More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1431 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  100 
 
 		 301 aa  590  1e-167  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  73.36 
 
 		 314 aa  432  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  68.44 
 
 		 319 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  62.63 
 
 		 318 aa  374  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  63.04 
 
 		 315 aa  372  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  62.29 
 
 		 314 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  62.79 
 
 		 306 aa  362  6e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  61.15 
 
 		 317 aa  360  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  60.94 
 
 		 320 aa  360  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  62.95 
 
 		 346 aa  360  2e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  61.87 
 
 		 348 aa  358  5e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  64.9 
 
 		 318 aa  358  8e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  64.65 
 
 		 314 aa  358  9e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  61.87 
 
 		 316 aa  358  9e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  60.8 
 
 		 335 aa  356  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  62.54 
 
 		 306 aa  355  5.999999999999999e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  61.46 
 
 		 309 aa  354  8.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  61.26 
 
 		 368 aa  353  2e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  60.2 
 
 		 355 aa  352  2.9999999999999997e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  58.25 
 
 		 314 aa  352  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  62.63 
 
 		 314 aa  349  3e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  60.26 
 
 		 373 aa  347  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  57.98 
 
 		 312 aa  345  5e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  58.22 
 
 		 310 aa  344  1e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  63.49 
 
 		 304 aa  344  1e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  55.66 
 
 		 361 aa  342  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  59.14 
 
 		 301 aa  342  5e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  58.92 
 
 		 319 aa  341  7e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  59.46 
 
 		 300 aa  341  8e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  59.46 
 
 		 300 aa  341  8e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  59.46 
 
 		 300 aa  341  8e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  60.61 
 
 		 324 aa  340  1e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  60 
 
 		 308 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  59.2 
 
 		 322 aa  339  4e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  59.6 
 
 		 309 aa  336  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  57.86 
 
 		 313 aa  335  5.999999999999999e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  59.53 
 
 		 313 aa  332  4e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  58.17 
 
 		 306 aa  330  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  57.28 
 
 		 318 aa  328  9e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  58.17 
 
 		 313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  59.27 
 
 		 305 aa  320  3e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  56.23 
 
 		 303 aa  317  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 		 328 aa  317  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  54.72 
 
 		 327 aa  315  5e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  58 
 
 		 305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  56 
 
 		 310 aa  312  4.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  56.76 
 
 		 302 aa  309  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  56.19 
 
 		 302 aa  305  8.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  56.54 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  53.24 
 
 		 316 aa  299  3e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  55.22 
 
 		 303 aa  299  4e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  59.12 
 
 		 304 aa  295  6e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  66.38 
 
 		 398 aa  295  6e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  53.38 
 
 		 305 aa  290  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  64.84 
 
 		 252 aa  288  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  52.36 
 
 		 330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  51.69 
 
 		 337 aa  279  5e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  63.13 
 
 		 241 aa  278  8e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  52.92 
 
 		 311 aa  276  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  43.65 
 
 		 330 aa  275  5e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  51.37 
 
 		 311 aa  275  6e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  50.5 
 
 		 330 aa  272  5.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  51.18 
 
 		 298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  62.73 
 
 		 234 aa  261  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  49.65 
 
 		 300 aa  258  6e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  51.18 
 
 		 297 aa  258  9e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  47.8 
 
 		 300 aa  258  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.45 
 
 		 324 aa  256  2e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46 
 
 		 368 aa  256  5e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  50.66 
 
 		 298 aa  255  6e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  49.16 
 
 		 305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.26 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  51.53 
 
 		 314 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  58.72 
 
 		 244 aa  248  9e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  50.7 
 
 		 302 aa  248  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  44.67 
 
 		 457 aa  245  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  58.26 
 
 		 242 aa  238  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  49 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  56.34 
 
 		 238 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  51.19 
 
 		 299 aa  236  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  48.82 
 
 		 297 aa  235  6e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  58.14 
 
 		 237 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  55.56 
 
 		 496 aa  231  8.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  50.51 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  59.3 
 
 		 258 aa  228  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  46.26 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  52.7 
 
 		 245 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  44.26 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.9 
 
 		 350 aa  223  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.29 
 
 		 247 aa  219  3e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  47.18 
 
 		 307 aa  219  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 309 aa  216  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  57.42 
 
 		 237 aa  215  8e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  57.07 
 
 		 317 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  40.92 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0751  ABC transporter related protein  50 
 
 		 251 aa  209  5e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  40.94 
 
 		 302 aa  208  9e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.4 
 
 		 264 aa  206  6e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.330888  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2958  ABC transporter related protein  43.32 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  44.11 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>