More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5295 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5295  ABC transporter related  100 
 
 
406 aa  790    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.569145  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1175  ABC transporter related  71.63 
 
 
389 aa  478  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181845  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6513  ABC transporter related  47.67 
 
 
409 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0552468 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  46.13 
 
 
310 aa  268  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  43.15 
 
 
301 aa  239  8e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  44.12 
 
 
301 aa  234  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  42.49 
 
 
318 aa  231  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  43.82 
 
 
300 aa  228  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  42.35 
 
 
300 aa  226  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0751  ABC transporter related  40.81 
 
 
342 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  40.06 
 
 
302 aa  223  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1292  ABC transporter related protein  43.02 
 
 
351 aa  223  4e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01670  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.94 
 
 
329 aa  223  4e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.194324 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0607  ABC transporter related  41.31 
 
 
347 aa  223  6e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000713126 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0386  ABC transporter related  49.42 
 
 
322 aa  222  9e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02610  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.15 
 
 
341 aa  215  9e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737934  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  43.25 
 
 
326 aa  215  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3301  ABC transporter related protein  42.43 
 
 
306 aa  213  7e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.377119  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2895  ABC transporter related  49.2 
 
 
326 aa  211  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  0.0275551 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4120  ABC transporter related protein  41.52 
 
 
325 aa  210  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  45.88 
 
 
304 aa  210  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3425  ABC transporter related protein  42.49 
 
 
340 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458573  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  40.77 
 
 
314 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2234  ABC transporter related  46.59 
 
 
323 aa  206  5e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.686469  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  42.51 
 
 
305 aa  206  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  39.19 
 
 
311 aa  203  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6298  ABC transporter related protein  42.74 
 
 
328 aa  203  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  34.01 
 
 
310 aa  202  9e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  37.54 
 
 
320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4755  ABC transporter, ATP-binding protein  44.17 
 
 
242 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  36.95 
 
 
306 aa  199  7.999999999999999e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1206  ABC transporter related  37.91 
 
 
302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.406945  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4839  ABC transporter related protein  40.22 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  39.94 
 
 
300 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  39.94 
 
 
300 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  39.94 
 
 
300 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  38.76 
 
 
304 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  40.36 
 
 
319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  32.55 
 
 
302 aa  197  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.41 
 
 
299 aa  196  6e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  32.06 
 
 
299 aa  194  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  38.39 
 
 
320 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  40.06 
 
 
301 aa  193  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  42.55 
 
 
318 aa  193  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1156  ABC transporter related protein  41.31 
 
 
323 aa  192  7e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  hitchhiker  0.000104476 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  34.73 
 
 
303 aa  192  9e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  38.1 
 
 
346 aa  192  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.14 
 
 
331 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  33.14 
 
 
331 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  39.53 
 
 
309 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  37.5 
 
 
315 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  40 
 
 
318 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  38.21 
 
 
306 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5742  ABC transporter related protein  46.89 
 
 
319 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  34.12 
 
 
305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  39.39 
 
 
311 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  34.43 
 
 
303 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  46.09 
 
 
258 aa  190  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  38.94 
 
 
328 aa  190  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  40.54 
 
 
302 aa  190  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  37.98 
 
 
314 aa  189  5e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  44.96 
 
 
398 aa  189  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  37.46 
 
 
355 aa  189  8e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  37.46 
 
 
312 aa  189  9e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  41.04 
 
 
305 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  44.35 
 
 
346 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  41.04 
 
 
305 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  32.58 
 
 
331 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  41.04 
 
 
305 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  41.04 
 
 
305 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  41.7 
 
 
305 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  33.83 
 
 
303 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  42.63 
 
 
230 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.92 
 
 
324 aa  188  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  41.04 
 
 
305 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  38.74 
 
 
308 aa  188  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  33.83 
 
 
303 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.17 
 
 
299 aa  187  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  41.43 
 
 
305 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4010  ABC transporter related protein  40.23 
 
 
299 aa  188  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2125  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  38.89 
 
 
311 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  37.91 
 
 
322 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1823  ABC transporter related  37.94 
 
 
309 aa  187  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.554896  normal  0.879198 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  33.83 
 
 
303 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  35.39 
 
 
298 aa  187  4e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  34.9 
 
 
309 aa  186  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  41.04 
 
 
305 aa  186  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  37.8 
 
 
310 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  40 
 
 
303 aa  186  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  41.5 
 
 
305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.95 
 
 
309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  46 
 
 
897 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  37.76 
 
 
318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  40.71 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.7 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.58 
 
 
309 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  36.23 
 
 
457 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5490  ABC transporter related  31.25 
 
 
301 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.691656  normal  0.086802 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  40.94 
 
 
305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  37.27 
 
 
302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.196973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>