More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1738 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  100 
 
 
303 aa  591  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  67.79 
 
 
328 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  61.33 
 
 
310 aa  358  5e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.26 
 
 
317 aa  335  7e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  56.57 
 
 
306 aa  324  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.82 
 
 
318 aa  322  4e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  57.05 
 
 
316 aa  320  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  56 
 
 
301 aa  318  6e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  56.86 
 
 
300 aa  318  9e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  56.86 
 
 
300 aa  318  9e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  56.86 
 
 
300 aa  318  9e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  56.23 
 
 
301 aa  317  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  57.91 
 
 
304 aa  317  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  58.92 
 
 
305 aa  315  4e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  55.18 
 
 
335 aa  314  9e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  53.64 
 
 
315 aa  314  9.999999999999999e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  54.82 
 
 
322 aa  312  3.9999999999999997e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  53.77 
 
 
314 aa  310  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  54.73 
 
 
355 aa  311  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  56.29 
 
 
314 aa  309  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  54.64 
 
 
308 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  54.55 
 
 
368 aa  308  8e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  53.18 
 
 
318 aa  306  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  57.19 
 
 
314 aa  306  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  54.93 
 
 
346 aa  306  3e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  54.85 
 
 
306 aa  306  4.0000000000000004e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  56.23 
 
 
302 aa  305  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  56.52 
 
 
303 aa  305  7e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  52.96 
 
 
373 aa  304  9.000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  55.52 
 
 
319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  53.77 
 
 
324 aa  304  2.0000000000000002e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  54.85 
 
 
320 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  51.83 
 
 
310 aa  296  3e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  56.19 
 
 
309 aa  296  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  52.36 
 
 
305 aa  294  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  54.39 
 
 
309 aa  294  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  53.87 
 
 
314 aa  293  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  55 
 
 
304 aa  293  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  55.7 
 
 
318 aa  292  4e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  53.29 
 
 
306 aa  292  5e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  50.76 
 
 
361 aa  292  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  51.97 
 
 
302 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  50.99 
 
 
316 aa  290  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  54.1 
 
 
305 aa  290  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  53.33 
 
 
337 aa  288  8e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  61.69 
 
 
398 aa  287  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  51.51 
 
 
314 aa  287  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  50.97 
 
 
348 aa  287  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  52.33 
 
 
313 aa  286  4e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  48.85 
 
 
312 aa  285  5e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.16 
 
 
319 aa  281  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  52.25 
 
 
311 aa  279  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  49.84 
 
 
319 aa  276  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  48.82 
 
 
313 aa  276  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  50.87 
 
 
311 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  48.99 
 
 
330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  49.5 
 
 
310 aa  269  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  49.35 
 
 
330 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  62.21 
 
 
252 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  60.93 
 
 
241 aa  263  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  42.9 
 
 
330 aa  261  1e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  45.85 
 
 
457 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  47.42 
 
 
313 aa  260  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  47.12 
 
 
305 aa  259  4e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  48.1 
 
 
300 aa  258  8e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  46.46 
 
 
298 aa  256  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.36 
 
 
368 aa  256  4e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.28 
 
 
324 aa  255  7e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  46.58 
 
 
327 aa  255  7e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  60.75 
 
 
234 aa  252  6e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  61.21 
 
 
244 aa  252  7e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  46.46 
 
 
297 aa  246  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.49 
 
 
350 aa  236  3e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  45.49 
 
 
302 aa  235  8e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  59.31 
 
 
258 aa  232  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  47.28 
 
 
314 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  44.3 
 
 
316 aa  229  6e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  45.55 
 
 
297 aa  228  9e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  44.71 
 
 
298 aa  227  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  45.27 
 
 
300 aa  226  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  52.8 
 
 
245 aa  225  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  45.05 
 
 
303 aa  221  8e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  51.16 
 
 
238 aa  221  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  45.92 
 
 
308 aa  220  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  53.7 
 
 
237 aa  218  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  44.9 
 
 
309 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  44.3 
 
 
307 aa  215  9e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  50.23 
 
 
496 aa  213  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  53.67 
 
 
242 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  47.28 
 
 
299 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  45.89 
 
 
299 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.64 
 
 
247 aa  212  5.999999999999999e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  52.11 
 
 
237 aa  211  7.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2958  ABC transporter related protein  43.93 
 
 
310 aa  209  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  43 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  44.26 
 
 
317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  37.04 
 
 
310 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  38.1 
 
 
303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  37.76 
 
 
303 aa  198  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  37.41 
 
 
331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>