More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4130 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  100 
 
 		 303 aa  605  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  58.86 
 
 		 335 aa  346  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  62.58 
 
 		 305 aa  345  5e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  60.93 
 
 		 310 aa  345  6e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  56.44 
 
 		 306 aa  333  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  58.86 
 
 		 328 aa  331  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  55.52 
 
 		 320 aa  330  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  58.67 
 
 		 308 aa  323  3e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  56.67 
 
 		 319 aa  322  7e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  56.9 
 
 		 316 aa  321  8e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.19 
 
 		 317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.67 
 
 		 318 aa  314  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  56.25 
 
 		 303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  55.12 
 
 		 306 aa  312  3.9999999999999997e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  56.15 
 
 		 300 aa  311  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  56.15 
 
 		 300 aa  311  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  56.15 
 
 		 300 aa  311  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  51.38 
 
 		 361 aa  311  9e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  52.84 
 
 		 314 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  52.61 
 
 		 312 aa  309  2.9999999999999997e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  56.86 
 
 		 314 aa  309  4e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  54.82 
 
 		 355 aa  305  6e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  57.53 
 
 		 301 aa  305  6e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  55.22 
 
 		 301 aa  305  9.000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  54.3 
 
 		 322 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  52.46 
 
 		 346 aa  302  4.0000000000000003e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  50.84 
 
 		 313 aa  301  6.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  53.51 
 
 		 324 aa  301  6.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  52.48 
 
 		 318 aa  296  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  52.82 
 
 		 309 aa  296  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  51.51 
 
 		 315 aa  295  5e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  51.85 
 
 		 313 aa  295  6e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  53.31 
 
 		 348 aa  295  7e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  52.68 
 
 		 302 aa  295  8e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  56.19 
 
 		 304 aa  295  9e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  50.84 
 
 		 310 aa  294  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  54.49 
 
 		 304 aa  293  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  54.88 
 
 		 305 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  53.77 
 
 		 373 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  50.17 
 
 		 314 aa  290  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  51.47 
 
 		 313 aa  290  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  49.16 
 
 		 319 aa  289  4e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  54.3 
 
 		 318 aa  289  5.0000000000000004e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  51.51 
 
 		 309 aa  287  1e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  52 
 
 		 314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  51.48 
 
 		 368 aa  285  7e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  52.16 
 
 		 302 aa  282  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  53.8 
 
 		 306 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  50.99 
 
 		 314 aa  280  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  50.49 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  50.17 
 
 		 305 aa  278  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  49.49 
 
 		 330 aa  277  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  50.16 
 
 		 327 aa  277  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.83 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  50.34 
 
 		 316 aa  276  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  52.38 
 
 		 311 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  49.5 
 
 		 337 aa  269  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  49.17 
 
 		 330 aa  269  5e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  57.66 
 
 		 398 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  52.23 
 
 		 311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.32 
 
 		 319 aa  264  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  53.54 
 
 		 314 aa  261  6.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  60.37 
 
 		 252 aa  257  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  59.07 
 
 		 241 aa  255  6e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  49.83 
 
 		 300 aa  253  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  48.63 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  48.48 
 
 		 298 aa  249  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  61.03 
 
 		 234 aa  246  4e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  59.17 
 
 		 242 aa  243  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  47.8 
 
 		 298 aa  242  5e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  50 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  40.58 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  49.32 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  47.64 
 
 		 300 aa  239  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  44.3 
 
 		 305 aa  235  6e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  46.44 
 
 		 303 aa  234  9e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  48.31 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.6 
 
 		 350 aa  232  7.000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.74 
 
 		 368 aa  231  9e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  57.87 
 
 		 244 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  45.55 
 
 		 457 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  47.47 
 
 		 297 aa  229  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  48.46 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  55.35 
 
 		 258 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  48.81 
 
 		 299 aa  219  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  41.67 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  48.65 
 
 		 317 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  55.09 
 
 		 237 aa  215  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  49.54 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.55 
 
 		 247 aa  214  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  50.93 
 
 		 496 aa  212  4.9999999999999996e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  50.23 
 
 		 238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  44.41 
 
 		 302 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  43.92 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  39.87 
 
 		 304 aa  202  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  53.05 
 
 		 237 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  43.92 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2408  ABC transporter related  53.39 
 
 		 232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799647  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.86 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.330888  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  42.71 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>