More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0496 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  100 
 
 
348 aa  705    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  94.83 
 
 
348 aa  663    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  95.98 
 
 
348 aa  675    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  73.49 
 
 
332 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  58.58 
 
 
344 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3994  ABC transporter related  61.59 
 
 
345 aa  358  6e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3869  ABC transporter related  61.27 
 
 
345 aa  358  6e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  46.71 
 
 
300 aa  272  6e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0490  ABC transporter-related protein  47.16 
 
 
302 aa  271  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0511  ABC transporter related  49.01 
 
 
302 aa  268  7e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  46.28 
 
 
325 aa  268  8e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  47.37 
 
 
302 aa  266  5e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4448  ABC transporter related  44.77 
 
 
327 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0356  ABC transporter-related protein  47.35 
 
 
309 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  42.16 
 
 
322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20180  NosF protein  45.48 
 
 
304 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.423742  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1736  nitrous oxide reductase maturation ATPase NosF  45.83 
 
 
304 aa  225  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  42.27 
 
 
308 aa  224  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  41.92 
 
 
303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  40.91 
 
 
327 aa  215  7e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
304 aa  212  7e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  39.46 
 
 
301 aa  212  9e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  39.8 
 
 
301 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  37.8 
 
 
303 aa  210  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  38.97 
 
 
310 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  38.96 
 
 
313 aa  209  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2566  ABC transporter related  42.96 
 
 
310 aa  206  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.2512  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  41.91 
 
 
310 aa  206  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.46 
 
 
331 aa  206  6e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.46 
 
 
316 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  39.6 
 
 
301 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  38.85 
 
 
303 aa  203  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  40.69 
 
 
298 aa  202  9e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4914  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.74 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000429083 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  39.49 
 
 
338 aa  195  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  37.41 
 
 
301 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  35.35 
 
 
306 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  38.28 
 
 
299 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  36.69 
 
 
310 aa  190  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  36.69 
 
 
310 aa  190  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1371  copper ATP-binding ABC transporter protein  38.06 
 
 
314 aa  189  8e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  35.67 
 
 
318 aa  188  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4062  ABC transporter related  39.53 
 
 
318 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4174  ABC transporter related  39.53 
 
 
318 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  36.95 
 
 
304 aa  175  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  35.12 
 
 
309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  40.26 
 
 
747 aa  173  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  42.22 
 
 
316 aa  172  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  34.92 
 
 
304 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  34.92 
 
 
304 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  42.2 
 
 
309 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  41.33 
 
 
309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  41.55 
 
 
315 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  31.17 
 
 
308 aa  166  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  34.77 
 
 
298 aa  163  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 
356 aa  162  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  35.21 
 
 
295 aa  160  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  38.91 
 
 
332 aa  160  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  38.01 
 
 
279 aa  160  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  31.23 
 
 
299 aa  160  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  31.23 
 
 
299 aa  160  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  33.66 
 
 
302 aa  159  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  36.4 
 
 
337 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  41.04 
 
 
258 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  39.19 
 
 
259 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  38.94 
 
 
316 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3287  ABC transporter related protein  40.72 
 
 
261 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  31.38 
 
 
300 aa  157  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3411  ABC transporter related  34.97 
 
 
342 aa  156  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0395155  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  37.73 
 
 
296 aa  155  7e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  34.33 
 
 
301 aa  155  8e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  40.58 
 
 
306 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  39.34 
 
 
250 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2050  ABC transporter related  39.09 
 
 
236 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.492019  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  39.23 
 
 
326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  32.66 
 
 
306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  33.77 
 
 
307 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  38.6 
 
 
318 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  37.24 
 
 
261 aa  153  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  35.67 
 
 
332 aa  153  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  32.2 
 
 
316 aa  153  5e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2235  ABC transporter related protein  38.84 
 
 
334 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461241  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.28 
 
 
305 aa  152  7e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.12 
 
 
247 aa  152  7e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1462  ABC transporter related  36.73 
 
 
252 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.936224  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  36.73 
 
 
292 aa  152  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  32.68 
 
 
308 aa  151  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  37.97 
 
 
303 aa  151  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  33.44 
 
 
305 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  37.39 
 
 
317 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2142  ABC-type transport system, ATPase component  37.61 
 
 
247 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0133824  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  34.42 
 
 
321 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  37.39 
 
 
257 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  37.27 
 
 
309 aa  150  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2556  ABC transporter related protein  39.47 
 
 
272 aa  149  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3387  ABC transporter related  39.09 
 
 
323 aa  149  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4068  ABC transporter related  39.47 
 
 
325 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0089  ABC transporter related  37.73 
 
 
237 aa  149  5e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  40.49 
 
 
284 aa  149  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  31.72 
 
 
326 aa  149  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>