More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1601 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  100 
 
 
299 aa  584  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  95.65 
 
 
299 aa  543  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  72.76 
 
 
297 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  67.59 
 
 
309 aa  371  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  66.55 
 
 
308 aa  354  1e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  62.41 
 
 
298 aa  338  9e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  63.51 
 
 
314 aa  335  5.999999999999999e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  60.88 
 
 
300 aa  326  2.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  59.59 
 
 
303 aa  312  3.9999999999999997e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  70.91 
 
 
242 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  62.08 
 
 
317 aa  302  5.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.29 
 
 
350 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  53.9 
 
 
308 aa  269  5e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  52.72 
 
 
315 aa  260  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.84 
 
 
318 aa  257  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  52.36 
 
 
314 aa  255  5e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  52.86 
 
 
318 aa  254  9e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  50 
 
 
311 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  60.93 
 
 
237 aa  249  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  48.82 
 
 
457 aa  249  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  49.32 
 
 
316 aa  249  5e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48 
 
 
317 aa  248  6e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  50 
 
 
310 aa  247  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.97 
 
 
368 aa  246  3e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  49.83 
 
 
319 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  50.51 
 
 
301 aa  245  6.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  50.99 
 
 
304 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  49.35 
 
 
314 aa  242  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  48.98 
 
 
313 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  49.34 
 
 
306 aa  242  5e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  49.49 
 
 
322 aa  241  9e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  48.12 
 
 
306 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  48.66 
 
 
311 aa  239  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  48.31 
 
 
355 aa  239  5e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  47.04 
 
 
310 aa  239  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  48.67 
 
 
373 aa  239  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  48.05 
 
 
348 aa  239  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  49.5 
 
 
314 aa  238  5.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.8 
 
 
252 aa  239  5.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  46.84 
 
 
320 aa  238  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  48.84 
 
 
346 aa  236  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  56.25 
 
 
398 aa  236  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  47.33 
 
 
328 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  49.34 
 
 
318 aa  235  7e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.21 
 
 
324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  43.87 
 
 
361 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  55.98 
 
 
241 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  46.36 
 
 
335 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  47.26 
 
 
309 aa  233  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  46.41 
 
 
368 aa  233  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  47.8 
 
 
319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  46.76 
 
 
316 aa  232  5e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  49.32 
 
 
300 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  49.32 
 
 
300 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  49.32 
 
 
300 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  50 
 
 
301 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  49.32 
 
 
330 aa  230  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  47.19 
 
 
310 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  48.03 
 
 
298 aa  229  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  48.98 
 
 
309 aa  228  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  48.81 
 
 
303 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  45.89 
 
 
303 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  51.33 
 
 
304 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  46.2 
 
 
313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  44.71 
 
 
314 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  47.77 
 
 
305 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  49.67 
 
 
306 aa  223  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  47.37 
 
 
313 aa  223  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  46.36 
 
 
302 aa  222  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  47.85 
 
 
302 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  45.18 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  47.42 
 
 
300 aa  219  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  56.52 
 
 
337 aa  219  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  45.02 
 
 
312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.14 
 
 
319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  48.3 
 
 
305 aa  219  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  54.75 
 
 
496 aa  218  7.999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  46.1 
 
 
314 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  47.8 
 
 
302 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  47.21 
 
 
330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  55.56 
 
 
244 aa  216  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  54.05 
 
 
245 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  45.72 
 
 
327 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  53.04 
 
 
237 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  46.25 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  50 
 
 
238 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  51.85 
 
 
330 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  54.02 
 
 
258 aa  208  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  51.11 
 
 
234 aa  204  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  41.83 
 
 
305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  45.15 
 
 
297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.13 
 
 
247 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  40.68 
 
 
302 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.38 
 
 
264 aa  194  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.330888  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  42.76 
 
 
307 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0751  ABC transporter related protein  50 
 
 
251 aa  192  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  44.22 
 
 
316 aa  190  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2958  ABC transporter related protein  54.76 
 
 
310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4010  ABC transporter related protein  49.08 
 
 
299 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2125  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  40.94 
 
 
301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>