More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2566 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2566  ABC transporter related  100 
 
 		 310 aa  599  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.2512  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  56.15 
 
 		 308 aa  323  3e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  50.81 
 
 		 327 aa  298  9e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  51.69 
 
 		 322 aa  297  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  48.04 
 
 		 304 aa  288  6e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  48.47 
 
 		 303 aa  287  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  45.48 
 
 		 303 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  46.23 
 
 		 310 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1736  nitrous oxide reductase maturation ATPase NosF  54.61 
 
 		 304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  46.82 
 
 		 310 aa  256  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20180  NosF protein  54.73 
 
 		 304 aa  255  8e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.423742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  46.51 
 
 		 338 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  45.79 
 
 		 318 aa  249  3e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  42.47 
 
 		 313 aa  248  9e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 		 331 aa  245  6e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  45.3 
 
 		 310 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  45.3 
 
 		 310 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  44.52 
 
 		 316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4448  ABC transporter related  42.76 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  45.15 
 
 		 306 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  42.58 
 
 		 344 aa  235  6e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  47.67 
 
 		 301 aa  235  9e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1371  copper ATP-binding ABC transporter protein  45.33 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4174  ABC transporter related  45 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4062  ABC transporter related  45 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4914  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.43 
 
 		 316 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000429083 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  44.92 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  44.63 
 
 		 301 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  50.66 
 
 		 304 aa  225  7e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  50.66 
 
 		 309 aa  225  7e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  50.66 
 
 		 304 aa  225  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  40 
 
 		 325 aa  225  9e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  43.62 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  41.84 
 
 		 302 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0490  ABC transporter-related protein  41.44 
 
 		 302 aa  223  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  50.66 
 
 		 747 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  43.24 
 
 		 332 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  44.67 
 
 		 299 aa  222  6e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  42.62 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  42.61 
 
 		 348 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  42.61 
 
 		 348 aa  219  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  42.96 
 
 		 348 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  43.62 
 
 		 301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0511  ABC transporter related  45.12 
 
 		 302 aa  215  7e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3869  ABC transporter related  43.52 
 
 		 345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3994  ABC transporter related  44.63 
 
 		 345 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  36.55 
 
 		 303 aa  208  8e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  37.42 
 
 		 316 aa  206  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0356  ABC transporter-related protein  48 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  42.24 
 
 		 309 aa  202  7e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  38.98 
 
 		 305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  41.36 
 
 		 332 aa  196  3e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  39.8 
 
 		 337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  40.59 
 
 		 309 aa  195  8.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  40.56 
 
 		 373 aa  193  4e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  38.49 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  39.2 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  45 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  39.33 
 
 		 310 aa  186  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  44.55 
 
 		 318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  45.91 
 
 		 318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  38.54 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  37.17 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  35.65 
 
 		 305 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  42.4 
 
 		 313 aa  179  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0227  ABC transporter related protein  38.7 
 
 		 304 aa  179  7e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  45.37 
 
 		 287 aa  179  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  39.68 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  40.69 
 
 		 326 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  39.02 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  41.47 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  40.33 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  41.47 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  41.16 
 
 		 310 aa  177  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  36.7 
 
 		 310 aa  176  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  41.07 
 
 		 300 aa  175  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  33.67 
 
 		 300 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  39.06 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2142  ABC-type transport system, ATPase component  40.86 
 
 		 247 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0133824  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  40 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  38.53 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  40.56 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  37.46 
 
 		 318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  35.53 
 
 		 308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3123  ABC transporter related  37.58 
 
 		 313 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4399  ABC transporter related  44.02 
 
 		 327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104293  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  39.17 
 
 		 310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  40.09 
 
 		 315 aa  172  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  40.59 
 
 		 304 aa  172  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4068  ABC transporter related  41.18 
 
 		 325 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0298  ABC transporter related protein  41.03 
 
 		 367 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  34.91 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  37.33 
 
 		 309 aa  170  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  40.57 
 
 		 314 aa  170  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  42.79 
 
 		 310 aa  169  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  42.38 
 
 		 309 aa  169  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1642  ABC transporter related protein  44.2 
 
 		 323 aa  169  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  40 
 
 		 326 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2089  ABC transporter related  42.04 
 
 		 288 aa  169  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>