More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0345 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0345  ABC transporter related  100 
 
 		 302 aa  583  1e-166  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0599235  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  36.36 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.28 
 
 		 320 aa  161  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  32.43 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  42.33 
 
 		 308 aa  156  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  40.28 
 
 		 302 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1940  ABC transporter related  39.66 
 
 		 306 aa  155  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  36.88 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  43.38 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  35.29 
 
 		 320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  31.99 
 
 		 300 aa  152  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  32.55 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  39.82 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  31.99 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3497  ABC transporter related protein  35.59 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  31.65 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  39.38 
 
 		 310 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1668  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 329 aa  149  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0326508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  39.38 
 
 		 310 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  38.19 
 
 		 295 aa  149  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  32.43 
 
 		 300 aa  149  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  36.65 
 
 		 305 aa  149  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  38.94 
 
 		 309 aa  149  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  32.55 
 
 		 300 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3003  ABC transporter related  37.67 
 
 		 309 aa  149  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000662652  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  40 
 
 		 307 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  38.77 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0760  ABC transporter related  34.14 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  30.74 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  36.46 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  31.77 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0289  ABC transporter related  34.46 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  38.3 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  39.91 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  39.72 
 
 		 315 aa  146  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.12 
 
 		 304 aa  145  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  40.18 
 
 		 319 aa  145  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  32.21 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  40.09 
 
 		 313 aa  144  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  40.34 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  35.81 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1638  ABC transporter related protein  39.59 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  31.54 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  39.53 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  40 
 
 		 314 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0195  ABC transporter related  37.73 
 
 		 263 aa  143  4e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  38.81 
 
 		 338 aa  142  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  37.85 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  38.1 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  33.33 
 
 		 256 aa  140  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  40.85 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  34.2 
 
 		 305 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  37.74 
 
 		 302 aa  139  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  40.27 
 
 		 284 aa  139  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  40.37 
 
 		 313 aa  139  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  40.91 
 
 		 304 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0115  ABC transporter related  34.35 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.478521  normal  0.0830163 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  42.96 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  39.81 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  35.23 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  33.77 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  41.01 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  32.25 
 
 		 316 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3449  ABC transporter related protein  41.35 
 
 		 325 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.102969 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  40.37 
 
 		 301 aa  135  9e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  39.11 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  34.71 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36180  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.88 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1905  ABC transporter related  40.65 
 
 		 300 aa  134  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.256972 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  35.35 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  39.17 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01020  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.6 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  33.18 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  38.53 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  34.62 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2112  ABC transporter related protein  35 
 
 		 275 aa  133  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  37.68 
 
 		 322 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  39.19 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  32.39 
 
 		 254 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  41.12 
 
 		 317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  36.79 
 
 		 303 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  35.5 
 
 		 256 aa  132  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.2 
 
 		 316 aa  132  7.999999999999999e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06310  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.85 
 
 		 323 aa  132  7.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.52931  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  35.21 
 
 		 304 aa  132  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  37.04 
 
 		 299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  34.93 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  36.33 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  37.61 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  37.61 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3711  ABC transporter related  35.14 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  36.17 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16220  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.33 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4304  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  37.91 
 
 		 300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  37.16 
 
 		 304 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  34.62 
 
 		 301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  37.67 
 
 		 330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  35.09 
 
 		 315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  39.41 
 
 		 374 aa  129  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  36.07 
 
 		 353 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>