More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25840 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0778  ABC transporter related protein  50.37 
 
 		 976 aa  748    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0296  ABC transporter related  50.05 
 
 		 949 aa  740    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.11249 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 944 aa  1869    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  62.18 
 
 		 968 aa  1095    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  50.27 
 
 		 897 aa  760    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0256  ABC transporter related  50.48 
 
 		 948 aa  757    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0574193 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  51.33 
 
 		 1010 aa  794    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  52.07 
 
 		 876 aa  691    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1356  ABC transporter related protein  47.83 
 
 		 814 aa  647    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  48.17 
 
 		 868 aa  708    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  49.31 
 
 		 866 aa  677    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 302 aa  233  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  42.76 
 
 		 300 aa  214  7.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  42.36 
 
 		 311 aa  213  9e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  41.55 
 
 		 331 aa  213  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  39.74 
 
 		 299 aa  212  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.55 
 
 		 331 aa  211  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  41.55 
 
 		 331 aa  211  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  45.9 
 
 		 318 aa  210  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  41.55 
 
 		 303 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  41.55 
 
 		 303 aa  210  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01670  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.95 
 
 		 329 aa  208  5e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.194324 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  40.88 
 
 		 303 aa  206  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  40.54 
 
 		 303 aa  205  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  40.2 
 
 		 303 aa  204  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3425  ABC transporter related protein  46.56 
 
 		 340 aa  204  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458573  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  39.19 
 
 		 310 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0751  ABC transporter related  45.07 
 
 		 342 aa  202  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  38.98 
 
 		 320 aa  199  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  43.52 
 
 		 301 aa  198  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  35.81 
 
 		 302 aa  198  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  45.88 
 
 		 310 aa  197  8.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  43.2 
 
 		 457 aa  196  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  44.56 
 
 		 304 aa  196  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1080  ABC transporter-related protein  39.19 
 
 		 300 aa  197  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  40.39 
 
 		 305 aa  195  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  41.86 
 
 		 304 aa  195  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  43.37 
 
 		 326 aa  194  8e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3933  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 		 300 aa  193  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  48.83 
 
 		 346 aa  192  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0386  ABC transporter related  42.81 
 
 		 322 aa  191  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0607  ABC transporter related  42.5 
 
 		 347 aa  190  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000713126 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  39.09 
 
 		 306 aa  190  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1410  ABC transporter, ATP-binding protein  40.28 
 
 		 300 aa  190  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.47 
 
 		 324 aa  189  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  38.11 
 
 		 318 aa  189  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1448  ABC transporter, ATP-binding protein  38.7 
 
 		 300 aa  188  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000281318 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2895  ABC transporter related  48.12 
 
 		 326 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  0.0275551 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.05 
 
 		 368 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  40.88 
 
 		 304 aa  187  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02610  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.46 
 
 		 341 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1292  ABC transporter related protein  42.06 
 
 		 351 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  41.98 
 
 		 305 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  43.36 
 
 		 305 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3301  ABC transporter related protein  48.56 
 
 		 306 aa  185  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.377119  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  40.78 
 
 		 305 aa  185  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1517  ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 		 300 aa  185  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1274  ABC transporter ATP-binding protein  38.51 
 
 		 300 aa  185  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  38.51 
 
 		 300 aa  185  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1248  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  38.36 
 
 		 300 aa  185  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1281  ABC transporter related  39.37 
 
 		 300 aa  185  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278405  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1161  ABC transporter related  43.93 
 
 		 307 aa  184  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  41.49 
 
 		 305 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1475  ABC transporter, ATP-binding protein  38.51 
 
 		 300 aa  184  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2704  ABC transporter related  39.48 
 
 		 312 aa  184  7e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  37.25 
 
 		 305 aa  184  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  38.69 
 
 		 301 aa  184  9.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  43.58 
 
 		 311 aa  183  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  39 
 
 		 320 aa  183  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  37.25 
 
 		 305 aa  182  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1156  ABC transporter related protein  43.83 
 
 		 323 aa  183  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  hitchhiker  0.000104476 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  48.28 
 
 		 302 aa  182  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  46.4 
 
 		 258 aa  182  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.44 
 
 		 309 aa  182  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  39.37 
 
 		 305 aa  181  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  36.91 
 
 		 305 aa  181  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  36.91 
 
 		 305 aa  181  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  36.91 
 
 		 305 aa  181  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  39.41 
 
 		 373 aa  182  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.56 
 
 		 319 aa  181  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2234  ABC transporter related  41.37 
 
 		 323 aa  181  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.686469  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  40.6 
 
 		 368 aa  181  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  39.33 
 
 		 322 aa  181  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  41 
 
 		 305 aa  181  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.24 
 
 		 309 aa  181  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  41.32 
 
 		 304 aa  180  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.85 
 
 		 317 aa  180  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.91 
 
 		 309 aa  179  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4839  ABC transporter related protein  42.67 
 
 		 322 aa  179  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  38.11 
 
 		 309 aa  179  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  38.28 
 
 		 300 aa  179  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  45.06 
 
 		 398 aa  179  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  46.35 
 
 		 311 aa  178  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.19 
 
 		 318 aa  178  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  49.55 
 
 		 237 aa  178  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  46.62 
 
 		 330 aa  177  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.58 
 
 		 350 aa  177  8e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  38.14 
 
 		 355 aa  176  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  44.84 
 
 		 234 aa  177  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  45.02 
 
 		 346 aa  176  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>