More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4341 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  100 
 
 		 368 aa  724    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  79.53 
 
 		 373 aa  529  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  69.94 
 
 		 317 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  67.74 
 
 		 306 aa  415  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  69.54 
 
 		 355 aa  409  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  64.61 
 
 		 310 aa  394  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  65.36 
 
 		 300 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  63.28 
 
 		 312 aa  380  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  65.36 
 
 		 300 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  65.36 
 
 		 300 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  61.34 
 
 		 322 aa  375  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  61.18 
 
 		 319 aa  371  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  56.6 
 
 		 315 aa  359  5e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  61.56 
 
 		 301 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  61.26 
 
 		 301 aa  353  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  59.87 
 
 		 320 aa  353  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  55.72 
 
 		 348 aa  349  4e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  59.08 
 
 		 324 aa  348  7e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  58.55 
 
 		 335 aa  346  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  57.63 
 
 		 316 aa  344  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  59.54 
 
 		 314 aa  340  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  58.55 
 
 		 310 aa  340  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  59.16 
 
 		 306 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  56 
 
 		 346 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  55.56 
 
 		 314 aa  335  7e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.41 
 
 		 318 aa  332  4e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  56.72 
 
 		 306 aa  332  5e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  56.5 
 
 		 318 aa  332  8e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  57.05 
 
 		 314 aa  332  9e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  54.08 
 
 		 361 aa  331  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  54.23 
 
 		 313 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  58.88 
 
 		 328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  57.95 
 
 		 305 aa  324  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  57.61 
 
 		 304 aa  323  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  54.69 
 
 		 314 aa  323  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  53.9 
 
 		 313 aa  312  4.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  53.99 
 
 		 313 aa  311  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  52.6 
 
 		 319 aa  310  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  52.96 
 
 		 314 aa  309  5.9999999999999995e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  55.78 
 
 		 302 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  54.55 
 
 		 303 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  53.5 
 
 		 308 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  56.72 
 
 		 305 aa  306  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  52.3 
 
 		 318 aa  306  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  55.92 
 
 		 310 aa  305  7e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  51.99 
 
 		 309 aa  305  9.000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  53.35 
 
 		 309 aa  301  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  55.37 
 
 		 302 aa  299  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  50.64 
 
 		 327 aa  288  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  51.46 
 
 		 305 aa  286  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  53.06 
 
 		 311 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 		 330 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  53.4 
 
 		 311 aa  280  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  48.99 
 
 		 316 aa  280  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  46.04 
 
 		 398 aa  279  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  51.48 
 
 		 303 aa  277  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  49.19 
 
 		 337 aa  276  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  47.44 
 
 		 457 aa  274  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  54.25 
 
 		 304 aa  272  6e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  49.01 
 
 		 298 aa  272  8.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  50.49 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.31 
 
 		 324 aa  269  5e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  59.72 
 
 		 252 aa  269  7e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.93 
 
 		 368 aa  266  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  49.5 
 
 		 300 aa  266  5.999999999999999e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  48.5 
 
 		 330 aa  263  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  58.82 
 
 		 241 aa  263  4e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.81 
 
 		 319 aa  256  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  47.68 
 
 		 297 aa  249  6e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  46.42 
 
 		 305 aa  243  3.9999999999999997e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  58.17 
 
 		 244 aa  241  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  55.24 
 
 		 234 aa  239  5.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  56.25 
 
 		 496 aa  237  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  47.32 
 
 		 308 aa  236  4e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  54.85 
 
 		 238 aa  235  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  45.64 
 
 		 300 aa  235  9e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  58.33 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  44.74 
 
 		 316 aa  233  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  44.97 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  46.53 
 
 		 297 aa  227  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  44.44 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  53.85 
 
 		 242 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.24 
 
 		 350 aa  226  6e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  43.77 
 
 		 298 aa  225  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.07 
 
 		 247 aa  225  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  44.19 
 
 		 303 aa  224  3e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  46.31 
 
 		 309 aa  222  8e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  52.88 
 
 		 245 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  46.41 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  45.75 
 
 		 299 aa  216  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  52.63 
 
 		 237 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  52.53 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2895  ABC transporter related  43.71 
 
 		 326 aa  205  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  0.0275551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  48.65 
 
 		 237 aa  203  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  42.9 
 
 		 307 aa  204  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2958  ABC transporter related protein  44.3 
 
 		 310 aa  202  7e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2408  ABC transporter related  52.4 
 
 		 232 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799647  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  35.79 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  41.58 
 
 		 304 aa  199  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  34.87 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>