More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5514 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  51.69 
 
 		 1010 aa  826    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  47.14 
 
 		 897 aa  704    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0778  ABC transporter related protein  51.95 
 
 		 976 aa  753    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  50.11 
 
 		 876 aa  690    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0296  ABC transporter related  50.26 
 
 		 949 aa  760    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.11249 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  62.39 
 
 		 944 aa  1098    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  100 
 
 		 968 aa  1920    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  51.98 
 
 		 866 aa  734    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0256  ABC transporter related  50.89 
 
 		 948 aa  769    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0574193 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  46.32 
 
 		 868 aa  713    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1356  ABC transporter related protein  49.1 
 
 		 814 aa  504  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  42.27 
 
 		 302 aa  215  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  41.29 
 
 		 311 aa  210  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01670  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44 
 
 		 329 aa  207  6e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.194324 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 		 331 aa  201  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.72 
 
 		 331 aa  201  7e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  39.72 
 
 		 331 aa  200  9e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  39.72 
 
 		 303 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  39.72 
 
 		 303 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  40.07 
 
 		 303 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  39.86 
 
 		 303 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  39.52 
 
 		 303 aa  197  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  38.74 
 
 		 320 aa  197  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3425  ABC transporter related protein  44.41 
 
 		 340 aa  197  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458573  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  38.16 
 
 		 310 aa  197  9e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  37.21 
 
 		 299 aa  196  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0751  ABC transporter related  42 
 
 		 342 aa  195  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  45.19 
 
 		 310 aa  193  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  42.14 
 
 		 304 aa  193  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3301  ABC transporter related protein  46.76 
 
 		 306 aa  192  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.377119  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4839  ABC transporter related protein  44 
 
 		 322 aa  192  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  39.53 
 
 		 305 aa  191  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  43.09 
 
 		 318 aa  191  5.999999999999999e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  42.19 
 
 		 301 aa  191  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  39.19 
 
 		 305 aa  191  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  38.51 
 
 		 305 aa  190  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  44.22 
 
 		 311 aa  190  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  42.09 
 
 		 457 aa  188  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  38.51 
 
 		 305 aa  189  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1448  ABC transporter, ATP-binding protein  38.41 
 
 		 300 aa  189  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000281318 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  43.88 
 
 		 311 aa  188  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  38.18 
 
 		 305 aa  188  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  41.18 
 
 		 300 aa  187  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  40.33 
 
 		 304 aa  187  9e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  44.18 
 
 		 346 aa  187  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0607  ABC transporter related  42.06 
 
 		 347 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000713126 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  37.87 
 
 		 305 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1248  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  38.06 
 
 		 300 aa  186  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  37.87 
 
 		 305 aa  185  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1517  ABC transporter, ATP-binding protein  38.06 
 
 		 300 aa  185  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3933  ABC transporter, ATP-binding protein  37.88 
 
 		 300 aa  185  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1080  ABC transporter-related protein  38.01 
 
 		 300 aa  186  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  42.57 
 
 		 300 aa  185  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  37.16 
 
 		 305 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1274  ABC transporter ATP-binding protein  38.06 
 
 		 300 aa  184  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  37.54 
 
 		 305 aa  184  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  38.06 
 
 		 300 aa  184  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  37.54 
 
 		 305 aa  184  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1475  ABC transporter, ATP-binding protein  38.06 
 
 		 300 aa  184  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 305 aa  184  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  48.94 
 
 		 302 aa  184  8.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  37.54 
 
 		 305 aa  184  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.69 
 
 		 368 aa  183  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  34.45 
 
 		 302 aa  182  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1410  ABC transporter, ATP-binding protein  37.54 
 
 		 300 aa  182  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1281  ABC transporter related  37.98 
 
 		 300 aa  182  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278405  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1292  ABC transporter related protein  48.11 
 
 		 351 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  39.22 
 
 		 373 aa  182  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2234  ABC transporter related  45.54 
 
 		 323 aa  180  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.686469  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  42.62 
 
 		 326 aa  179  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1161  ABC transporter related  45.13 
 
 		 307 aa  179  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0386  ABC transporter related  44.31 
 
 		 322 aa  179  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  48.56 
 
 		 330 aa  179  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.92 
 
 		 324 aa  177  6e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2895  ABC transporter related  46.05 
 
 		 326 aa  177  7e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  0.0275551 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  38.01 
 
 		 316 aa  177  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02610  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.15 
 
 		 341 aa  177  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  35.74 
 
 		 304 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  37 
 
 		 316 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  45.66 
 
 		 238 aa  175  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  38.95 
 
 		 373 aa  176  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  37.91 
 
 		 368 aa  175  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1156  ABC transporter related protein  42.19 
 
 		 323 aa  174  5.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  hitchhiker  0.000104476 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1206  ABC transporter related  41.33 
 
 		 302 aa  174  5.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.406945  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  47.19 
 
 		 237 aa  174  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.64 
 
 		 317 aa  173  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  44.59 
 
 		 258 aa  173  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6513  ABC transporter related  42.86 
 
 		 409 aa  172  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0552468 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  39.52 
 
 		 307 aa  172  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  37.41 
 
 		 318 aa  172  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.24 
 
 		 299 aa  172  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  36.6 
 
 		 309 aa  172  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  36.95 
 
 		 322 aa  171  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  35.9 
 
 		 337 aa  171  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.26 
 
 		 319 aa  171  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  35.22 
 
 		 355 aa  171  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 		 309 aa  170  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1376  ABC transporter ATP-binding protein  37.78 
 
 		 268 aa  170  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0958944  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0249  ABC transporter related  40.26 
 
 		 336 aa  170  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  46.85 
 
 		 245 aa  170  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>