More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0458 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  100 
 
 
309 aa  606  9.999999999999999e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  78.96 
 
 
309 aa  484  1e-136  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  61.44 
 
 
316 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  60.2 
 
 
316 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  61.31 
 
 
337 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  53.11 
 
 
318 aa  325  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3123  ABC transporter related  57.1 
 
 
313 aa  320  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  48.08 
 
 
340 aa  293  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  45.83 
 
 
315 aa  292  6e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  42.38 
 
 
301 aa  242  6e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  41.18 
 
 
303 aa  229  5e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  38.31 
 
 
356 aa  223  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  40.45 
 
 
305 aa  222  6e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  37.29 
 
 
303 aa  219  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  38.36 
 
 
310 aa  218  8.999999999999998e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  37.54 
 
 
319 aa  215  8e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  42.14 
 
 
302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  39.86 
 
 
300 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  33.01 
 
 
308 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.64 
 
 
312 aa  207  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  37.81 
 
 
327 aa  206  4e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  46.98 
 
 
250 aa  206  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  39.47 
 
 
314 aa  205  7e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  36.09 
 
 
313 aa  205  8e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0419  ABC transporter related  38.82 
 
 
314 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00150824  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  36.75 
 
 
305 aa  203  3e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  43.2 
 
 
311 aa  203  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  35.76 
 
 
313 aa  203  3e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  38.24 
 
 
329 aa  202  4e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1526  ABC transporter related protein  36.93 
 
 
305 aa  203  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  35.88 
 
 
311 aa  202  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  37.46 
 
 
313 aa  202  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2644  ABC transporter related  37.38 
 
 
334 aa  202  8e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  39.53 
 
 
332 aa  201  9e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  35.76 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  40.86 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  41.41 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  37.38 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  39.33 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  37.79 
 
 
314 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2631  ABC transporter related  35.1 
 
 
301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1333  ABC transporter related  38.71 
 
 
315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.573564  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  38.56 
 
 
308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  37.17 
 
 
299 aa  200  3e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  35.92 
 
 
303 aa  200  3e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  39.33 
 
 
300 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  35.48 
 
 
321 aa  199  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  33.99 
 
 
325 aa  199  5e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  38.03 
 
 
318 aa  199  6e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.67 
 
 
316 aa  199  6e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  43.75 
 
 
259 aa  199  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  40.39 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  44.14 
 
 
279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1706  ABC transporter related  33 
 
 
311 aa  196  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  37.91 
 
 
346 aa  196  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.59 
 
 
317 aa  197  3e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.07 
 
 
319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  37.83 
 
 
331 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1761  ABC transporter related  38.69 
 
 
350 aa  196  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.298772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  36.86 
 
 
316 aa  196  6e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  37.83 
 
 
316 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  38.44 
 
 
373 aa  194  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  38.93 
 
 
320 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3301  ABC transporter related protein  42.33 
 
 
306 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.377119  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  32.67 
 
 
311 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  38.96 
 
 
306 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  39.64 
 
 
322 aa  193  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  38.91 
 
 
301 aa  193  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  41.42 
 
 
331 aa  192  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  35.83 
 
 
317 aa  192  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  44.44 
 
 
249 aa  192  5e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  33 
 
 
308 aa  192  5e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  37.99 
 
 
310 aa  192  7e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  38.93 
 
 
322 aa  192  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  46.23 
 
 
316 aa  192  8e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  35.43 
 
 
310 aa  192  9e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  44.75 
 
 
304 aa  191  9e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 
312 aa  191  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  39.74 
 
 
241 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  36.33 
 
 
298 aa  191  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  36.18 
 
 
335 aa  191  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.74 
 
 
309 aa  191  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  37.46 
 
 
339 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.26 
 
 
317 aa  191  1e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.36 
 
 
348 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  37.3 
 
 
309 aa  190  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  39.03 
 
 
316 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  38.41 
 
 
339 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  35.02 
 
 
335 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  38.78 
 
 
316 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  42.6 
 
 
317 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0227  ABC transporter related protein  35.29 
 
 
304 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  38.67 
 
 
312 aa  190  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3629  ABC transporter related  38.03 
 
 
311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00141619  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  36.69 
 
 
304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  39.34 
 
 
310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  39.26 
 
 
305 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  38.11 
 
 
304 aa  189  4e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  42.24 
 
 
326 aa  189  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  36.54 
 
 
298 aa  189  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>