More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2016 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  100 
 
 		 313 aa  617  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  67 
 
 		 313 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  62.82 
 
 		 320 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  68.01 
 
 		 306 aa  390  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  64.98 
 
 		 314 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  64.9 
 
 		 309 aa  384  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  59.94 
 
 		 313 aa  372  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  62.63 
 
 		 335 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  59.29 
 
 		 318 aa  364  1e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  60.58 
 
 		 319 aa  360  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  61.2 
 
 		 316 aa  360  2e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  59.4 
 
 		 315 aa  353  2.9999999999999997e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  61.29 
 
 		 318 aa  352  4e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  60.4 
 
 		 324 aa  349  3e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  59.03 
 
 		 310 aa  349  4e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  60.4 
 
 		 314 aa  345  6e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  58.39 
 
 		 306 aa  340  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  60.27 
 
 		 328 aa  339  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  57.89 
 
 		 346 aa  338  5.9999999999999996e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  57.14 
 
 		 348 aa  338  5.9999999999999996e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  57.43 
 
 		 319 aa  338  7e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  59.53 
 
 		 301 aa  338  8e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.7 
 
 		 317 aa  335  5e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  55.13 
 
 		 314 aa  334  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  58.2 
 
 		 314 aa  334  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  56.03 
 
 		 312 aa  332  5e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  55.74 
 
 		 355 aa  331  9e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  60.4 
 
 		 305 aa  331  9e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  53.92 
 
 		 361 aa  330  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  57 
 
 		 300 aa  328  8e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  57 
 
 		 300 aa  328  8e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  57 
 
 		 300 aa  328  8e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  57.58 
 
 		 309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  56.49 
 
 		 308 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  57.05 
 
 		 310 aa  326  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  56.07 
 
 		 310 aa  324  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  56.11 
 
 		 373 aa  324  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  53.9 
 
 		 368 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  57.43 
 
 		 314 aa  321  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  55.22 
 
 		 318 aa  313  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  53.51 
 
 		 301 aa  306  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  52.91 
 
 		 327 aa  306  3e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  54.25 
 
 		 306 aa  305  6e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  53 
 
 		 305 aa  305  9.000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  54.82 
 
 		 304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  52.19 
 
 		 337 aa  302  6.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  53.85 
 
 		 302 aa  301  9e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  51.72 
 
 		 322 aa  295  6e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  52.33 
 
 		 303 aa  295  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  50.17 
 
 		 330 aa  293  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  51.85 
 
 		 303 aa  291  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  53.02 
 
 		 302 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  54.18 
 
 		 305 aa  286  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  51.71 
 
 		 316 aa  280  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  44.24 
 
 		 330 aa  272  5.000000000000001e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  60.47 
 
 		 252 aa  271  9e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  60.28 
 
 		 241 aa  268  7e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  61.54 
 
 		 398 aa  265  8e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  48.99 
 
 		 330 aa  265  8.999999999999999e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  49.48 
 
 		 311 aa  265  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.44 
 
 		 324 aa  263  2e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  51.52 
 
 		 304 aa  261  8.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  48.97 
 
 		 311 aa  260  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.8 
 
 		 319 aa  258  6e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.15 
 
 		 368 aa  255  6e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  46.55 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  48.53 
 
 		 308 aa  246  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  46.1 
 
 		 305 aa  246  4.9999999999999997e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  44.78 
 
 		 457 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  46.13 
 
 		 298 aa  242  7e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  54.93 
 
 		 234 aa  235  6e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  54.15 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  47.97 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  45.79 
 
 		 300 aa  232  8.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  45.79 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  54.63 
 
 		 244 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  45.82 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  46.08 
 
 		 297 aa  226  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  44.75 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.05 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  51.8 
 
 		 496 aa  222  7e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  47.19 
 
 		 299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  46.2 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  44.48 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  42.62 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.15 
 
 		 247 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  43.84 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  42.23 
 
 		 309 aa  210  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  50.91 
 
 		 242 aa  209  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  51.85 
 
 		 237 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  42.42 
 
 		 300 aa  206  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  46.36 
 
 		 245 aa  205  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  50.7 
 
 		 258 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  41.5 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  41.86 
 
 		 310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1175  ABC transporter related  41.54 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  42.72 
 
 		 317 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  40.74 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.47 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.330888  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  41.36 
 
 		 302 aa  193  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>