More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02230 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_02230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 320 aa  613  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  41.98 
 
 		 303 aa  202  7e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  39.86 
 
 		 320 aa  192  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  38.98 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  42.27 
 
 		 329 aa  186  4e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  39.16 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  41.2 
 
 		 298 aa  178  9e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  40.14 
 
 		 301 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  38.31 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3449  ABC transporter related protein  42.32 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.102969 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0289  ABC transporter related  38.46 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1905  ABC transporter related  41.34 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.256972 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  40.49 
 
 		 299 aa  169  7e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1940  ABC transporter related  40.67 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  39.04 
 
 		 295 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  36.48 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  38.8 
 
 		 302 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  39.66 
 
 		 306 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  39.86 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  39.86 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  39.93 
 
 		 300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16220  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.19 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4304  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3003  ABC transporter related  38.75 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000662652  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  39.33 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  39.53 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  37.75 
 
 		 319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  37.46 
 
 		 293 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0760  ABC transporter related  35 
 
 		 326 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  40.74 
 
 		 317 aa  162  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  31.35 
 
 		 300 aa  162  7e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0345  ABC transporter related  45.28 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0599235  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  32.65 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  32.89 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  33.22 
 
 		 300 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1638  ABC transporter related protein  38.91 
 
 		 299 aa  159  9e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  33.22 
 
 		 305 aa  158  9e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  31 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  36.89 
 
 		 741 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  36.42 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  37.04 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  39.33 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  38.51 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  40.34 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  32.3 
 
 		 300 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  45.16 
 
 		 289 aa  157  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  32.88 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  31.91 
 
 		 300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  32.3 
 
 		 300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  40.83 
 
 		 308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  44.24 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  31.65 
 
 		 294 aa  155  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  34.85 
 
 		 315 aa  155  7e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  32.29 
 
 		 300 aa  155  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  43.26 
 
 		 310 aa  155  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  31.62 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  31 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  41.3 
 
 		 276 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  32.79 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  42.39 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  44.34 
 
 		 284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  38.51 
 
 		 319 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  42.27 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36180  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.75 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  41.82 
 
 		 313 aa  152  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  42.27 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  38.64 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  36.57 
 
 		 339 aa  151  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0115  ABC transporter related  35.25 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.478521  normal  0.0830163 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  43.6 
 
 		 301 aa  151  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  41.55 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  36.44 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.98 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  37.98 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  40.61 
 
 		 328 aa  149  4e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  36.61 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  38.39 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  37.09 
 
 		 303 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1351  ABC transporter related  36.84 
 
 		 320 aa  149  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  37.95 
 
 		 341 aa  149  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  33.11 
 
 		 304 aa  149  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  35.79 
 
 		 305 aa  149  9e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2112  ABC transporter related protein  38.12 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0163  ABC transporter, ATP-binding protein  40.61 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  33.84 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.33 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54604  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  32.91 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  39.92 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0342  ABC transporter related  40.61 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.568895  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01020  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.74 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  33.22 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0617  ABC transporter related  37.12 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  37.16 
 
 		 295 aa  147  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  38.97 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1906  ABC transporter related protein  40.65 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  34.23 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  38.87 
 
 		 312 aa  146  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  32.12 
 
 		 326 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06310  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.36 
 
 		 323 aa  145  9e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.52931  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  36.21 
 
 		 756 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  36.43 
 
 		 308 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>