More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2130 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  100 
 
 
305 aa  592  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  61.18 
 
 
306 aa  359  3e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  60.94 
 
 
317 aa  356  1.9999999999999998e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  57.1 
 
 
315 aa  349  3e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  61.62 
 
 
319 aa  348  6e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  57.91 
 
 
335 aa  345  4e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  62.67 
 
 
328 aa  345  7e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  59.93 
 
 
314 aa  343  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  59.93 
 
 
373 aa  344  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.52 
 
 
318 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  58.25 
 
 
355 aa  342  4e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  60.4 
 
 
313 aa  341  9e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  61.95 
 
 
314 aa  340  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  61.74 
 
 
310 aa  338  5.9999999999999996e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  61.28 
 
 
300 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  61.28 
 
 
300 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  61.28 
 
 
300 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  57.95 
 
 
368 aa  334  1e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  60.27 
 
 
302 aa  333  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  59.33 
 
 
306 aa  332  4e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  58.42 
 
 
322 aa  332  6e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  58.09 
 
 
310 aa  332  7.000000000000001e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  58.59 
 
 
314 aa  331  8e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  55.96 
 
 
318 aa  329  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  57.33 
 
 
309 aa  328  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  58.92 
 
 
303 aa  327  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  59.27 
 
 
301 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  57.86 
 
 
348 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  57.1 
 
 
346 aa  326  3e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  58.92 
 
 
324 aa  325  5e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  54.61 
 
 
316 aa  325  7e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  61.74 
 
 
304 aa  324  1e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  55.22 
 
 
320 aa  324  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  52.91 
 
 
361 aa  323  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  58.03 
 
 
309 aa  321  9.000000000000001e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  54.43 
 
 
312 aa  321  9.000000000000001e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  53.87 
 
 
314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  58.92 
 
 
301 aa  319  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  57.14 
 
 
305 aa  318  7e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  53.54 
 
 
319 aa  316  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  59.2 
 
 
305 aa  315  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  57.58 
 
 
308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  56.04 
 
 
302 aa  312  5.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  59.41 
 
 
318 aa  311  5.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  54.39 
 
 
330 aa  310  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  62.96 
 
 
304 aa  310  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  57.62 
 
 
306 aa  308  5e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  66.39 
 
 
398 aa  301  6.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  53.49 
 
 
313 aa  300  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  51.16 
 
 
313 aa  301  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  54.75 
 
 
314 aa  300  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  54 
 
 
310 aa  299  5e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  54.42 
 
 
316 aa  298  7e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  55.82 
 
 
311 aa  294  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  54.88 
 
 
303 aa  293  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  53.63 
 
 
337 aa  290  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  51.47 
 
 
327 aa  281  8.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  64.38 
 
 
252 aa  278  6e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  50.65 
 
 
330 aa  275  6e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  52.92 
 
 
311 aa  275  7e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  48.67 
 
 
457 aa  273  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  63.76 
 
 
241 aa  271  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.14 
 
 
324 aa  268  7e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  50.5 
 
 
298 aa  265  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.67 
 
 
368 aa  261  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.32 
 
 
319 aa  253  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  42.07 
 
 
330 aa  253  3e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  60.75 
 
 
244 aa  250  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  49.31 
 
 
300 aa  250  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  48.83 
 
 
297 aa  250  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  47.64 
 
 
300 aa  245  6.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  46.44 
 
 
298 aa  239  5e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  46.64 
 
 
305 aa  238  8e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  49.66 
 
 
314 aa  238  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  48.28 
 
 
302 aa  236  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  48.64 
 
 
297 aa  235  8e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  56.62 
 
 
234 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  46.82 
 
 
316 aa  233  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.77 
 
 
350 aa  231  9e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  59.8 
 
 
258 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  45.42 
 
 
303 aa  227  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  47.97 
 
 
308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  45.08 
 
 
496 aa  226  5.0000000000000005e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  51.83 
 
 
238 aa  225  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2958  ABC transporter related protein  47.71 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  53.7 
 
 
242 aa  220  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  45.27 
 
 
309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  49.32 
 
 
299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  48.98 
 
 
299 aa  216  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.76 
 
 
247 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  49.77 
 
 
245 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  52.56 
 
 
237 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  47.14 
 
 
307 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  51.79 
 
 
237 aa  209  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  43.75 
 
 
301 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  44.18 
 
 
300 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  43.33 
 
 
301 aa  202  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  44.44 
 
 
326 aa  199  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1175  ABC transporter related  45.28 
 
 
389 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181845  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  52.53 
 
 
317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>