100 
 
 
409 aa  788    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0552468 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1175  ABC transporter related  46.92 
 
 
389 aa  259  9e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181845  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5295  ABC transporter related  47.38 
 
 
406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.569145  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  48.91 
 
 
310 aa  253  6e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1292  ABC transporter related protein  50.15 
 
 
351 aa  228  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  42.77 
 
 
302 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  53.85 
 
 
301 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4120  ABC transporter related protein  46.44 
 
 
325 aa  218  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  56.94 
 
 
326 aa  217  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02610  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.33 
 
 
341 aa  211  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737934  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.52 
 
 
299 aa  208  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01670  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.43 
 
 
329 aa  207  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.194324 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  54.82 
 
 
318 aa  207  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  35.78 
 
 
310 aa  207  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  52.51 
 
 
301 aa  206  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2895  ABC transporter related  42.25 
 
 
326 aa  206  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  0.0275551 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  48.03 
 
 
320 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0386  ABC transporter related  48.85 
 
 
322 aa  203  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  50.67 
 
 
300 aa  202  9e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0607  ABC transporter related  42.41 
 
 
347 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000713126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  50 
 
 
300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5742  ABC transporter related protein  43.84 
 
 
319 aa  199  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  34.57 
 
 
302 aa  199  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  38.01 
 
 
309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  38.01 
 
 
309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  40 
 
 
314 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.01 
 
 
309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  42.24 
 
 
311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.69 
 
 
309 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  46.38 
 
 
304 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.75 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.38 
 
 
309 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  38.53 
 
 
309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1156  ABC transporter related protein  53.72 
 
 
323 aa  196  5.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  hitchhiker  0.000104476 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.38 
 
 
309 aa  196  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  42.77 
 
 
314 aa  196  7e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  37.54 
 
 
305 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.38 
 
 
309 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3425  ABC transporter related protein  45.4 
 
 
340 aa  196  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458573  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  41.8 
 
 
303 aa  196  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  43.35 
 
 
305 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  36.92 
 
 
305 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  43.35 
 
 
305 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  43.35 
 
 
305 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  47.35 
 
 
304 aa  195  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 
305 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  43.35 
 
 
305 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  36.45 
 
 
318 aa  193  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  46.22 
 
 
457 aa  192  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  43.35 
 
 
305 aa  192  8e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.15 
 
 
368 aa  192  8e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.27 
 
 
331 aa  192  9e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  43.35 
 
 
305 aa  192  9e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  34.27 
 
 
331 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  34.78 
 
 
303 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  34.27 
 
 
303 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  34.27 
 
 
303 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 
305 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  33.96 
 
 
331 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  48.26 
 
 
311 aa  190  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  39.5 
 
 
305 aa  190  4e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0751  ABC transporter related  40.66 
 
 
342 aa  189  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2234  ABC transporter related  49.34 
 
 
323 aa  189  7e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.686469  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  42.01 
 
 
311 aa  189  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  42.49 
 
 
305 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6298  ABC transporter related protein  45.55 
 
 
328 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  33.64 
 
 
303 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  33.85 
 
 
303 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  40.18 
 
 
322 aa  188  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  46.52 
 
 
346 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4755  ABC transporter, ATP-binding protein  41.81 
 
 
242 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  33.96 
 
 
299 aa  187  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  38.48 
 
 
301 aa  186  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2348  ABC transporter related  40.55 
 
 
306 aa  186  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4839  ABC transporter related protein  49.17 
 
 
322 aa  186  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5490  ABC transporter related  40.09 
 
 
301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.691656  normal  0.086802 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.59 
 
 
299 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  45 
 
 
230 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.51 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  46.7 
 
 
398 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  38.44 
 
 
305 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  36.72 
 
 
314 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  47.42 
 
 
320 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  39.88 
 
 
302 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  48.03 
 
 
300 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  39.18 
 
 
355 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  34.58 
 
 
305 aa  181  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1823  ABC transporter related  43.75 
 
 
309 aa  181  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.554896  normal  0.879198 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3301  ABC transporter related protein  47.3 
 
 
306 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.377119  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1281  ABC transporter related  34.69 
 
 
300 aa  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278405  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  37.65 
 
 
319 aa  180  4.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  39.88 
 
 
300 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  39.88 
 
 
300 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  39.88 
 
 
300 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1206  ABC transporter related  38.82 
 
 
302 aa  179  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.406945  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  46.99 
 
 
876 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  44.44 
 
 
314 aa  178  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  35.59 
 
 
315 aa  178  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1475  ABC transporter, ATP-binding protein  35.94 
 
 
300 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  32.92 
 
 
307 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>