More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2234 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  100 
 
 
304 aa  569  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  66.89 
 
 
328 aa  368  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  64.33 
 
 
310 aa  360  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  57.91 
 
 
303 aa  334  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.19 
 
 
317 aa  330  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  59.8 
 
 
302 aa  325  6e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  59.6 
 
 
308 aa  325  9e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  60 
 
 
306 aa  324  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  59 
 
 
302 aa  322  4e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  58.45 
 
 
355 aa  321  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.19 
 
 
318 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  62.96 
 
 
305 aa  318  6e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  58.25 
 
 
301 aa  318  9e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  59.06 
 
 
300 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  59.06 
 
 
300 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  59.06 
 
 
300 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  55.41 
 
 
315 aa  313  2.9999999999999996e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  56.33 
 
 
314 aa  312  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  59.12 
 
 
301 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  54.84 
 
 
346 aa  311  6.999999999999999e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  57.38 
 
 
310 aa  310  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  55.52 
 
 
335 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  56.86 
 
 
314 aa  310  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  56.29 
 
 
316 aa  310  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  58.33 
 
 
314 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  56.48 
 
 
322 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  59.53 
 
 
319 aa  308  8e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  56.17 
 
 
306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  51.52 
 
 
361 aa  305  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  56.44 
 
 
314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  56.95 
 
 
306 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  58.05 
 
 
305 aa  302  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  53.85 
 
 
312 aa  301  9e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  56.33 
 
 
324 aa  301  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  56.15 
 
 
318 aa  300  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  56.19 
 
 
303 aa  299  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  58 
 
 
318 aa  298  7e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  54.15 
 
 
320 aa  298  8e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  55.34 
 
 
373 aa  297  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  57.62 
 
 
304 aa  297  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  52.96 
 
 
309 aa  296  3e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  54.52 
 
 
330 aa  293  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  54.25 
 
 
368 aa  293  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  56.16 
 
 
311 aa  293  3e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  52.49 
 
 
313 aa  290  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  51.33 
 
 
319 aa  289  4e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  56.52 
 
 
337 aa  289  4e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  66.51 
 
 
252 aa  289  4e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  54.82 
 
 
348 aa  287  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  56.11 
 
 
310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  52.48 
 
 
313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  55.48 
 
 
309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  49.83 
 
 
314 aa  283  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  53.61 
 
 
311 aa  281  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  61.42 
 
 
398 aa  280  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  51.34 
 
 
313 aa  278  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  65.89 
 
 
241 aa  276  4e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  51.85 
 
 
316 aa  275  6e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  54.79 
 
 
330 aa  273  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  52.82 
 
 
305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  52.07 
 
 
300 aa  267  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.34 
 
 
319 aa  265  8e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  48.22 
 
 
327 aa  262  4.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.31 
 
 
368 aa  260  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  44.7 
 
 
330 aa  260  2e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.95 
 
 
324 aa  259  4e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  47.6 
 
 
457 aa  257  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  64.65 
 
 
244 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  52.46 
 
 
314 aa  251  7e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  48.31 
 
 
305 aa  249  4e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  50.34 
 
 
302 aa  246  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  48.45 
 
 
298 aa  241  7.999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  51.55 
 
 
297 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  56.54 
 
 
238 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  58.6 
 
 
234 aa  236  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  55.96 
 
 
245 aa  236  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  47.32 
 
 
300 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  49.66 
 
 
308 aa  235  6e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  57.21 
 
 
496 aa  233  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  48.29 
 
 
297 aa  232  5e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  51.33 
 
 
299 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  46.91 
 
 
298 aa  230  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  51 
 
 
299 aa  228  9e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  57.94 
 
 
258 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  57.08 
 
 
242 aa  227  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  48.8 
 
 
309 aa  226  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  46.08 
 
 
303 aa  224  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  57.21 
 
 
237 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.14 
 
 
350 aa  223  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  47.24 
 
 
316 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  56.5 
 
 
237 aa  220  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.34 
 
 
247 aa  220  3e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  48.7 
 
 
317 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  48.32 
 
 
307 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2958  ABC transporter related protein  47.08 
 
 
310 aa  216  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  45.27 
 
 
310 aa  207  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  44.41 
 
 
301 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  42.91 
 
 
302 aa  203  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  44.33 
 
 
301 aa  202  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  44.03 
 
 
311 aa  202  7e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>