More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2964 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  100 
 
 
319 aa  637    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  72.88 
 
 
348 aa  458  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  68.23 
 
 
335 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  65.12 
 
 
320 aa  385  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  68.44 
 
 
301 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  60.19 
 
 
318 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  63.79 
 
 
306 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  63.93 
 
 
373 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  61.18 
 
 
368 aa  371  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  60.9 
 
 
315 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  60.63 
 
 
317 aa  368  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  63.04 
 
 
314 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  60.54 
 
 
314 aa  364  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  61.2 
 
 
316 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  63.97 
 
 
355 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  63.21 
 
 
314 aa  363  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  61.51 
 
 
318 aa  356  2.9999999999999997e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  61.69 
 
 
324 aa  355  5e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  59.01 
 
 
346 aa  353  2e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  62.87 
 
 
314 aa  353  2e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  60.58 
 
 
313 aa  350  1e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  57.01 
 
 
361 aa  350  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  63.88 
 
 
328 aa  349  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  63.12 
 
 
300 aa  348  8e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  63.12 
 
 
300 aa  348  8e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  63.12 
 
 
300 aa  348  8e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  61.18 
 
 
306 aa  346  3e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  58.92 
 
 
313 aa  346  4e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  59.03 
 
 
310 aa  345  4e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  57.93 
 
 
313 aa  345  6e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  62.21 
 
 
314 aa  345  7e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  59.8 
 
 
304 aa  345  8e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  61.62 
 
 
305 aa  343  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  61.2 
 
 
310 aa  343  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  57.64 
 
 
319 aa  341  1e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  61.2 
 
 
310 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  58.36 
 
 
312 aa  337  9.999999999999999e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  59.03 
 
 
308 aa  335  5e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  58.75 
 
 
309 aa  335  7.999999999999999e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  60.4 
 
 
309 aa  330  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  57.62 
 
 
322 aa  330  3e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  59.27 
 
 
301 aa  329  4e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  60.54 
 
 
302 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  55.18 
 
 
318 aa  317  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  53.19 
 
 
327 aa  315  5e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  57.38 
 
 
302 aa  315  6e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  58.28 
 
 
305 aa  312  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  58.28 
 
 
306 aa  311  6.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  56.67 
 
 
303 aa  311  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  55.52 
 
 
303 aa  303  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  49.58 
 
 
398 aa  302  5.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  55.07 
 
 
305 aa  298  9e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  55.7 
 
 
337 aa  294  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  53.26 
 
 
316 aa  293  4e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  59.53 
 
 
304 aa  290  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  52.45 
 
 
311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  62.1 
 
 
252 aa  281  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  44.63 
 
 
330 aa  278  8e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  50 
 
 
330 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  51.4 
 
 
311 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  50.34 
 
 
330 aa  271  9e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  48.67 
 
 
241 aa  268  8.999999999999999e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.34 
 
 
368 aa  263  4e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  49.14 
 
 
300 aa  262  4.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.08 
 
 
324 aa  259  4e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  60.91 
 
 
234 aa  257  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.97 
 
 
319 aa  257  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  49.16 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  43.81 
 
 
457 aa  248  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  47.08 
 
 
305 aa  247  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  49.83 
 
 
308 aa  245  6.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  46.78 
 
 
300 aa  245  9e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  62.5 
 
 
244 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  49.83 
 
 
302 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  50.17 
 
 
314 aa  242  6e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  50.17 
 
 
297 aa  239  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  46.6 
 
 
298 aa  239  6.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  47.81 
 
 
297 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  47.83 
 
 
307 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  54.85 
 
 
238 aa  232  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.43 
 
 
350 aa  229  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  49.83 
 
 
299 aa  230  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  49.17 
 
 
299 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  57.84 
 
 
258 aa  226  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  51.01 
 
 
496 aa  226  5.0000000000000005e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  55.09 
 
 
242 aa  221  9e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  50.9 
 
 
245 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  45.61 
 
 
309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  44.75 
 
 
303 aa  219  5e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  42.91 
 
 
316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  53.95 
 
 
237 aa  212  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.5 
 
 
247 aa  211  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  56.06 
 
 
317 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  43.32 
 
 
301 aa  206  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.64 
 
 
264 aa  202  5e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.330888  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1175  ABC transporter related  43.67 
 
 
389 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181845  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  40.94 
 
 
300 aa  199  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  42.09 
 
 
301 aa  199  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  40.79 
 
 
304 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0751  ABC transporter related protein  47.91 
 
 
251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>