More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1436 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  100 
 
 
308 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.77 
 
 
317 aa  343  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  60 
 
 
301 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  59.93 
 
 
310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  59.03 
 
 
319 aa  335  5e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  59.73 
 
 
328 aa  334  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.34 
 
 
318 aa  330  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  57.42 
 
 
355 aa  328  7e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  57.23 
 
 
314 aa  325  6e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  57.14 
 
 
306 aa  324  9e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  57.62 
 
 
335 aa  325  9e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  59.93 
 
 
306 aa  322  5e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  59.45 
 
 
316 aa  321  7e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  58.42 
 
 
314 aa  322  7e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  56.49 
 
 
313 aa  321  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  55.59 
 
 
310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  57.86 
 
 
320 aa  319  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  57.24 
 
 
316 aa  318  6e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  57.81 
 
 
304 aa  316  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  58.05 
 
 
300 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  58.05 
 
 
300 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  58.05 
 
 
300 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  57.29 
 
 
318 aa  314  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  54.81 
 
 
346 aa  311  7.999999999999999e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  57.24 
 
 
302 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  55.7 
 
 
302 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  53.87 
 
 
322 aa  310  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  54.9 
 
 
312 aa  308  5.9999999999999995e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  54.64 
 
 
303 aa  308  5.9999999999999995e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  52.76 
 
 
361 aa  308  9e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  57.53 
 
 
309 aa  307  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  53.5 
 
 
368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  58.67 
 
 
303 aa  305  8.000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  54.4 
 
 
373 aa  305  8.000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  52.84 
 
 
313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  55.89 
 
 
305 aa  304  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  56.9 
 
 
301 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  59.6 
 
 
304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  54.25 
 
 
318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  56.81 
 
 
305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  56.77 
 
 
305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  56.52 
 
 
314 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  68.04 
 
 
398 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  54.78 
 
 
313 aa  302  5.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  55.3 
 
 
348 aa  300  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  53.49 
 
 
309 aa  300  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  55.34 
 
 
314 aa  299  5e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  54.93 
 
 
315 aa  298  7e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  52.17 
 
 
314 aa  296  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  65.61 
 
 
252 aa  292  4e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  53.51 
 
 
310 aa  292  5e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  56.29 
 
 
306 aa  291  7e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  55.1 
 
 
311 aa  291  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  50.32 
 
 
319 aa  286  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  53.18 
 
 
324 aa  286  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  52.35 
 
 
330 aa  285  5.999999999999999e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  54.61 
 
 
337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.67 
 
 
368 aa  283  4.0000000000000003e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  54.61 
 
 
311 aa  280  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  64.65 
 
 
241 aa  278  8e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  56.31 
 
 
314 aa  276  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  48.45 
 
 
457 aa  276  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  52.22 
 
 
330 aa  275  7e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.53 
 
 
319 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  48.4 
 
 
327 aa  272  5.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  51.21 
 
 
300 aa  271  7e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.31 
 
 
324 aa  271  1e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  52.05 
 
 
298 aa  267  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  51.9 
 
 
298 aa  266  4e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  51.54 
 
 
300 aa  263  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  53.9 
 
 
299 aa  259  4e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  61.21 
 
 
234 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  62.96 
 
 
244 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  52.04 
 
 
297 aa  258  9e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  49.49 
 
 
305 aa  255  8e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  49.19 
 
 
309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  53.9 
 
 
299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  51.54 
 
 
308 aa  252  7e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  60.09 
 
 
242 aa  251  9.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  48.63 
 
 
303 aa  249  5e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  41.21 
 
 
330 aa  248  1e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  50.17 
 
 
297 aa  246  4e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  56.94 
 
 
496 aa  243  3.9999999999999997e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  52.19 
 
 
317 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  57.87 
 
 
237 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  48.8 
 
 
302 aa  239  5e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  56.34 
 
 
238 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.28 
 
 
247 aa  235  8e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.6 
 
 
350 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  56.74 
 
 
258 aa  228  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  49.79 
 
 
245 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  48.16 
 
 
307 aa  225  7e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  42.47 
 
 
302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  45.64 
 
 
316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2958  ABC transporter related protein  46.73 
 
 
310 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  43.52 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0751  ABC transporter related protein  47.39 
 
 
251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  54.93 
 
 
237 aa  210  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4316  ABC transporter related protein  52.47 
 
 
254 aa  209  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.991603  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  36.45 
 
 
302 aa  206  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>