More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5649 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  100 
 
 
305 aa  593  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  75.76 
 
 
330 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  71.67 
 
 
337 aa  409  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  55.67 
 
 
335 aa  322  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  59.21 
 
 
328 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  54.21 
 
 
306 aa  315  6e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  56.42 
 
 
302 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.73 
 
 
317 aa  313  2.9999999999999996e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  54.03 
 
 
316 aa  309  5e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  51.53 
 
 
361 aa  307  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  53.67 
 
 
355 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  53.95 
 
 
318 aa  306  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  56.76 
 
 
310 aa  306  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  55.03 
 
 
302 aa  306  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  55.89 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  53 
 
 
313 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  52.53 
 
 
320 aa  302  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  57.14 
 
 
305 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  56.23 
 
 
300 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  56.23 
 
 
300 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  56.23 
 
 
300 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  53.18 
 
 
314 aa  301  6.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  53.51 
 
 
309 aa  301  6.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  51.96 
 
 
312 aa  301  7.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  52.53 
 
 
313 aa  301  9e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  54.82 
 
 
309 aa  300  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  51.18 
 
 
314 aa  299  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.84 
 
 
318 aa  298  7e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  55.07 
 
 
319 aa  298  8e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  51.18 
 
 
319 aa  297  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  53.54 
 
 
306 aa  298  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  54.88 
 
 
314 aa  297  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  52.36 
 
 
303 aa  294  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  53.36 
 
 
322 aa  294  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  52 
 
 
315 aa  294  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  53.44 
 
 
373 aa  293  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  52.16 
 
 
301 aa  293  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  52.36 
 
 
314 aa  290  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  51.47 
 
 
310 aa  290  1e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  53.38 
 
 
301 aa  290  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  54.97 
 
 
318 aa  289  4e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  52.19 
 
 
324 aa  288  8e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  49.84 
 
 
306 aa  288  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  50.66 
 
 
346 aa  287  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  51.46 
 
 
368 aa  286  4e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  52.48 
 
 
313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  51.97 
 
 
314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  52.81 
 
 
310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  58.05 
 
 
304 aa  283  4.0000000000000003e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  52.56 
 
 
304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  48.04 
 
 
348 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  51.55 
 
 
311 aa  270  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  50.17 
 
 
303 aa  267  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  51.03 
 
 
330 aa  266  4e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  48.99 
 
 
305 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  48.99 
 
 
311 aa  259  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  51.01 
 
 
300 aa  259  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  46.46 
 
 
316 aa  255  6e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  59.62 
 
 
241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.27 
 
 
252 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  59.64 
 
 
244 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  43.14 
 
 
330 aa  252  6e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  56.73 
 
 
398 aa  251  9.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  45.7 
 
 
457 aa  245  6.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  47.3 
 
 
298 aa  245  6.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.44 
 
 
324 aa  245  8e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  45.98 
 
 
327 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.64 
 
 
319 aa  239  4e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  52.91 
 
 
238 aa  235  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.05 
 
 
368 aa  232  6e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  54.34 
 
 
234 aa  231  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  43.29 
 
 
316 aa  227  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  50.42 
 
 
302 aa  227  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  44.03 
 
 
300 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  48.49 
 
 
314 aa  225  6e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  50 
 
 
245 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  53.12 
 
 
305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  53.91 
 
 
237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  52.51 
 
 
258 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  46.74 
 
 
297 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.21 
 
 
350 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.27 
 
 
247 aa  216  4e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  51.58 
 
 
496 aa  216  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  45.48 
 
 
297 aa  215  7e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  53.24 
 
 
242 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  43.55 
 
 
308 aa  212  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  46.64 
 
 
307 aa  212  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  52.38 
 
 
237 aa  212  5.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  49.79 
 
 
303 aa  210  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  47.97 
 
 
299 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  47.77 
 
 
299 aa  209  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  42.47 
 
 
301 aa  208  9e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2408  ABC transporter related  53.88 
 
 
232 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799647  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  41.3 
 
 
298 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  40.73 
 
 
300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  49.07 
 
 
309 aa  198  7.999999999999999e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  45.3 
 
 
311 aa  196  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  53.3 
 
 
317 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  41.02 
 
 
301 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0751  ABC transporter related protein  48.13 
 
 
251 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>