More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0277 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
316 aa  639    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  99.37 
 
 
331 aa  634    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  85.23 
 
 
310 aa  519  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  56.11 
 
 
306 aa  334  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  57.43 
 
 
301 aa  318  7e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  56.68 
 
 
301 aa  315  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  56.41 
 
 
301 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  55.41 
 
 
301 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  45.79 
 
 
298 aa  249  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  42.91 
 
 
299 aa  238  6.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  43.77 
 
 
308 aa  238  8e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 
322 aa  236  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  42.21 
 
 
303 aa  233  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  40.38 
 
 
310 aa  229  7e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  40.38 
 
 
310 aa  229  7e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  44.14 
 
 
303 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  43.1 
 
 
327 aa  226  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2566  ABC transporter related  44.52 
 
 
310 aa  226  4e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.2512  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  42.67 
 
 
313 aa  225  8e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4914  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.1 
 
 
316 aa  219  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000429083 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20180  NosF protein  45.9 
 
 
304 aa  219  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.423742  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  40.59 
 
 
338 aa  217  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  40.2 
 
 
304 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1736  nitrous oxide reductase maturation ATPase NosF  45.25 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  41.41 
 
 
318 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  38.83 
 
 
303 aa  210  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  41.69 
 
 
310 aa  209  5e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  39.31 
 
 
302 aa  208  8e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  36.99 
 
 
344 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  39.52 
 
 
325 aa  205  8e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4062  ABC transporter related  41.23 
 
 
318 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  39.46 
 
 
348 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4174  ABC transporter related  41.23 
 
 
318 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  38.85 
 
 
348 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  39.19 
 
 
348 aa  204  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  38.85 
 
 
332 aa  202  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4448  ABC transporter related  36.88 
 
 
327 aa  202  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  39.93 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  41.89 
 
 
304 aa  199  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  47.11 
 
 
309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  47.48 
 
 
304 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  47.48 
 
 
304 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  43.64 
 
 
300 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1371  copper ATP-binding ABC transporter protein  41.06 
 
 
314 aa  196  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  37.12 
 
 
316 aa  195  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  46.91 
 
 
747 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  37.83 
 
 
309 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0490  ABC transporter-related protein  35.86 
 
 
302 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0356  ABC transporter-related protein  38.28 
 
 
309 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3869  ABC transporter related  35.51 
 
 
345 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3994  ABC transporter related  42.98 
 
 
345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  35.95 
 
 
316 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0511  ABC transporter related  37.62 
 
 
302 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  34.74 
 
 
337 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  41.82 
 
 
318 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  37.04 
 
 
302 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  42.79 
 
 
335 aa  170  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  42.8 
 
 
310 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  41.53 
 
 
339 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  41.53 
 
 
339 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  37.58 
 
 
373 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  38.2 
 
 
309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2165  ABC transporter related protein  40.17 
 
 
308 aa  165  8e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  43.66 
 
 
332 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  39.83 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3411  ABC transporter related  44.29 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0395155  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  41.94 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  40.93 
 
 
303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  34.32 
 
 
315 aa  162  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  42.93 
 
 
318 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  42.93 
 
 
318 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  41.33 
 
 
310 aa  162  8.000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  41.38 
 
 
339 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3123  ABC transporter related  37.17 
 
 
313 aa  162  9e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
305 aa  161  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  36.53 
 
 
297 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  43.53 
 
 
340 aa  161  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  36 
 
 
299 aa  161  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  40 
 
 
315 aa  161  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.46 
 
 
944 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  35.85 
 
 
332 aa  160  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  42.93 
 
 
318 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  38.74 
 
 
313 aa  160  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  39.82 
 
 
305 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  41.23 
 
 
292 aa  159  5e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  40.62 
 
 
310 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  31.37 
 
 
300 aa  159  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  38.98 
 
 
307 aa  159  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1761  ABC transporter related  38.84 
 
 
350 aa  159  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.298772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  41.47 
 
 
968 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  36.74 
 
 
298 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.09 
 
 
339 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1559  ABC transporter related  45.93 
 
 
299 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0776966  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  43.66 
 
 
310 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  39.19 
 
 
313 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  44.39 
 
 
258 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  40.74 
 
 
307 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  41.74 
 
 
303 aa  156  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  43.41 
 
 
339 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.72 
 
 
309 aa  156  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>