More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1905 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1905  ABC transporter related  100 
 
 
300 aa  572  1.0000000000000001e-162  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.256972 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  36.08 
 
 
300 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  36.43 
 
 
300 aa  210  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  36.43 
 
 
300 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  36.43 
 
 
300 aa  210  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  35.74 
 
 
300 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  41.64 
 
 
303 aa  208  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  43.51 
 
 
298 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  48.14 
 
 
299 aa  206  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 
300 aa  206  5e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  35.74 
 
 
300 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  35.52 
 
 
300 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  35.05 
 
 
300 aa  202  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  35.52 
 
 
299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  35.52 
 
 
300 aa  199  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  42.01 
 
 
295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  42.05 
 
 
320 aa  192  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3003  ABC transporter related  43.12 
 
 
309 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000662652  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  37.11 
 
 
307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1940  ABC transporter related  41.25 
 
 
306 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1638  ABC transporter related protein  44.53 
 
 
299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  40.29 
 
 
305 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36180  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.8 
 
 
311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0760  ABC transporter related  39.62 
 
 
326 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  38.03 
 
 
303 aa  179  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  40.14 
 
 
293 aa  175  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.2 
 
 
320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3449  ABC transporter related protein  40.42 
 
 
325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.102969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  41.48 
 
 
329 aa  172  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  39.93 
 
 
308 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06310  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.86 
 
 
323 aa  170  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.52931  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.41 
 
 
304 aa  168  9e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  40.48 
 
 
308 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  40 
 
 
300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  39.25 
 
 
301 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  37.37 
 
 
319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  37.21 
 
 
309 aa  165  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  38.13 
 
 
302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  41.56 
 
 
311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  48.7 
 
 
284 aa  163  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  37.12 
 
 
306 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.12 
 
 
321 aa  160  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160218  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  37.21 
 
 
310 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  37.45 
 
 
319 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  37.21 
 
 
310 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  43.54 
 
 
280 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0144  ABC transporter related protein  44.12 
 
 
300 aa  160  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  36.88 
 
 
310 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  38.21 
 
 
322 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  38.31 
 
 
322 aa  159  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0289  ABC transporter related  40.95 
 
 
343 aa  159  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  38.41 
 
 
289 aa  158  9e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.65 
 
 
286 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  35.79 
 
 
308 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  37.87 
 
 
309 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16220  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.11 
 
 
323 aa  157  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4304  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  42.4 
 
 
333 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1895  ABC transporter related  40.07 
 
 
343 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  42.65 
 
 
285 aa  156  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  46.6 
 
 
301 aa  156  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  44.29 
 
 
290 aa  156  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  49.24 
 
 
276 aa  156  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  38.51 
 
 
330 aa  156  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  44.29 
 
 
282 aa  156  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  36.08 
 
 
302 aa  156  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  39.39 
 
 
339 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  40.48 
 
 
324 aa  155  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  42.79 
 
 
321 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  39.79 
 
 
324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  45.1 
 
 
374 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  43.13 
 
 
299 aa  153  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  39.07 
 
 
310 aa  153  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1407  ABC transporter related  29.82 
 
 
299 aa  153  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.815122  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0115  ABC transporter related  39.81 
 
 
302 aa  153  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.478521  normal  0.0830163 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1380  ABC transporter related  29.82 
 
 
299 aa  153  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00611293  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2802  ABC transporter related  43.15 
 
 
312 aa  152  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474892  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0886  ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 
291 aa  152  7e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00203373  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  39.11 
 
 
301 aa  152  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  43.72 
 
 
314 aa  152  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3299  ABC transporter related protein  41.38 
 
 
342 aa  151  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  41.2 
 
 
314 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.36 
 
 
339 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1293  ABC transporter ATP-binding protein  29.89 
 
 
293 aa  150  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0233393  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  38.18 
 
 
312 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4839  ABC transporter related protein  47.29 
 
 
314 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3497  ABC transporter related protein  42.15 
 
 
323 aa  149  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.32 
 
 
343 aa  149  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  38.52 
 
 
301 aa  149  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  43.75 
 
 
317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01020  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.23 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  33.78 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  40.68 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  40.7 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2364  ABC transporter related  39.58 
 
 
327 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0021349  normal  0.0168897 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  35.61 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0096  putative ATP-binding component of a transport system  34.47 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.546673  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  43.37 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0673  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.27 
 
 
338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  41.33 
 
 
319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>