More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0539 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  100 
 
 
300 aa  594  1e-169  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  100 
 
 
300 aa  594  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  100 
 
 
300 aa  594  1e-169  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  69.02 
 
 
301 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  67.43 
 
 
306 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  65.36 
 
 
368 aa  381  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  65.79 
 
 
373 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  62.88 
 
 
317 aa  379  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  62.67 
 
 
355 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  62.79 
 
 
322 aa  361  9e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  60.78 
 
 
312 aa  360  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  61.74 
 
 
306 aa  358  5e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  62.38 
 
 
310 aa  358  8e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  61.54 
 
 
335 aa  355  5e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  60.54 
 
 
306 aa  350  2e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  61.54 
 
 
314 aa  348  5e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  63.12 
 
 
319 aa  348  7e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  58.53 
 
 
320 aa  342  4e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  59.46 
 
 
301 aa  341  8e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  58.19 
 
 
315 aa  341  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.52 
 
 
318 aa  338  5.9999999999999996e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  59.2 
 
 
324 aa  337  9.999999999999999e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  60.13 
 
 
314 aa  334  1e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  57.05 
 
 
346 aa  333  2e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  59.2 
 
 
310 aa  333  3e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  57.81 
 
 
348 aa  332  5e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  54.43 
 
 
361 aa  331  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  57.19 
 
 
314 aa  330  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  59.26 
 
 
316 aa  328  5.0000000000000004e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  61.28 
 
 
305 aa  326  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  59.2 
 
 
310 aa  325  5e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  60.2 
 
 
328 aa  325  7e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  54.18 
 
 
313 aa  324  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  57.19 
 
 
309 aa  323  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  57 
 
 
313 aa  322  4e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  58.33 
 
 
318 aa  318  7e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  56.86 
 
 
303 aa  318  9e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  54.18 
 
 
314 aa  317  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  56.44 
 
 
314 aa  316  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  59.06 
 
 
302 aa  316  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  57.05 
 
 
309 aa  315  5e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  58.05 
 
 
308 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  57.67 
 
 
304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  57.38 
 
 
302 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  54.85 
 
 
318 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  54.64 
 
 
313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  57.1 
 
 
305 aa  302  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  56.23 
 
 
305 aa  302  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  56.15 
 
 
303 aa  302  5.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  52.67 
 
 
319 aa  300  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  59.06 
 
 
304 aa  293  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  54.45 
 
 
330 aa  288  7e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  53.36 
 
 
337 aa  285  9e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  51.89 
 
 
316 aa  280  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  50 
 
 
327 aa  278  7e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.83 
 
 
324 aa  278  8e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  49.48 
 
 
457 aa  274  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.48 
 
 
368 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  51.18 
 
 
330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  51.01 
 
 
311 aa  268  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  51.01 
 
 
298 aa  266  4e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  45.18 
 
 
330 aa  264  1e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  60.55 
 
 
252 aa  260  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  50.86 
 
 
311 aa  259  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  58.7 
 
 
398 aa  258  9e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  58.9 
 
 
241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  49.83 
 
 
300 aa  252  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  63.77 
 
 
244 aa  249  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  48.31 
 
 
297 aa  246  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.63 
 
 
319 aa  245  6e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  58.22 
 
 
234 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  56.34 
 
 
238 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  46.23 
 
 
302 aa  242  6e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  45.54 
 
 
305 aa  237  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  44.93 
 
 
316 aa  235  7e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  51.71 
 
 
496 aa  235  8e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  56.42 
 
 
258 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  49.66 
 
 
297 aa  233  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  49.32 
 
 
314 aa  228  9e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.92 
 
 
350 aa  228  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  49.66 
 
 
308 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  54.55 
 
 
242 aa  227  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  46.33 
 
 
307 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  53.15 
 
 
237 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  46.44 
 
 
309 aa  223  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  46.05 
 
 
298 aa  219  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.88 
 
 
247 aa  218  7.999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  44.56 
 
 
300 aa  218  7.999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  49.32 
 
 
299 aa  218  8.999999999999998e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  54.05 
 
 
237 aa  216  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  49.32 
 
 
299 aa  216  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  52.34 
 
 
245 aa  215  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  44.9 
 
 
303 aa  215  8e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2895  ABC transporter related  46.74 
 
 
326 aa  208  9e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  0.0275551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2408  ABC transporter related  53.88 
 
 
232 aa  206  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799647  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  51.64 
 
 
301 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  54.55 
 
 
317 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  44.86 
 
 
301 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  39.86 
 
 
302 aa  203  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  46.26 
 
 
310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>