More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0187 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  100 
 
 		 299 aa  591  1e-168  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  42.09 
 
 		 300 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  42.42 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  43.24 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 		 300 aa  249  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  41.75 
 
 		 300 aa  248  7e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  41.75 
 
 		 300 aa  248  8e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  41.08 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  45.89 
 
 		 307 aa  246  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  43.24 
 
 		 299 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  40.74 
 
 		 300 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  47.74 
 
 		 303 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  41.69 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  41.14 
 
 		 300 aa  236  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  45.05 
 
 		 295 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  47.9 
 
 		 303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  46.6 
 
 		 320 aa  230  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  43.34 
 
 		 305 aa  221  9e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  45.07 
 
 		 293 aa  218  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  43.62 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1905  ABC transporter related  47.46 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.256972 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06310  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.43 
 
 		 323 aa  210  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.52931  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3449  ABC transporter related protein  46.18 
 
 		 325 aa  209  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.102969 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36180  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.44 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3003  ABC transporter related  41.95 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000662652  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0760  ABC transporter related  38.82 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  42.36 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  42.57 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  40.21 
 
 		 329 aa  199  6e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  41.72 
 
 		 285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1638  ABC transporter related protein  44.07 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  42 
 
 		 301 aa  195  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  42.46 
 
 		 280 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  45.05 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  41.41 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  42.32 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  35.4 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  41.45 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1940  ABC transporter related  41.53 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  39.33 
 
 		 322 aa  189  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  35.05 
 
 		 301 aa  188  7e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  41.88 
 
 		 321 aa  188  8e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1742  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.76 
 
 		 319 aa  186  6e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0557624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  35.43 
 
 		 304 aa  185  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0289  ABC transporter related  40.13 
 
 		 343 aa  185  8e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.22367 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.44 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  41.86 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  40.2 
 
 		 324 aa  183  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  41.5 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  39.73 
 
 		 302 aa  182  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  36.79 
 
 		 303 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  33.88 
 
 		 310 aa  180  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16220  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.97 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4304  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  39.55 
 
 		 314 aa  180  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  41.06 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0496  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.69 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.516721  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  37.38 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  40.6 
 
 		 300 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  39.33 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  35.95 
 
 		 339 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  30.79 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  34.39 
 
 		 294 aa  179  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  35.95 
 
 		 339 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  38.8 
 
 		 302 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1077  ABC transporter related protein  43.48 
 
 		 309 aa  179  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0807489  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.46 
 
 		 279 aa  178  8e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  38.38 
 
 		 308 aa  178  8e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0115  ABC transporter related  38.28 
 
 		 302 aa  178  8e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.478521  normal  0.0830163 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  34.92 
 
 		 293 aa  177  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  41.32 
 
 		 331 aa  177  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  38.69 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  39.2 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  35.29 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.79 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  40.4 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  40.88 
 
 		 314 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  39.14 
 
 		 338 aa  177  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.42 
 
 		 320 aa  176  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  36.1 
 
 		 339 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.89 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  38.89 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  31.96 
 
 		 283 aa  176  4e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.8 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1472  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 		 371 aa  176  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.269585 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  38.69 
 
 		 309 aa  175  7e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  38.59 
 
 		 324 aa  175  9e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  35.64 
 
 		 315 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.62 
 
 		 343 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  39.67 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  37.05 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_461  ABC-type transport system, ATPase component  37.05 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00512826  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.75 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.74 
 
 		 324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0115  ABC transporter related  34.33 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  31.37 
 
 		 312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  38.08 
 
 		 309 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  31.72 
 
 		 327 aa  172  5e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  43.91 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  37.46 
 
 		 341 aa  172  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>