More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0751 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0751  ABC transporter related protein  100 
 
 
251 aa  484  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  47.39 
 
 
308 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  47.5 
 
 
244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  50 
 
 
301 aa  209  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  50.7 
 
 
314 aa  208  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  50.23 
 
 
314 aa  206  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  47.53 
 
 
313 aa  206  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  49.3 
 
 
310 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  47.44 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  47.47 
 
 
346 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  47.44 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  47.69 
 
 
398 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  48.53 
 
 
327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  47.44 
 
 
302 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  47.73 
 
 
348 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  48.37 
 
 
300 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  48.37 
 
 
300 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  48.37 
 
 
300 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  46.46 
 
 
241 aa  198  6e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  46.98 
 
 
320 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  48.13 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.78 
 
 
252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.44 
 
 
318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  47.91 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  46.98 
 
 
335 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  45.12 
 
 
355 aa  195  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  45.12 
 
 
312 aa  195  7e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  48.13 
 
 
305 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  46.98 
 
 
310 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  44.12 
 
 
322 aa  192  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  44.84 
 
 
314 aa  192  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  47.66 
 
 
337 aa  191  8e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  48.6 
 
 
318 aa  191  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  45.12 
 
 
309 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  47.91 
 
 
302 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  44.65 
 
 
314 aa  190  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  45.65 
 
 
496 aa  190  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  44.65 
 
 
324 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  47.91 
 
 
318 aa  189  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  48.37 
 
 
304 aa  189  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.26 
 
 
317 aa  189  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  43.93 
 
 
310 aa  188  7e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  44.59 
 
 
306 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  45.33 
 
 
330 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  40.37 
 
 
330 aa  186  2e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  44.65 
 
 
361 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  42.79 
 
 
306 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  47.03 
 
 
313 aa  186  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  47 
 
 
330 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  47.89 
 
 
302 aa  186  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4301  ABC transporter related  50.49 
 
 
401 aa  186  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  47.2 
 
 
303 aa  186  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  45.58 
 
 
245 aa  186  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  46.15 
 
 
258 aa  185  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  46.41 
 
 
305 aa  185  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  42.86 
 
 
314 aa  184  9e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  43.95 
 
 
309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  42.79 
 
 
368 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  44.19 
 
 
373 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  46.26 
 
 
328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  43.72 
 
 
301 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  51.79 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  42.86 
 
 
319 aa  183  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  43.67 
 
 
234 aa  182  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  46.73 
 
 
303 aa  183  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  46.51 
 
 
313 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  44.54 
 
 
242 aa  181  7e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  47.51 
 
 
308 aa  180  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  46.54 
 
 
300 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  44.86 
 
 
305 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.52 
 
 
264 aa  180  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.330888  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  43.26 
 
 
316 aa  180  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4316  ABC transporter related protein  43.43 
 
 
254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.991603  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2047  ABC transporter-related protein  47.91 
 
 
233 aa  178  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  44.86 
 
 
316 aa  178  7e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  50 
 
 
299 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  45.25 
 
 
303 aa  176  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4409  ABC transporter related  47.12 
 
 
231 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.805429  normal  0.364973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  49.1 
 
 
299 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.19 
 
 
319 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  44.54 
 
 
297 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  43.88 
 
 
237 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.53 
 
 
368 aa  172  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  44.13 
 
 
457 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.52 
 
 
324 aa  171  6.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  40.44 
 
 
238 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  40.51 
 
 
300 aa  170  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  45.5 
 
 
314 aa  169  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  42.06 
 
 
311 aa  169  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  43.24 
 
 
298 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  42.06 
 
 
311 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.38 
 
 
350 aa  165  6.9999999999999995e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  47.98 
 
 
317 aa  164  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2408  ABC transporter related  45.37 
 
 
232 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799647  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  43.6 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  45.78 
 
 
237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  41.71 
 
 
305 aa  160  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  43.48 
 
 
316 aa  158  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.7 
 
 
247 aa  157  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2958  ABC transporter related protein  45.63 
 
 
310 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.175509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>